help/html/whatsNew.html

   1 <html>\r
   2 <head><title>What's new ?</title></head>\r
   3 <body>\r
   4 <p><strong>What's new ?</strong> </p>\r
   5 <p>Jalview Version 2.1</p>\r
   6 <p>The multiple sequence alignment program <a href="webServices/mafft.html">MAFFT</a> \r
   7   is available from the default Web Service list.</p>\r
   8 <p>The sequence feature retrieval system using DBFetch from EBI has been replaced \r
   9   with <a href="features/dassettings.html">DAS Feature fetching</a> capabilities.</p>\r
  10 <p><a href="features/hiddenRegions.html">Hide sequences and columns</a></p>\r
  11 <p>Export Annotations and Features</p>\r
  12 <p>GFF file reading / writing</p>\r
  13 <p>Associate structures with sequences from local PDB files</p>\r
  14 <p>Add sequences to existing alignment</p>\r
  15 <p>Recently opened files / URL lists</p>\r
  16 <p>Applet can launch the full application</p>\r
  17 <p>Applet has transparency for features (Java 1.2 required)</p>\r
  18 <p>Applet has user defined colours parameter</p>\r
  19 <p>&nbsp; </p>\r
  20 <p><strong>Issues Resolved</strong></p>\r
  21 <p>Redundancy Panel reinstalled in the Applet</p>\r
  22 <p>Monospaced font - EPS / rescaling bug fixed</p>\r
  23 <p>Annotation files with sequence references bug fixed</p>\r
  24 <p>&nbsp;</p>\r
  25 <p>See the <a href="releases.html">Release History</a> page for details of all\r
  26   new features and resolved issues. </p>\r
  27 </body>\r
  28 </html>\r