1d19b2a5aba986dc38fb8dcdd7c15919c36a0297
[jalview.git] / forester / test_data / temp.txt
1
2 1.69 0.00 1.52 1.48 1.45 1.44 1.46     1.69=0  
3 1.72 1.52 0.00 0.71 0.60 0.62 0.56     1.52=1  1.72=0  
4 1.66 1.48 0.71 0.00 0.46 0.51 0.47     0.71=2  1.48=1  1.66=0  
5 1.52 1.45 0.60 0.46 0.00 0.35 0.31     0.46=3  0.60=2  1.45=1  1.52=0  
6 1.60 1.44 0.62 0.51 0.35 0.00 0.27     0.35=4  0.51=3  0.62=2  1.44=1  1.60=0  
7 1.59 1.46 0.56 0.47 0.31 0.27 0.00     0.27=5  0.31=4  0.47=3  0.56=2  1.46=1  1.59=0  
8 N=7
9
10 1.69 0.00 1.52 1.48 1.45 1.44 1.46     1.69=0  
11 1.72 1.52 0.00 0.71 0.60 0.62 0.56     1.52=1  1.72=0  
12 1.66 1.48 0.71 0.00 0.46 0.51 0.47     0.71=2  1.48=1  1.66=0  
13 1.52 1.45 0.60 0.46 0.00 0.35 0.31     0.46=3  0.60=2  1.45=1  1.52=0  
14 1.60 1.44 0.62 0.51 0.35 0.00 0.27     0.35=4  0.51=3  0.62=2  1.44=1  1.60=0  
15 1.59 1.46 0.56 0.47 0.31 0.27 0.00     0.27=5  0.31=4  0.47=3  0.56=2  1.46=1  1.59=0  
16
17 0 1 => -2.08 (1.69)
18 Node Bovine joins Mouse
19 -------------------------------------------------------------
20
21 N=6
22
23 0.78 0.00 0.71 0.60 0.62 0.56     1.52=1  1.72=0  
24 0.73 0.71 0.00 0.46 0.51 0.47     0.71=2  1.48=1  1.66=0  
25 0.64 0.60 0.46 0.00 0.35 0.31     0.46=3  0.60=2  1.45=1  1.52=0  
26 0.68 0.62 0.51 0.35 0.00 0.27     0.35=4  0.51=3  0.62=2  1.44=1  1.60=0  
27 0.68 0.56 0.47 0.31 0.27 0.00     0.27=5  0.31=4  0.47=3  0.56=2  1.46=1  1.59=0  
28
29 0 1 => -0.91 (0.78)
30 Node 7 (Bovine+Mouse) joins Gibbon
31 -------------------------------------------------------------
32
33 N=5
34
35 0.33 0.00 0.46 0.51 0.47     0.71=2  1.48=1  1.66=0  
36 0.23 0.46 0.00 0.35 0.31     0.46=3  0.60=2  1.45=1  1.52=0  
37 0.26 0.51 0.35 0.00 0.27     0.35=4  0.51=3  0.62=2  1.44=1  1.60=0  
38 0.23 0.47 0.31 0.27 0.00     0.27=5  0.31=4  0.47=3  0.56=2  1.46=1  1.59=0  
39
40 3 4 => -0.62 (0.27)
41 Node Chimp joins Human
42 -------------------------------------------------------------
43
44 N=4
45
46 0.33 0.00 0.46 0.51     0.71=2  1.48=1  1.66=0  
47 0.23 0.46 0.00 0.35     0.46=3  0.60=2  1.45=1  1.52=0  
48 0.11 0.35 0.19 0.00     0.35=4  0.51=3  0.62=2  1.44=1  1.60=0  
49
50 0 1 => -0.58 (0.33)
51 Node 8 (7+Gibbon) joins Orang
52 -------------------------------------------------------------
53
54 N=3
55
56 0.18 0.00 0.35     0.46=3  0.60=2  1.45=1  1.52=0  
57 0.07 0.19 0.00     0.35=4  0.51=3  0.62=2  1.44=1  1.60=0  
58
59 0 2 => -0.44 (0.07)
60 Node 10 (8+Orang) joins 9 (Chimp+Human)
61 -------------------------------------------------------------
62
63 Node 11 (10+9) joins Gorilla
64
65 ============================================================================================
66
67
68 0->9.78610  
69 0->9.78610  1->9.04220  
70 0->9.78610  1->9.04220  2->5.72650  
71 0->9.78610  1->9.04220  2->5.72650  3->5.29640  
72 0->9.78610  1->9.04220  2->5.72650  3->5.29640  4->4.68640  
73 0->9.78610  1->9.04220  2->5.72650  3->5.29640  4->4.68640  5->4.78480  
74 0 1
75 Node Bovine joins Mouse
76 1----->2
77 2----->3
78 3----->4
79 4----->5
80 5----->6
81 0-->0
82 1-->2
83 2-->3
84 3-->4
85 4-->5
86 5-->6
87 6-->6
88 0->3.51105  
89 0->3.51105  1->3.26170  
90 0->3.51105  1->3.26170  2->2.88075  
91 0->3.51105  1->3.26170  2->2.88075  3->2.35770  
92 0->3.51105  1->3.26170  2->2.88075  3->2.35770  4->2.41990  
93 0 1
94 Node 7 (Bovine+Mouse) joins Gibbon
95 2----->3
96 3----->4
97 4----->5
98 5----->6
99 6----->6
100 0-->0
101 1-->3
102 2-->4
103 3-->5
104 4-->6
105 5-->6
106 6-->6
107 0->1.05177  
108 0->1.05177  1->1.77138  
109 0->1.05177  1->1.77138  2->1.34965  
110 0->1.05177  1->1.77138  2->1.34965  3->1.38270  
111 3 4
112 Node Chimp joins Human
113 6----->6
114 6----->6
115 0-->0
116 1-->3
117 2-->4
118 3-->5
119 4-->6
120 5-->6
121 6-->6
122 0->0.67180  
123 0->0.67180  1->1.14822  
124 0->0.67180  1->1.14822  2->0.88670  
125 0 1
126 Node 8 (7+Gibbon) joins Orang
127 3----->4
128 4----->5
129 5----->6
130 6----->6
131 6----->6
132 0-->0
133 1-->4
134 2-->5
135 3-->6
136 4-->6
137 5-->6
138 6-->6
139 0->0.24766  
140 0->0.24766  1->0.37464  
141 0 2
142 Node 10 (8+Orang) joins 9 (Chimp+Human)
143 5----->6
144 6----->6
145 6----->6
146 6----->6
147 0-->0
148 1-->4
149 2-->6
150 3-->6
151 4-->6
152 5-->6
153 6-->6
154 Node 11 (10+9) joins Gorilla
155 0: 
156 1: 1.6866->0  
157 2: 1.5232->1  1.7198->0  
158 3: 0.7115->2  1.4841->1  1.6606->0  
159 4: 0.4631->3  0.5958->2  1.4465->1  1.5243->0  
160 5: 0.3484->4  0.5061->3  0.6179->2  1.4389->1  1.6043->0  
161 6: 0.2692->5  0.3083->4  0.4710->3  0.5583->2  1.4629->1  1.5905->0  
162
163