forester/ruby/scripts/mv_slinks.rb

   1
   2 NEW_DIR = '/home/czmasek/WORK/GENOME_HMMPFAM/HMMSCAN3_no_bias_250/'
   3 OLD_DIR = '/home/czmasek/WORK/GENOME_HMMPFAM/HMMSCAN30b3_no_bias_240/'
   4
   5 Dir.foreach('.') { |f|
   6   if File.symlink?( f )
   7      link = File.readlink( f )
   8      puts f + ' -> ' + link
   9
  10      link =~ /\/([^\/]+)\/([^\/]+)\.hmmscan30b3_240/
  11      group = $1
  12      core_name = $2
  13      puts '  => ' + group + ' / ' + core_name
  14      new_link = NEW_DIR + group + '/' + core_name + '.hmmscan_250'
  15      puts '  => ' + new_link
  16      puts
  17      if ( !File.exists?( new_link ) || !File.exists?( link ) )
  18         puts 'ERROR!'
  19         exit
  20      end
  21      #what is called new_link will by linked to by 'newdir/' + f.to_s:
  22      File.symlink( new_link, 'newdir/' + f.to_s )
  23   end
  24 }
  25
  26
  27 #File.symlink("testfile", "link2test")