forester/java/src/org/forester/sdi/GSDII.java

   1 \r
   2 package org.forester.sdi;\r
   3 \r
   4 import java.util.List;\r
   5 import java.util.Set;\r
   6 import java.util.SortedSet;\r
   7 \r
   8 import org.forester.phylogeny.PhylogenyNode;\r
   9 import org.forester.sdi.SDIutil.TaxonomyComparisonBase;\r
  10 \r
  11 public interface GSDII {\r
  12 \r
  13     public abstract Set<PhylogenyNode> getMappedExternalSpeciesTreeNodes();\r
  14 \r
  15     public abstract SortedSet<String> getReMappedScientificNamesFromGeneTree();\r
  16 \r
  17     public abstract int getSpeciationsSum();\r
  18 \r
  19     public abstract List<PhylogenyNode> getStrippedExternalGeneTreeNodes();\r
  20 \r
  21     public abstract List<PhylogenyNode> getStrippedSpeciesTreeNodes();\r
  22 \r
  23     public abstract TaxonomyComparisonBase getTaxCompBase();\r
  24 }