forester/java/src/org/forester/protein/Domain.java

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  23 //
  24 // Contact: phylosoft @ gmail . com
  25 // WWW: www.phylosoft.org/forester
  26
  27 package org.forester.protein;
  28
  29 import org.forester.go.GoId;
  30
  31 public interface Domain extends Comparable<Domain> {
  32
  33     public void addGoId( GoId go_id );
  34
  35     public DomainId getDomainId();
  36
  37     public int getLength();
  38
  39     public int getFrom();
  40
  41     public GoId getGoId( int i );
  42
  43     public short getNumber();
  44
  45     public int getNumberOfGoIds();
  46
  47     public double getPerDomainEvalue();
  48
  49     public double getPerDomainScore();
  50
  51     public double getPerSequenceEvalue();
  52
  53     public double getPerSequenceScore();
  54
  55     public int getTo();
  56
  57     public short getTotalCount();
  58 }