help/html/whatsNew.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   4  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  11  * of the License, or (at your option) any later version.
  12  *
  13  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  14  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  15  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  16  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  17  *
  18  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  20  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  21  -->
  22 <head>
  23 <title>What's new ?</title>
  24 </head>
  25 <body>
  26   <p>
  27     <strong>What's new in Jalview 2.10.2 ?</strong>
  28   </p>
  29   <p>
  30     Full details about Jalview 2.10.2 are in the <a
  31       href="releases.html#Jalview.2.10.2"> Release Notes</a>, but the
  32     highlights are below.
  33   </p>
  34   <ul>
  35     <li><strong>Update to JABAWS 2.2</strong><br />Jalview's
  36       alignment, protein conservation analysis, and protein disorder and
  37       RNA secondary structure prediction services are now provided by <a
  38       href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/jabaws">JABAWS 2.2</a>.
  39       Several of the programs provided as services have been updated, so
  40       their options and parameters have changed.</li>
  41     <li>New preferences for <a href="webServices/urllinks.html">opening
  42         web pages for database cross-references</a> via the UK Elixir's
  43       EMBL-EBI's MIRIAM database and identifiers.org services.
  44     </li>
  45   </ul>
  46   <p>
  47     <strong><a name="experimental">Experimental Features</a></strong>
  48   </p>
  49   <p>
  50     This release of Jalview includes a new option in the Jalview Desktop
  51     that allows you to try out features that are still in development.
  52     To access the features described below, please first enable the <strong>Tools&#8594;Enable
  53       Experimental Features</strong> option, and then restart Jalview.
  54   </p>
  55   <ul>
  56     <li><em>Annotation transfer between Chimera and Jalview</em><br />Two
  57       <a href="features/chimera.html#experimental">new entries in
  58         the Chimera viewer's Chimera menu</a> allow positional annotation to
  59       be exchanged between Chimera and Jalview.</li>
  60   </ul>
  61 </body>
  62 </html>