forester/test_data/pfam_to_go_test

   1 !date: 2007/10/03 17:10:37
   2 !Mapping of Pfam entries to GO
   3 !http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/index.shtml
   4 !Uses Interpro2Go by Nicola Mulder, Hinxton
   5 !
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   7
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 156 Pfam:PF00101 RuBisCO_small > GO:ribulose-bisphosphate carboxylase activity ; GO:0016984
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 159 Pfam:PF00102 Y_phosphatase > GO:protein tyrosine phosphatase activity ; GO:0004725
 160 Pfam:PF00102 Y_phosphatase > GO:protein amino acid dephosphorylation ; GO:0006470
 161 Pfam:PF00103 Hormone_1 > GO:hormone activity ; GO:0005179
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 181 Pfam:PF00112 Peptidase_C1 > GO:cysteine-type peptidase activity ; GO:0008234
 182 Pfam:PF00112 Peptidase_C1 > GO:proteolysis ; GO:0006508
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 186 Pfam:PF00114 Pilin > GO:cell adhesion ; GO:0007155
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 188 Pfam:PF00115 COX1 > GO:iron ion binding ; GO:0005506
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 191 Pfam:PF00115 COX1 > GO:aerobic respiration ; GO:0009060
 192 Pfam:PF00115 COX1 > GO:integral to membrane ; GO:0016021
 193 Pfam:PF00116 COX2 > GO:cytochrome-c oxidase activity ; GO:0004129
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 195 Pfam:PF00116 COX2 > GO:electron transport ; GO:0006118
 196 Pfam:PF00116 COX2 > GO:membrane ; GO:0016020
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 349 Pfam:PF00179 UQ_con > GO:small conjugating protein ligase activity ; GO:0019787
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 352 Pfam:PF00180 Iso_dh > GO:oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor ; GO:0016616
 353 Pfam:PF00180 Iso_dh > GO:metabolic process ; GO:0008152
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 367 Pfam:PF00185 OTCace > GO:amino acid metabolic process ; GO:0006520
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 369 Pfam:PF00186 DHFR_1 > GO:glycine biosynthetic process ; GO:0006545
 370 Pfam:PF00186 DHFR_1 > GO:nucleotide biosynthetic process ; GO:0009165
 371 Pfam:PF00187 Chitin_bind_1 > GO:chitin binding ; GO:0008061
 372 Pfam:PF00189 Ribosomal_S3_C > GO:structural constituent of ribosome ; GO:0003735
 373 Pfam:PF00189 Ribosomal_S3_C > GO:translation ; GO:0006412
 374 Pfam:PF00189 Ribosomal_S3_C > GO:intracellular ; GO:0005622
 375 Pfam:PF00189 Ribosomal_S3_C > GO:ribosome ; GO:0005840
 376 Pfam:PF00190 Cupin_1 > GO:nutrient reservoir activity ; GO:0045735
 377 Pfam:PF00191 Annexin > GO:calcium ion binding ; GO:0005509
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 379 Pfam:PF00193 Xlink > GO:hyaluronic acid binding ; GO:0005540
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