help/help/html/privacy.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>Jalview Privacy Statement</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26   <p>
  27     <strong>Privacy for Jalview Users</strong><br>
  28   <p>The Jalview Desktop application which is available from the
  29     www.jalview.org site does not contain code designed to collect
  30     personal or private information without your consent. However, we do
  31     collect usage statistics to work out who is using Jalview, so we can
  32     apply for funding to support Jalview development, and make it better
  33     for our users.</p>
  34   <p>Usage data is collected from the logs of various web services
  35     that the Jalview Desktop contacts through its normal operation.
  36     These are described below:</p>
  37         <ul>
  38                 <li><em>HTTP logs on the Jalview website</em><br> We record
  39                         IP addresses of machines which access the web site, either via the
  40                         browser when downloading the application, or when the Jalview Desktop
  41                         user interface is launched.<br> <br>
  42                         <ul>
  43                                 <li><i>The Jalview Getdown Launcher</i> (Since 2.11.0) examines
  44                                         release channels every time Jalview launches to determine if a new
  45                                         release is available.</li>
  46                                 <li><i>The questionnaire web service at
  47                                                 www.jalview.org/cgi-bin/questionnaire.pl is checked and a unique
  48                                                 cookie for the current questionnaire is stored in the Jalview
  49                                                 properties file.</i></li>
  50                                 <li><i>The Jalview web services stack is contacted to
  51                                                 retrieve the currently available web services. All interactions
  52                                                 with the public Jalview web services are logged, but we delete all
  53                                                 job data (input data and results) after about two weeks.</i></li>
  54                         </ul> <br></li>
  55                 <li><em>Usage Analytics</em><br> Since Jalview 2.11.2.7, the
  56                         Jalview Desktop records usage data with Plausible.io via a custom
  57                         GPLv3 client developed by Ben Soares. Prir to this, Jalview versions
  58                         as far back as 2.4 recorded application launces via <a
  59                         href="http://code.google.com/p/jgoogleanalytics/">JGoogleAnalytics</a>
  60                         .<br> Usage logs for Jalview record the fact that the
  61                         application was started, and details about the OS, installed Jalview
  62                         launcher (if any) and java version used. In the future, we will use
  63                         this mechanism to improve the Desktop user interface, by tracking
  64                         which parts of the user interface are being used most often.</li>
  65         </ul>
  66   <p>
  67     <strong>Stopping Jalview from calling home</strong><br> If you
  68     run Jalview in 'headless mode' via the command line, then the
  69     program shouldn't try to contact any of the web servers mentioned
  70     above (if it does, then it's a bug!). You can also specify some <a
  71       href="features/commandline.html">command line options</a> to
  72     disable the questionnaire and usage statistics check. Finally, the <a
  73       href="features/preferences.html#connections">Connections
  74       Tab</a> of the Jalview preferences contains options for controlling
  75     the submission of usage statistics.
  76   <p>
  77     <strong>Other Web Clients in Jalview</strong><br> The Jalview
  78     desktop is intended to make it easier to interact with web-based
  79     bioinformatics resources. However, we can't take any responsibility
  80     for the integrity of any external services you might access via the
  81     program. Sorry!
  82   </p>
  83 </body>
  84 </html>