forester/java/src/org/forester/clade_analysis/Prefix.java

   1
   2 package org.forester.clade_analysis;
   3
   4 import java.math.BigDecimal;
   5 import java.text.DecimalFormat;
   6
   7 public final class Prefix {
   8
   9     private final static DecimalFormat df = new DecimalFormat( "0.0###" );
  10     private final String               _prefix;
  11     private final BigDecimal           _confidence;
  12     private final String               _separator;
  13     private final String               _first;
  14
  15     public Prefix( final String prefix, final String confidence, final String separator ) {
  16         _prefix = prefix;
  17         _confidence = new BigDecimal( confidence );
  18         _separator = separator;
  19         if ( _prefix.indexOf( _separator ) < 0 ) {
  20             _first = _prefix;
  21         }
  22         else {
  23             _first = _prefix.substring( 0, _prefix.indexOf( _separator ) );
  24         }
  25     }
  26
  27     public Prefix( final String prefix, final double confidence, final String separator ) {
  28         _prefix = prefix;
  29         _confidence = new BigDecimal( confidence );
  30         _separator = separator;
  31         if ( _prefix.indexOf( _separator ) < 0 ) {
  32             _first = _prefix;
  33         }
  34         else {
  35             _first = _prefix.substring( 0, _prefix.indexOf( _separator ) );
  36         }
  37     }
  38
  39     public  String getPrefix() {
  40         return _prefix;
  41     }
  42
  43     public  String getPrefixFirstElement() {
  44         return _first;
  45     }
  46
  47     public double getConfidence() {
  48         return _confidence.doubleValue();
  49     }
  50
  51     @Override
  52     public String toString() {
  53         return getPrefix() + ": " + df.format( getConfidence() );
  54     }
  55 }