1ad60bea89bef496a838eee6c75d9a6201ad14be
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.force_quit = Force quit
36 label.quit_jalview = Are you sure you want to quit Jalview?
37 label.wait_for_save = Wait for save
38 label.unsaved_changes = There are unsaved changes.
39 label.save_in_progress = Some files are still saving:
40 label.confirm_quit_viewer = An external viewer is still open.  Close the external window as well?
41 label.confirm_quit_viewers = External viewers are still open.  Close these external windows as well?
42 label.unknown = Unknown
43 label.quit_after_saving = Jalview will quit after saving.
44 label.all_saved = All files saved.
45 label.quitting_bye = Quitting, bye!
46 action.wait = Wait
47 action.cancel_quit = Cancel quit
48 action.expand_views = Expand Views
49 action.gather_views = Gather Views
50 action.page_setup = Page Setup...
51 action.reload = Reload
52 action.load = Load
53 action.open = Open
54 action.cancel = Cancel
55 action.create = Create
56 action.update = Update
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58 action.clear = Clear
59 action.accept = Accept
60 action.select_ddbb = --- Select Database ---
61 action.undo = Undo
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63 action.reset = Reset
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68 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
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70 action.boxes = Boxes
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74 action.by_length = By Length
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77 action.set_as_reference = Set as Reference 
78 action.remove = Remove
79 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
80 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
81 action.user_defined = User Defined...
82 action.by_conservation = By Conservation
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86 action.find = Find
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89 action.copy = Copy
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98 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
99 action.help = Help
100 action.by_annotation = By Annotation...
101 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
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103 action.show = Show
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118 action.find_all = Find all
119 action.find_next = Find next
120 action.file = File
121 action.view = View
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123 action.change_params = Change Parameters
124 action.apply = Apply
125 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
126 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
127 action.by_chain = By Chain
128 action.by_sequence = By Sequence
129 action.paste_annotations = Paste Annotations
130 action.format = Format
131 action.select = Select
132 action.new_view = New View
133 action.new_structure_view_with = Open new structure view with {0}
134 action.close = Close
135 action.add = Add
136 action.save_as = Save as...
137 action.save = Save
138 action.change_font = Change Font
139 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
140 action.colour = Colour
141 action.calculate = Calculate
142 action.select_all = Select all
143 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
144 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
145 action.copy_highlighted_regions = Copy Highlighted Regions
146 tooltip.copy_highlighted_regions = Copies highlighted sequence regions to the clipboard for export or further analysis
147 action.deselect_all = Deselect all
148 action.invert_selection = Invert selection
149 action.using_jmol = Using Jmol
150 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
151 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
152 action.link = Link
153 action.group_link = Group Link
154 action.show_chain = Show Chain
155 action.show_group = Show Group
156 action.fetch_db_references = Fetch DB References
157 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
158 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
159 label.structures_manager = Structures Manager
160 label.url = URL
161 label.url\: = URL:
162 label.input_file_url = Enter URL or Input File
163 label.select_feature = Select feature
164 label.name = Name
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166 label.name_param = Name: {0}
167 label.group = Group
168 label.group\: = Group:
169 label.group_name = Group Name
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171 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
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173 label.description = Description
174 label.description\: = Description:
175 label.start = Start:
176 label.end = End:
177 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
178 label.service_action = Service Action:
179 label.post_url = POST URL:
180 label.url_suffix = URL Suffix
181 label.per_seq = per Sequence
182 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
183 label.amend = Amend
184 label.undo_command = Undo {0}
185 label.redo_command = Redo {0}
186 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
187 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
188 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
189 label.choose_calculation = Choose Calculation
190 label.calc_title = {0} Using {1}
191 label.tree_calc_av = Average Distance
192 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
193 label.score_model_pid = % Identity
194 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
195 label.score_model_pam250 = PAM 250
196 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
197 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
198 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
199 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
200 label.status_bar = Status bar
201 label.out_to_textbox = Output to Textbox
202 label.occupancy = Occupancy
203 # delete Clustal - use FileFormat name instead
204 label.clustal = Clustal
205 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
206 label.colourScheme_clustal = Clustal
207 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
208 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
209 label.colourScheme_zappo = Zappo
210 label.colourScheme_taylor = Taylor
211 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
212 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
213 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
214 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
215 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
216 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
217 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
218 label.colourScheme_nucleotideambiguity = Nucleotide Ambiguity
219 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
220 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
221 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
222 label.colourScheme_gecos\:flower = gecos Flower
223 label.colourScheme_gecos\:blossom = gecos Blossom
224 label.colourScheme_gecos\:sunset = gecos Sunset
225 label.colourScheme_gecos\:ocean = gecos Ocean
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227 label.fasta = Fasta
228 label.msf = MSF
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232 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
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234 label.show_annotations = Show annotations
235 label.hide_annotations = Hide annotations
236 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
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238 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
239 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
240 label.hide_all = Hide all
241 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
242 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
243 label.colour_text = Colour Text
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287 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
288 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
289 label.structure_viewer = Default structure viewer
290 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
291 label.viewer_path = Path to {0} program
292 label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
293 label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
294 label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
295 label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck configured path in Structure tab of Jalview''s Preferences 
296 label.min_colour = Minimum Colour
297 label.max_colour = Maximum Colour
298 label.no_colour = No Colour
299 label.use_original_colours = Use Original Colours
300 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
301 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
302 label.selection = Selection
303 label.group_colour = Group Colour
304 label.sequence = Sequence
305 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
306 label.min_value = Min value
307 label.max_value = Max value
308 label.no_value = No value
309 label.new_feature = New Feature
310 label.match_case = Match Case
311 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
312 label.labels = Labels
313 label.output_values = Output Values...
314 label.output_points = Output points...
315 label.output_transformed_points = Output transformed points
316 label.input_data = Input Data...
317 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
318 label.protein_matrix = Protein matrix
319 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
320 label.show_distances = Show distances
321 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
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323 label.newick_format = Newick Format
324 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
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327 label.wireframe = Wireframe
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331 label.all_chains_visible = All Chains Visible
332 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
333 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
334 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
335 label.removed_columns = Removed {0} columns.
336 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
337 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
338 label.order_by_params = Order by {0}
339 label.html_content = <html>{0}</html>
340 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
341 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
342 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
343 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
344 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
345 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
346 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
347 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
348 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
349 label.paste_your = Paste your
350 label.finished_searching = Finished searching
351 label.subsequence_matches_found = {0} subsequence matches found
352 label.search_results= Search results {0} : {1}
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355 label.size = Size:
356 label.style = Style:
357 label.calculating = Calculating....
358 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
359 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
360 label.set_this_label_text = set this label text
361 label.sequences_from = Sequences from {0}
362 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
363 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
364 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
365 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
366 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
367 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
368 label.source_to_target = {0} ... {1}
369 label.per_sequence_only= Per-sequence only
370 label.to_file = to File
371 label.to_textbox = to Textbox
372 label.jalview = Jalview
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375 label.channels = Channels
376 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
377 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
378 label.groovy_console = Groovy Console...
379 label.lineart = Lineart
380 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
381 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
382 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
383 label.invert_selection = Invert Selection
384 label.optimise_order = Optimise Order
385 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
386 label.load_colours = Load Colours
387 label.save_colours = Save Colours
388 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
389 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
390 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
391 label.database_param = Database: {0}
392 label.example = Example
393 label.example_param = Example: {0}
394 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
395 label.file_format_not_specified = File format not specified
396 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
397 label.error_saving_file = Error Saving File
398 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
399 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
400 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
401 label.invalid_selection = Invalid Selection
402 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
403 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
404 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
405 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
406 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
407 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
408 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
409 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
410 label.translation_failed = Translation Failed
411 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
412 label.implementation_error  = Implementation error:
413 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
414 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
415 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
416 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
417 label.view_name_original = Original
418 label.enter_view_name = Enter View Name
419 label.enter_label = Enter label
420 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
421 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
422 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
423 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
424 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
425 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn''t read the pasted text {0}
426 label.error_parsing_text = Error parsing text
427 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
428 label.input_alignment = Input Alignment
429 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
430 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
431 label.url_not_found = URL not found
432 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
433 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
434 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
435 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
436 label.invalid_url = Invalid URL !
437 label.error_loading_file = Error loading file
438 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
439 label.file_open_error = File open error
440 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
441 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
442 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
443 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
444 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
445 label.alignment_props = Alignment Properties
446 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
447 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
448 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
449 label.annotations = Annotations
450 label.structure_options = Structure Options
451 label.features = Features
452 label.overview_params = Overview {0}
453 label.paste_newick_file = Paste Newick file
454 label.load_tree_from_file = From File - 
455 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
456 label.selection_output_command = Selection output - {0}
457 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
458 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
459 label.pca_details = PCA details
460 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
461 label.user_defined_colours = User defined colours
462 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
463 label.jaview_build_date = Build date: {0}
464 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
465 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
466 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
467 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
468 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
469 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
470 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
471 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
472 label.right_click = Right click
473 label.to_add_annotation = to add annotation
474 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
475 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
476 label.label = Label
477 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
478 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
479 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
480 label.calculating_pca= Calculating PCA
481 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
482 label.jalview_applet = Jalview applet
483 label.loading_data = Loading data
484 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
485 label.calculating_tree = Calculating tree
486 label.state_queueing = queuing
487 label.state_running = running
488 label.state_completed = finished
489 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
490 label.state_job_error = job error!
491 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
492 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
493 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
494 label.structure_type = Structure type
495 label.settings_for_type = Settings for {0}
496 label.view_full_application = View in Full Application
497 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
498 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
499 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
500 label.load_vcf_file = Load VCF File
501 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
502 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
503 label.export_features = Export Features...
504 label.export_annotations = Export Annotations...
505 label.to_upper_case = To Upper Case
506 label.to_lower_case = To Lower Case
507 label.toggle_case = Toggle Case
508 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
509 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
510 label.edit_sequence = Edit Sequence
511 label.edit_sequences = Edit Sequences
512 label.insert_gap = Insert 1 gap
513 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
514 label.delete_gap = Delete 1 gap
515 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
516 label.sequence_details = Sequence Details
517 label.viewer_help = {0} Help
518 label.close_viewer = Close Viewer
519 label.close_viewers = Close Viewers
520 label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
521 label.all = All
522 label.sort_by = Sort alignment by
523 label.sort_by_score = Sort by Score
524 label.sort_by_density = Sort by Density
525 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
526 label.sort_ann_by = Sort annotations by
527 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
528 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
529 label.reveal = Reveal
530 label.hide_columns = Hide Columns
531 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
532 label.load_tree_file = Load a tree file
533 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
534 label.standard_databases = Standard Databases
535 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
536 label.fetch_uniprot_references = Fetch Uniprot references
537 label.search_3dbeacons = Search 3D-Beacons
538 label.find_models_from_3dbeacons = Search 3D-Beacons for 3D structures and models
539 label.3dbeacons = 3D-Beacons
540 label.fetch_references_for = Fetch database references for {0} sequences ?
541 label.fetch_references_for_3dbeacons = 3D Beacons needs to fetch Uniprot References for {0} sequences.  Do you want to continue ?
542 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
543 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
544 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
545 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
546 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
547 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
548 label.adjust_threshold = Adjust threshold
549 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
550 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
551 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
552 label.open_url_param = Open URL {0}
553 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
554 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
555 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
556 label.dark_colour = Dark Colour
557 label.light_colour = Light Colour
558 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
559 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
560 label.copy_format_from = Copy format from
561 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
562 label.select_all_views = Select all views
563 label.select_many_views = Select many views
564 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
565 label.open_local_file = Open local file
566 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
567 label.listen_for_selections = Listen for selections
568 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
569 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
570 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
571 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
572 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
573 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
574 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
575 label.no_services = <No Services>
576 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
577 label.from_url = from URL
578 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
579 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
580 label.from_textbox = from Textbox
581 label.window = Window
582 label.preferences = Preferences
583 label.tools = Tools
584 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
585 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
586 label.collect_garbage = Collect Garbage
587 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
588 label.show_java_console = Show Java Console
589 label.show_jalview_news = Show Jalview News
590 label.take_snapshot = Take snapshot
591 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
592 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
593 label.monospaced_font= Monospaced
594 label.quality = Quality
595 label.maximize_window = Maximize Window
596 label.conservation = Conservation
597 label.consensus = Consensus
598 label.histogram = Histogram
599 label.logo = Logo
600 label.non_positional_features = List Non-positional Features
601 label.database_references = List Database References
602 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
603 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
604 label.gap_symbol = Gap Symbol
605 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
606 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
607 label.address = Address
608 label.host = Host
609 label.port = Port
610 label.default_browser_unix_windows = Default Browser (Unix, Windows)
611 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
612 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
613 label.check_for_latest_version = Check for latest version
614 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
615 label.no_proxy = No proxy servers
616 label.system_proxy = System proxy servers (http={0}; https={1})
617 label.use_proxy_server = Use these proxy servers
618 label.auth_required = Authentication required
619 label.username = Username
620 label.password = Password
621 label.proxy_password_required = Proxy password required
622 label.not_stored = not stored in Preferences file
623 label.rendering_style = {0} rendering style
624 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
625 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
626 label.smooth_font = Smooth Font
627 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
628 label.pad_gaps = Pad Gaps
629 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
630 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
631 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
632 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
633 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
634 label.right_align_ids = Right Align Ids
635 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
636 label.open_overview = Open Overview
637 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
638 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
639 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
640 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
641 label.visual = Visual
642 label.connections = Connections
643 label.output = Output
644 label.editing = Editing
645 label.web_services = Web Services
646 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
647 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
648 label.fetch_viewer_attributes = Fetch {0} attributes
649 label.fetch_viewer_attributes_tip = Copy {0} attribute to Jalview feature
650 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
651 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
652 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
653 label.new_service_url = New Service URL
654 label.edit_service_url = Edit Service URL
655 label.delete_service_url = Delete Service URL
656 label.details = Details
657 label.options = Options
658 label.parameters = Parameters
659 label.proxy_servers = Proxy Servers
660 label.file_output = File Output
661 label.select_input_type = Select input type
662 label.set_options_for_type = Set options for type
663 label.data_input_parameters = Data input parameters
664 label.data_returned_by_service = Data returned by service
665 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
666 label.parsing_errors = Parsing errors
667 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
668 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
669 label.input_parameter_name = Input Parameter name
670 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
671 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
672 label.brief_description_service = Brief description of service
673 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
674 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
675 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
676 label.gap_character = Gap character
677 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
678 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
679 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
680 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
681 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
682 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
683 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
684 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
685 label.input_output = Input/Output
686 label.cut_paste = Cut'n'Paste
687 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
688 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
689 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
690 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
691 label.from_file = From File
692 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
693 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
694 label.text_colour = Text Colour...
695 label.structure = Structure
696 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
697 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
698 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
699 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
700 label.sequence_name = Sequence Name
701 label.sequence_description = Sequence Description
702 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
703 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
704 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
705 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
706 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
707 label.web_browser_not_found = Web browser not found
708 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
709 label.html = HTML
710 label.wrap = Wrap
711 label.show_database_refs = Show Database Refs
712 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
713 label.save_png_image = Save As PNG Image
714 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
715 label.export_image = Export Image
716 label.vamsas_store = VAMSAS store
717 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
718 label.reverse = Reverse
719 label.reverse_complement = Reverse Complement
720 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
721 label.extract_scores = Extract Scores
722 label.get_cross_refs = Get Cross-References
723 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
724 label.add_sequences = Add Sequences
725 label.new_window = New Window
726 label.split_window = Split Window
727 label.set_as_default = Set as Default
728 label.show_labels = Show labels
729 action.background_colour = Background Colour...
730 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
731 label.link_name = Link Name
732 label.pdb_file = PDB file
733 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
734 label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
735 label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
736 label.superpose_structures = Superpose Structures
737 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
738 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
739 label.create_viewer_attributes = Write Jalview features
740 label.create_viewer_attributes_tip = Set structure residue attributes for Jalview features
741 label.attributes_set = {0} attribute values set on {1}
742 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
743 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
744 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
745 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
746 label.case_sensitive = Case Sensitive
747 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
748 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
749 label.index_by_host = Index by Host
750 label.index_by_type = Index by Type
751 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
752 label.display_warnings = Display Warnings
753 label.move_url_up = Move URL Up
754 label.move_url_down = Move URL Down
755 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
756 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
757 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
758 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
759 label.sequences_updated = Sequences updated
760 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
761 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
762 label.paste_new_window = Paste To New Window
763 label.settings_for_param = Settings for {0}
764 label.view_params = View {0}
765 label.aacon_calculations = AACon Calculations
766 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
767 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
768 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
769 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
770 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
771 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
772 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
773 label.all_views = All Views
774 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
775 label.realign_with_params = Realign with {0}
776 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
777 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
778 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
779 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
780 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
781 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
782 label.view_documentation = View documentation
783 label.select_return_type = Select return type
784 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
785 label.features_for_params = Features for - {0}
786 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
787 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
788 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
789 label.varna_params = VARNA - {0}
790 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
791 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
792 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
793 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
794 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
795 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
796 label.points_for_params = Points for {0}
797 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
798 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
799 label.select_background_colour = Select Background Colour
800 label.invalid_font = Invalid Font
801 label.search_db_all = Search all of {0}
802 label.search_db_index = Search {0} index {1}
803 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
804 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0} separated by a semi-colon ";"
805 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
806 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
807 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
808 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
809 label.example_query_param = Example query: {0}
810 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
811 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
812 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
813 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
814 label.select_columns_containing = Select columns containing
815 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
816 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
817 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
818 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
819 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
820 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
821 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
822 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
823 label.use_sequence_id_4 = 
824 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
825 label.switch_server = Switch server
826 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
827 label.services_at = Services at {0}
828 label.rest_client_submit = {0} using {1}
829 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
830 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
831 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
832 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
833 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
834 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
835 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
836 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
837 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
838 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
839 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
840 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
841 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
842 label.user_preset = User Preset
843 label.service_preset = Service Preset
844 label.run_with_preset = Run {0} with preset
845 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
846 action.by_title_param = By {0}
847 label.source_from_db_source = Sources from {0}
848 label.from_msname = from {0}
849 label.superpose_with = Superpose with
850 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
851 label.add_new_row = Add New Row
852 label.edit_label_description = Edit Label/Description
853 label.hide_row = Hide This Row
854 label.delete_row = Delete This Row
855 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
856 label.export_annotation = Export Annotation
857 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
858 label.helix = Helix
859 label.sheet = Sheet
860 label.rna_helix = RNA Helix
861 label.remove_annotation = Remove Annotation
862 label.colour_by = Colour by...
863 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
864 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
865 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
866 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
867 label.multiharmony = Multi-Harmony
868 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
869 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
870 label.prompt_each_time = Prompt each time
871 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
872 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
873 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
874 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
875 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
876 label.invalid_name = Invalid name
877 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
878 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
879 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
880 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn''t be located.
881 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
882 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
883 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
884 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
885 label.feature_type = Feature Type
886 label.show = Show
887 label.service_url = Service URL
888 label.copied_sequences = Copied sequences
889 label.cut_sequences = Cut Sequences
890 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
891 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
892 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
893 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
894 label.save_features_to_file = Save Features to File
895 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
896 label.save_pdb_file = Save PDB File
897 label.save_text_to_file = Save Text to File
898 label.save_state = Save State
899 label.restore_state = Restore State
900 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
901 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
902 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
903 label.select_startup_file = Select startup file
904 label.select_default_browser = Select default web browser
905 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
906 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
907 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
908 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
909 label.save_as_html = Save as HTML
910 label.recently_opened = Recently Opened
911 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
912 label.tree = Tree
913 label.tree_from = Tree from {0}
914 label.webservice_job_title = {0} using {1}
915 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
916 label.visible = Visible
917 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
918 label.visible_region_of = visible region of
919 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
920 label.loading_file = Loading File: {0}
921 label.edit_params = Edit {0}
922 label.as_percentage = As Percentage
923 error.not_implemented = Not implemented
924 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
925 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
926 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
927 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
928 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
929 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
930 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
931 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
932 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
933 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
934 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
935 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
936 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
937 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
938 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
939 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
940 error.implementation_error = Implementation error
941 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
942 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
943 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
944 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
945 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
946 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
947 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
948 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
949 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
950 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
951 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
952 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
953 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
954 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
955 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
956 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
957 label.cancelled_params = Cancelled {0}
958 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
959 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
960 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
961 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
962 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
963 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
964 error.invalid_value_for_option = Invalid value ''{0}'' for option ''{1}''
965 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
966 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
967 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
968 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
969 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
970 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
971 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
972 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
973 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
974 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
975 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
976 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
977 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
978 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
979 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
980 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
981 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
982 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
983 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
984 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
985 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
986 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
987 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
988 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
989 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
990 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
991 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
992 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
993 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
994 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can''t locate either oldname ({0}) or presetName ({1}) in the datastore!"
995 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
996 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
997 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
998 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
999 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
1000 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
1001 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1002 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn''t encode {0} as UTF-8.
1003 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1004 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1005 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1006 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1007 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1008 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1009 label.no_highlighted_regions_marked = No highlighted regions marked
1010 label.toggled = Toggled
1011 label.marked = Marked
1012 label.containing = containing
1013 label.not_containing = not containing
1014 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
1015 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
1016 label.submission_params = Submission {0}
1017 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1018 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1019 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1020 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1021 label.pca_calculating = Calculating PCA
1022 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1023 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1024 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1025 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1026 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1027 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1028 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1029 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1030 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1031 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1032 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1033 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1034 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1035 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1036 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1037 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1038 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1039 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1040 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1041 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1042 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1043 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1044 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1045 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1046 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1047 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1048 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1049 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1050 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1051 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1052 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1053 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1054 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1055 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1056 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1057 label.mapped = mapped
1058 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1059 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn''t parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1060 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1061 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1062 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn''t access datasource ({0})
1063 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn''t process data as RNAML file ({0})
1064 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1065 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1066 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1067 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1068 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1069 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1070 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn''t store sequence mappings for {0}
1071 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1072 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1073 exception.browser_unable_to_launch = Unable to launch browser: {0}
1074 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1075 exception.browser_os_not_supported = Launching browser on this operating system not supported.  Use URL\n{0}
1076 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1077 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1078 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1079 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1080 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1081 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1082 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1083 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1084 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1085 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1086 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1087 label.remove_gaps = Remove Gaps
1088 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1089 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1090 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1091 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1092 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1093 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1094 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1095 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1096 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1097 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1098 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1099 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1100 warn.service_not_supported = Service not supported!
1101 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1102 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1103 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1104 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn''t support this program.\n{0}
1105 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1106 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1107 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1108 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1109 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1110 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1111 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1112 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1113 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1114 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1115 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1116 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1117 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1118 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1119 label.eps_file = EPS file
1120 label.png_image = PNG image
1121 status.export_complete = {0} Export completed
1122 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1123 status.refreshing_news = Refreshing news
1124 status.opening_params = Opening {0}
1125 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1126 status.finshed_querying = Finished querying
1127 status.parsing_results = Parsing results.
1128 status.processing = Processing...
1129 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1130 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1131 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1132 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1133 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1134 status.searching_3d_beacons = Searching 3D Beacons
1135 status.no_structures_discovered_from_3d_beacons = No models discovered from 3D Beacons
1136 status.opening_file_for = opening file for
1137 status.colouring_structures = Colouring structures
1138 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1139 label.font_too_small = Font size is too small
1140 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1141 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1142 label.out_of_memory = Out of memory
1143 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1144 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1145 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1146 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1147 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1148 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1149 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1150 label.test_server = Test Server?
1151 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1152 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1153 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1154 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1155 label.file_already_exists = File exists
1156 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1157 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1158 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1159 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1160 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1161 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1162 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1163 label.delete_all = Delete all sequences
1164 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1165 label.add_annotations_for = Add annotations for
1166 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1167 label.choose_annotations = Choose Annotations
1168 label.find = Find
1169 label.in = in
1170 label.invalid_search = Search string invalid
1171 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1172 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1173 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1174 label.show_group_logo = Show Group Logo
1175 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1176 label.show_histogram = Show Histogram
1177 label.show_logo = Show Logo
1178 label.normalise_logo = Normalise Logo
1179 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1180 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1181 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1182 label.open_split_window = Open split window
1183 action.no = No
1184 action.yes = Yes
1185 label.for = for
1186 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1187 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1188 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1189 label.alpha_helix = Alpha Helix
1190 label.beta_strand = Beta Strand
1191 label.turn = Turn
1192 label.select_all = Select All
1193 label.structures_filter = Structures Filter
1194 label.search_filter = Search Filter
1195 label.include_description= Include Description
1196 action.back = Back
1197 label.hide_insertions = Hide Insertions
1198 label.mark_as_representative = Mark as representative
1199 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1200 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1201 label.result = result
1202 label.results = results
1203 label.structure_chooser = Structure Chooser
1204 label.invert = Invert 
1205 label.select_pdb_file = Select PDB File
1206 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1207 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1208 label.search_result = Search Result
1209 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1210 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1211 label.start_jalview = Start Jalview
1212 label.biojs_html_export = BioJS
1213 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1214 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1215 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1216 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1217 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1218 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1219 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1220 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1221 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1222 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1223 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1224 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1225 action.export_groups = Export Groups
1226 action.export_annotations = Export Annotations
1227 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1228 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1229 action.export_features = Export Features
1230 label.export_settings = Export Settings
1231 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1232 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1233 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1234 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1235 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1236 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1237 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1238 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1239 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1240 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1241 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1242 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1243 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1244 label.run_groovy = Run Groovy console script
1245 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1246 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1247 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1248 action.next_page= >> 
1249 action.prev_page= << 
1250 label.next_page_tooltip=Next Page
1251 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1252 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1253 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1254 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1255 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1256 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1257 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1258 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1259 label.column = Column
1260 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1261 label.operation_failed = Operation failed
1262 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1263 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1264 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1265 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1266 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1267 action.customfilter = Custom only
1268 action.showall = Show All
1269 label.insert = Insert:
1270 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1271 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1272 label.primary = Double Click
1273 label.inmenu = In Menu
1274 label.id = ID
1275 label.database = Database
1276 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1277 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1278 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1279 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1280 label.urllinks = Links
1281 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1282 label.togglehidden = Show hidden regions
1283 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1284 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1285 label.consensus_descr = PID
1286 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1287 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1288 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1289 label.show_experimental = Enable experimental features
1290 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1291 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1292 label.overview_settings = Overview settings
1293 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1294 label.gap_colour = Gap colour:
1295 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1296 label.hidden_colour = Hidden colour:
1297 label.select_gap_colour = Select gap colour
1298 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1299 label.overview = Overview
1300 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1301 label.oview_calc = Recalculating overview...
1302 label.feature_details = Feature details
1303 label.matchCondition_contains = Contains
1304 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1305 label.matchCondition_matches = Matches
1306 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1307 label.matchCondition_present = Is present
1308 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1309 label.matchCondition_eq = =
1310 label.matchCondition_ne = not =
1311 label.matchCondition_lt = <
1312 label.matchCondition_le = <=
1313 label.matchCondition_gt = >
1314 label.matchCondition_ge = >=
1315 label.numeric_required = The value should be numeric
1316 label.filter = Filter
1317 label.filters = Filters
1318 label.join_conditions = Join conditions with
1319 label.delete_condition = Delete this condition
1320 label.score = Score
1321 label.colour_by_label = Colour by label
1322 label.variable_colour = Variable colour...
1323 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1324 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1325 option.autosearch = Autosearch
1326 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1327 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1328 label.simple_colour = Simple Colour
1329 label.colour_by_text = Colour by text
1330 label.graduated_colour = Graduated Colour
1331 label.by_text_of = By text of
1332 label.by_range_of = By range of
1333 label.or = Or
1334 label.and = And
1335 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1336 label.best_quality = Best Quality
1337 label.best_resolution = Best Resolution
1338 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1339 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1340 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1341 label.cached_structures = Cached Structures
1342 label.free_text_search = Free Text Search
1343 label.annotation_name = Annotation Name
1344 label.annotation_description = Annotation Description 
1345 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1346 label.alignment = alignment
1347 label.pca = PCA
1348 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1349 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1350 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1351 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1352 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1353 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1354 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1355 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1356 label.continue_operation = Continue operation?
1357 label.continue = Continue
1358 label.backups = Backups
1359 label.backup = Backup
1360 label.backup_files = Backup Files
1361 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1362 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1363 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1364 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1365 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1366 label.scheme_examples = Scheme examples
1367 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1368 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1369 label.keep_files = Deleting old backup files
1370 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1371 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1372 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1373 label.always_ask = Always ask
1374 label.auto_delete = Automatically delete
1375 label.filename = filename
1376 label.braced_oldest = (oldest)
1377 label.braced_newest = (most recent)
1378 label.configuration = Configuration
1379 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1380 label.schemes = Schemes
1381 label.customise = Customise
1382 label.custom = Custom
1383 label.default = Default
1384 label.single_file = Single backup
1385 label.keep_all_versions = Keep all versions
1386 label.rolled_backups = Rolled backup files
1387 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1388 label.custom_description = Your own saved scheme
1389 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1390 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1391 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1392 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1393 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1394 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1395 label.include_backup_files = Include backup files
1396 label.cancel_changes = Cancel changes
1397 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1398 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1399 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1400 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1401 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1402 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1403 label.delete = Delete
1404 label.rename = Rename
1405 label.keep = Keep
1406 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1407 label.annotation_name = Annotation Name
1408 label.annotation_description = Annotation Description 
1409 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1410 label.alignment = alignment
1411 label.pca = PCA
1412 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1413 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1414 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
1415 label.show_linked_features = Show {0} features
1416 label.on_top = on top
1417 label.include_features = Include Features
1418 label.search_features = Search descriptions of displayed features
1419 label.include_linked_features = Include {0} features
1420 label.include_linked_tooltip = Include visible {0} features<br>converted to local sequence coordinates
1421 label.features_not_shown = {0} feature(s) not shown
1422 label.no_features_to_sort_by = No features to sort by
1423 label.ignore_hidden = Ignore hidden columns
1424 label.ignore_hidden_tooltip = Ignore any characters in hidden columns when matching
1425 label.log_level = Log level
1426 label.log_level_tooltip = Temporarily set the log level for this console. The log level will revert to {0} when this Java console is closed.
1427 label.copy = Copy
1428 label.copy_to_clipboard = Copy to clipboard
1429 label.copy_to_clipboard_tooltip = Copy all of the log text in this console to the system clipboard
1430 label.startup = Startup
1431 label.memory = Memory
1432 label.customise_memory_settings = Customise maximum memory settings
1433 label.memory_setting_text = New memory settings will only come into effect the next time you start Jalview
1434 label.maximum_memory_used = Maximum memory limited to both
1435 label.percent_of_physical_memory = Maximum percent of physical memory
1436 label.maximum_memory = Maximum absolute memory
1437 label.maximum_memory_tooltip = Enter memory as an integer number optionally followed by 'b', 'k', 'm', 'g' or 't'
1438 label.adjustments_for_this_computer = Adjustments for this computer
1439 label.memory_example_text = Maximum memory that would be used with these settings on this computer
1440 label.memory_example_tooltip = The memory allocated to Jalview is the smaller of the percentage of physical memory (default 90%) and the maximum absolute memory (default 32GB). If your computer's memory cannot be ascertained then the maximum absolute memory defaults to 8GB (if not customised).<br>Jalview will always try and reserve 512MB for the OS and at least 512MB for itself.
1441 warning.wrong_jvm_version_title = Wrong Java Version
1442 warning.wrong_jvm_version_message = The Java version being used (Java {0}) may lead to problems.\nThis installation of Jalview should be used with Java {1}.