help/html/features/newkeystrokes.html

   1 #-------------------------------------------------------------------------------
   2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
   3 # Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   4 #
   5 # This file is part of Jalview.
   6 #
   7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10 #
  11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15 #
  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17 #-------------------------------------------------------------------------------
  18 <html>
  19 <!--
  20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
  21  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  22  *
  23  * This file is part of Jalview.
  24  *
  25  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  26  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  27  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  28  *
  29  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  30  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  31  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  32  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  33  *
  34  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  35 -->
  36 <title>New Key Strokes and Menus</title>
  37 <body>
  38 <strong>New Key Strokes and Menus</strong>
  39 <p>Many new <a href="../keys.html">keyboard shortcuts</a> have been
  40 added in Jalview 2.2 to make editing, selecting and navigating an
  41 alignment even easier. The selection commands in the <strong>Edit</strong>
  42 menu, and the alignment formatting controls within the <strong>View</strong>
  43 menu have also been moved into their own respective <strong>Select</strong>
  44 and <strong>Format</strong> menus.</p>
  45 <p>Some of the more important new keystrokes are shown below :
  46 <ul>
  47         <li><strong>Page Up</strong> and <strong>Page Down</strong>
  48         scrolls through the alignment view.</li>
  49         <li><strong>Control I</strong> inverts the currently selected
  50         sequence set, and <strong>Control Alt I</strong> will invert the
  51         currently selected set of columns.
  52         <li><strong>Control V</strong> will paste the contents of the
  53         clipboard to the current alignment window, and <strong>Control
  54         Shift V</strong> pastes the data to a new window.</li>
  55         <li><strong>Control O</strong> opens the file browser for loading
  56         a new alignment or Jalview archive.</li>
  57         <li><strong>Control S</strong> saves the alignment with the
  58         current filename and format, and <strong>Control Shift S</strong> opens
  59         the <strong>Save As...</strong> dialog box.</li>
  60         <li><strong>Control T</strong> creates a new alignment view, and <strong>Control
  61         W</strong> closes the current view, or if none remain, then the whole alignment.</li>
  62         <li><strong>Control E</strong> will remove gapped columns in the alignment.</li>
  63         <li><strong>Control D</strong> opens the <strong>Remove Redundancy</strong> dialog box.</li>
  64 </ul>
  65 </p>
  66 </body>
  67 </html>