clean up
[jalview.git] / forester / java / src / org / forester / go / GoRelationship.java
1 // $Id:
2 // FORESTER -- software libraries and applications
3 // for evolutionary biology research and applications.
4 //
5 // Copyright (C) 2008-2009 Christian M. Zmasek
6 // Copyright (C) 2008-2009 Burnham Institute for Medical Research
7 // All rights reserved
8 //
9 // This library is free software; you can redistribute it and/or
10 // modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
11 // License as published by the Free Software Foundation; either
12 // version 2.1 of the License, or (at your option) any later version.
13 //
14 // This library is distributed in the hope that it will be useful,
15 // but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16 // MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU
17 // Lesser General Public License for more details.
18 //
19 // You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20 // License along with this library; if not, write to the Free Software
21 // Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA
22 //
23 // Contact: phylosoft @ gmail . com
24 // WWW: www.phylosoft.org/forester
25
26 package org.forester.go;
27
28 public interface GoRelationship extends Comparable<GoRelationship> {
29
30     public static final String PART_OF_STR              = "part_of";
31     public static final String REGULATES_STR            = "regulates";
32     public static final String NEGATIVELY_REGULATES_STR = "negatively_regulates";
33     public static final String POSITIVELY_REGULATES_STR = "positively_regulates";
34
35     public GoId getGoId();
36
37     public Type getType();
38
39     public static enum Type {
40         PART_OF, REGULATES, NEGATIVELY_REGULATES, POSITIVELY_REGULATES;
41     }
42 }