forester/java/src/org/forester/protein/Domain.java

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  23 //
  24 // Contact: phylosoft @ gmail . com
  25 // WWW: https://sites.google.com/site/cmzmasek/home/software/forester
  26
  27 package org.forester.protein;
  28
  29 public interface Domain extends Comparable<Domain> {
  30
  31     // ^^  public void addGoId( GoId go_id );
  32     public String getDomainId();
  33
  34     public int getLength();
  35
  36     public int getFrom();
  37
  38     // ^^   public GoId getGoId( int i );
  39     public short getNumber();
  40
  41     // ^^  public int getNumberOfGoIds();
  42     public double getPerDomainEvalue();
  43
  44     public double getPerDomainScore();
  45
  46     public double getPerSequenceEvalue();
  47
  48     public double getPerSequenceScore();
  49
  50     public int getTo();
  51
  52     public short getTotalCount();
  53 }