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[jalview.git] / help / html / colourSchemes / zappo.html
1 <html>
2 <!--
3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
5  * 
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7  * 
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9  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
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13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
17  * 
18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
21  -->
22 <head>
23 <title>Zappo Colour Scheme</title>
24 <style type="text/css">
25 <!--
26 td {
27         text-align: center;
28 }
29 -->
30 </style>
31 </head>
32
33 <body>
34   <p>
35     <strong>Zappo Colours</strong><br> <br> The residues are
36     coloured according to their physicochemical properties as follows:
37   </p>
38   <div align="center">
39     <table width="400" border="1">
40       <tr>
41         <td>Aliphatic/hydrophobic</td>
42         <td bgcolor="#ffafaf">ILVAM</td>
43       </tr>
44       <tr>
45         <td>Aromatic</td>
46         <td bgcolor="#ffc800">FWY</td>
47       </tr>
48       <tr>
49         <td>Positive</td>
50         <td bgcolor="#6464ff">KRH</td>
51       </tr>
52       <tr>
53         <td>Negative</td>
54         <td bgcolor="#ff0000">DE</td>
55       </tr>
56       <tr>
57         <td>Hydrophilic</td>
58         <td bgcolor="#00ff00">STNQ</td>
59       </tr>
60       <tr>
61         <td>conformationally special</td>
62         <td bgcolor="#ff00ff">PG</td>
63       </tr>
64       <tr>
65         <td>Cysteine</td>
66         <td bgcolor="#ffff00">C</td>
67       </tr>
68     </table>
69   </div>
70 </body>
71 </html>