get the html header comment right!
[jalview.git] / help / html / colourSchemes / hydrophobic.html
1 <html>
2 <!--
3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
4  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
5  * 
6  * This file is part of Jalview.
7  * 
8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
9  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
11  * 
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18 -->
19 </style>
20 </head>
21
22 <body>
23 <p><em>Hydrophobicity</em></p>
24 <p>According to the hydrophobicity table of Kyte, J., and Doolittle, R.F., J.
25   Mol. Biol. 1157, 105-132, 1982. The most hydrophobic residues according to this
26   table are coloured red and the most hydrophilic ones are coloured blue.</p>
27 <div align="center">
28   <table width="400" border="1">
29     <tr>
30       <td bgcolor="#ff0000">I</td>
31       <td bgcolor="#f60009">V</td>
32       <td bgcolor="#ea0015">L</td>
33       <td bgcolor="#cb0034">F</td>
34       <td bgcolor="#c2003d">C</td>
35     </tr>
36     <tr>
37       <td bgcolor="#b0004f">M</td>
38       <td bgcolor="#ad0052">A</td>
39       <td bgcolor="#6a0095">G</td>
40       <td bgcolor="#680097">X</td>
41       <td bgcolor="#61009e">T</td>
42     </tr>
43     <tr>
44       <td bgcolor="#5e00a1">S</td>
45       <td bgcolor="#5b00a4">W</td>
46       <td bgcolor="#4f00b0">Y</td>
47       <td bgcolor="#4600b9">P</td>
48       <td bgcolor="#1500ea">H</td>
49     </tr>
50     <tr>
51       <td bgcolor="#0c00f3">E</td>
52       <td bgcolor="#0c00f3">Z</td>
53       <td bgcolor="#0c00f3">Q</td>
54       <td bgcolor="#0c00f3">D</td>
55       <td bgcolor="#0c00f3">B</td>
56     </tr>
57     <tr> </td>
58       <td bgcolor="#0c00f3">N</td>
59       <td bgcolor="#0000ff">K</td>
60       <td bgcolor="#0000ff">R</td>
61     </tr>
62   </table>
63 </div>
64 </body>
65 </html>