help/html/privacy.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>Jalview Privacy Statement</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26   <p>
  27     <strong>Privacy for Jalview Users</strong><br>
  28   <p>The Jalview Desktop application which is available from the
  29     www.jalview.org site does not contain code designed to collect
  30     personal or private information without your consent. However, we do
  31     collect usage statistics to work out who is using Jalview, so we can
  32     apply for funding to support Jalview development, and make it better
  33     for our users.</p>
  34   <p>Usage data is collected from the logs of various web services
  35     that the Jalview Desktop contacts through its normal operation.
  36     These are described below:</p>
  37   <ul>
  38     <li><em>HTTP logs on the Jalview website</em><br> We
  39       record IP addresses of machines which access the web site, either
  40       via the browser when downloading the application, or when the
  41       Jalview Desktop user interface is launched.<br>
  42     <br>
  43       <ul>
  44         <li><i>The JNLP file at
  45             www.jalview.org/webstart/jalview.jnlp is retrieved to
  46             determine if you are running the latest version of Jalview.</i></li>
  47         <li><i>The questionnaire web service at
  48             www.jalview.org/cgi-bin/questionnaire.pl is checked and a
  49             unique cookie for the current questionnaire is stored in the
  50             Jalview properties file.</i></li>
  51         <li><i>The Jalview web services stack is contacted to
  52             retrieve the currently available web services. All
  53             interactions with the public Jalview web services are
  54             logged, but we delete all job data (input data and results)
  55             after about two weeks.</i></li>
  56       </ul>
  57       <br></li>
  58     <li><em>Google Analytics</em><br> Since Jalview 2.4.0b2,
  59       the Jalview Desktop records usage data with Google Analytics via
  60       the <a href="http://code.google.com/p/jgoogleanalytics/">JGoogleAnalytics</a>
  61       class.<br> The Google Analytics logs for Jalview version 2.4
  62       only record the fact that the application was started, but in the
  63       future, we will use this mechanism to improve the Desktop user
  64       interface, by tracking which parts of the user interface are being
  65       used most often.</li>
  66   </ul>
  67   </p>
  68   <p>
  69     <strong>Stopping Jalview from calling home</strong><br> If you
  70     run Jalview in 'headless mode' via the command line, then the
  71     program shouldn't try to contact any of the web servers mentioned
  72     above (if it does, then it's a bug!). You can also specify some <a
  73       href="features/commandline.html"
  74     >command line options</a> to disable the questionnaire and usage
  75     statistics check. Finally, the <a
  76       href="features/preferences.html#connections"
  77     >Connections Tab</a> of the Jalview preferences contains options for
  78     controlling the submission of usage statistics.
  79   <p>
  80     <strong>Other Web Clients in Jalview</strong><br> The Jalview
  81     desktop is intended to make it easier to interact with web-based
  82     bioinformatics resources. However, we can't take any responsibility
  83     for the integrity of any external services you might access via the
  84     program. Sorry!
  85   </p>
  86 </body>
  87 </html>