aec3445ace2685dfe864141c4b2aab007201753f
[jalview.git] / help / html / menus / index.html
1 #-------------------------------------------------------------------------------
2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
3 # Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
4
5 # This file is part of Jalview.
6
7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8 # modify it under the terms of the GNU General Public License 
9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
10
11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
15
16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17 #-------------------------------------------------------------------------------
18 <html>
19 <!--
20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
21  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
22  * 
23  * This file is part of Jalview.
24  * 
25  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
26  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
27  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
28  * 
29  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
30  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
31  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
32  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
33  * 
34  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
35 -->
36 <head>
37 <title>Jalview's Menus</title>
38 </head>
39
40 <body>
41 <p><strong>Jalview's Menus</strong></p>
42 <p>Menus are used in 3 places in Jalview - the &quot;Desktop
43 Menu&quot;, the &quot;Alignment Menu&quot; and the &quot;Popup
44 Menu&quot;.</p>
45 <p>The <a href="desktopMenu.html">Desktop Menu</a> is always visible
46 and is the starting point for loading new alignments.</p>
47 <p>The <a href="alignmentMenu.html">Alignment Window Menus</a> are
48 accessible once an alignment has been opened.</p>
49 <p>The <a href="popupMenu.html">Popup Menus</a> are opened by
50 clicking with the right mouse button in the alignment display area or on
51 a sequence label in the alignment window.</p>
52 <p>The <a href="alwannotations.html">Annotations Menu</a> is opened
53 by right-clicking on an annotation row label or in an annotation row.</p>
54
55 </body>
56 </html>