help/html/jalviewjnlp.html

   1 #-------------------------------------------------------------------------------
   2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
   3 # Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   4 #
   5 # This file is part of Jalview.
   6 #
   7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10 #
  11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15 #
  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17 #-------------------------------------------------------------------------------
  18 <html>
  19 <!--
  20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
  21  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  22  *
  23  * This file is part of Jalview.
  24  *
  25  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  26  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  27  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  28  *
  29  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  30  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  31  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  32  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  33  *
  34  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  35 -->
  36 <head>
  37 <title>Jalview local Jnlp File</title>
  38 </head>
  39 <body>
  40 <h1>Jalview local Jnlp File</h1>
  41 <pre>
  42 &lt;jnlp spec="1.0+" codebase="http://www.jalview.org/webstart/" href="http://www.jalview.org/webstart/jalview.jnlp"&gt;
  43   &lt;information&gt;
  44     &lt;title&gt;Jalview&lt;/title&gt;
  45     &lt;vendor&gt;The Barton Group&lt;/vendor&gt;
  46     &lt;homepage href="http://www.jalview.org"/&gt;
  47     &lt;description&gt;Jalview Multiple Alignment Editor&lt;/description&gt;
  48     &lt;description kind="short"&gt;Jalview&lt;/description&gt;
  49     &lt;icon href="http://www.jalview.org/webstart/logo_big.gif" kind="default"/&gt;
  50     &lt;association extensions="fa" mime-type="application-x/ext-file"/&gt;
  51     &lt;association extensions="fasta" mime-type="application-x/ext-file"/&gt;
  52     &lt;association extensions="fastq" mime-type="application-x/ext-file"/&gt;
  53     &lt;association extensions="blc" mime-type="application-x/ext-file"/&gt;
  54     &lt;association extensions="msf" mime-type="application-x/ext-file"/&gt;
  55     &lt;association extensions="pfam" mime-type="application-x/ext-file"/&gt;
  56     &lt;association extensions="aln" mime-type="application-x/ext-file"/&gt;
  57     &lt;association extensions="pir" mime-type="application-x/ext-file"/&gt;
  58     &lt;offline-allowed/&gt;
  59   &lt;/information&gt;
  60   &lt;security&gt;
  61     &lt;all-permissions/&gt;
  62   &lt;/security&gt;
  63   &lt;resources&gt;
  64   &lt;!-- <em>the additional memory parameters are here</em> --&gt;
  65   &lt;j2se version="1.4+" initial-heap-size="500M" max-heap-size="1000M"/&gt;
  66     &lt;jar href="jalview.jar"/&gt;
  67                 &lt;jar href="JGoogleAnalytics-0.2.1-SNAPSHOT.jar"/&gt;
  68                 &lt;jar href="Jmol-11.0.2.jar"/&gt;
  69                 &lt;jar href="activation.jar"/&gt;
  70                 &lt;jar href="axis.jar"/&gt;
  71                 &lt;jar href="castor-1.1-cycle-xml.jar"/&gt;
  72                 &lt;jar href="commons-discovery.jar"/&gt;
  73                 &lt;jar href="commons-logging.jar"/&gt;
  74                 &lt;jar href="jaxrpc.jar"/&gt;
  75                 &lt;jar href="jhall.jar"/&gt;
  76                 &lt;jar href="log4j-1.2.8.jar"/&gt;
  77                 &lt;jar href="mail.jar"/&gt;
  78                 &lt;jar href="regex.jar"/&gt;
  79                 &lt;jar href="saaj.jar"/&gt;
  80                 &lt;jar href="vamsas-client.jar"/&gt;
  81                 &lt;jar href="wsdl4j.jar"/&gt;
  82                 &lt;jar href="xercesImpl.jar"/&gt;
  83                 &lt;jar href="xml-apis.jar"/&gt;
  84                 &lt;property name="jalview.version" value="2.5"/&gt;
  85   &lt;/resources&gt;
  86   &lt;application-desc main-class="jalview.bin.Jalview"/&gt;
  87 &lt;/jnlp&gt;
  88 </pre>
  89 <address>
  90 <a
  91 href="http://www.jalview.org/mailman/listinfo/jalview-discuss">If you have problems, send an email to jalview-discuss</a>
  92 </address>
  93 </body>
  94 </html>