forester/test_data/spec_test_1.xml

   1 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>\r
   2 <phyloxml xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://www.phyloxml.org http://www.phyloxml.org/1.10/phyloxml.xsd" xmlns="http://www.phyloxml.org">\r
   3 <phylogeny rooted="true" rerootable="true">\r
   4   <name>[4]</name>\r
   5   <clade>\r
   6     <clade>\r
   7       <clade>\r
   8         <clade>\r
   9           <clade>\r
  10             <clade>\r
  11               <clade>\r
  12                 <clade>\r
  13                   <taxonomy>\r
  14                     <code>HUMAN</code>\r
  15                   </taxonomy>\r
  16                 </clade>\r
  17                 <clade>\r
  18                   <taxonomy>\r
  19                     <code>RAT</code>\r
  20                   </taxonomy>\r
  21                 </clade>\r
  22               </clade>\r
  23               <clade>\r
  24                 <clade>\r
  25                   <taxonomy>\r
  26                     <code>CAEEL</code>\r
  27                   </taxonomy>\r
  28                 </clade>\r
  29                 <clade>\r
  30                   <taxonomy>\r
  31                     <code>DROME</code>\r
  32                   </taxonomy>\r
  33                 </clade>\r
  34               </clade>\r
  35             </clade>\r
  36             <clade>\r
  37               <taxonomy>\r
  38                 <code>NEMVE</code>\r
  39               </taxonomy>\r
  40             </clade>\r
  41           </clade>\r
  42           <clade>\r
  43             <taxonomy>\r
  44               <code>YEAST</code>\r
  45             </taxonomy>\r
  46           </clade>\r
  47         </clade>\r
  48         <clade>\r
  49           <clade>\r
  50             <taxonomy>\r
  51               <code>PYRFU</code>\r
  52             </taxonomy>\r
  53           </clade>\r
  54           <clade>\r
  55             <taxonomy>\r
  56               <code>SULSO</code>\r
  57             </taxonomy>\r
  58           </clade>\r
  59         </clade>\r
  60       </clade>\r
  61       <clade>\r
  62         <clade>\r
  63           <taxonomy>\r
  64             <code>BACSU</code>\r
  65           </taxonomy>\r
  66         </clade>\r
  67         <clade>\r
  68           <taxonomy>\r
  69             <code>ECOLI</code>\r
  70           </taxonomy>\r
  71         </clade>\r
  72         <clade>\r
  73           <taxonomy>\r
  74             <code>VIBCH</code>\r
  75           </taxonomy>\r
  76         </clade>\r
  77       </clade>\r
  78     </clade>\r
  79     <clade>\r
  80       <clade>\r
  81         <clade>\r
  82           <taxonomy>\r
  83             <scientific_name>Bovine adenovirus D</scientific_name>\r
  84           </taxonomy>\r
  85         </clade>\r
  86         <clade>\r
  87           <taxonomy>\r
  88             <scientific_name>Ovine adenovirus B</scientific_name>\r
  89           </taxonomy>\r
  90         </clade>\r
  91       </clade>\r
  92       <clade>\r
  93         <taxonomy>\r
  94           <scientific_name>Canna yellow mottle virus</scientific_name>\r
  95         </taxonomy>\r
  96       </clade>\r
  97     </clade>\r
  98   </clade>\r
  99 </phylogeny>\r
 100 </phyloxml>