help/html/privacy.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
   4  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>Jalview Privacy Statement</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26 <p><strong>Privacy for Jalview Users</strong><br>
  27 <p>The Jalview Desktop application which is available from the
  28 www.jalview.org site does not contain code designed collect personal or
  29 private information without your consent. However, we do collect usage
  30 statistics to work out who is using Jalview, so we can apply for funding
  31 to support Jalview development, and make it better for our users.</p>
  32 <p>Usage data is collected from the logs of various web services that the Jalview Desktop contacts through its normal operation.
  33 These are described below:</p>
  34 <ul>
  35         <li><em>HTTP logs on the Jalview website</em><br>
  36         We record IP addresses of machines which access the web site, either
  37         via the browser when downloading the application, or when the Jalview
  38         Desktop user interface is launched.<br><br>
  39         <ul>
  40                 <li><i>The JNLP file at www.jalview.org/webstart/jalview.jnlp
  41                 is retrieved to determine if you are running the latest version of
  42                 Jalview.</i></li>
  43                 <li><i>The questionnaire web service at
  44                 www.jalview.org/cgi-bin/questionnaire.pl is checked and a unique
  45                 cookie for the current questionnaire is stored in the Jalview
  46                 properties file.</i></li>
  47                 <li><i>The Jalview web services stack is contacted to
  48                 retrieve the currently available web services. All interactions with
  49                 the public jalview web services are logged, but we delete all job data
  50                 (input data and results) after about two weeks.</i></li>
  51         </ul><br>
  52         </li>
  53         <li><em>Google Analytics</em><br>
  54         Since jalview 2.4.0b2, the Jalview Desktop records usage data with
  55         Google Analytics via the <a
  56                 href="http://code.google.com/p/jgoogleanalytics/">JGoogleAnalytics</a>
  57         class.<br>
  58         The Google Analytics logs for Jalview version 2.4 only record the fact
  59         that the application was started, but in the future, we will use this
  60         mechanism to improve the Desktop user interface, by tracking which
  61         parts of the user interface are being used most often.</li>
  62 </ul>
  63 </p>
  64 <p><strong>Stopping Jalview from calling home</strong><br>
  65 If you run Jalview in 'headless mode' via the command line, then the
  66 program shouldn't try to contact any of the web servers mentioned above
  67 (if it does, then it's a bug!). You can also specify some <a
  68         href="features/commandline.html">command line options</a> to disable
  69 the questionnaire and usage statistics check. Finally, the <a
  70         href="features/preferences.html#connections">Connections Tab</a> of the
  71 jalview preferences contains options for controlling the submission of
  72 usage statistics.
  73 <p><strong>Other Web Clients in Jalview</strong><br>
  74 The Jalview desktop is intended to make it easier to interact with
  75 web-based bioinformatics resources. However, we can't take any
  76 responsibility for the integrity of any external services you might
  77 access via the program. Sorry!</p>
  78 </body>
  79 </html>