JAL-2388 New rendering code, extensions to support hiding hidden cols
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 action.save_image = Save Image
7 action.paste = Paste
8 action.show_html_source = Show HTML Source
9 action.print = Print...
10 action.web_service = Web Service
11 action.cancel_job = Cancel Job
12 action.start_job = Start Job
13 action.revert = Revert
14 action.move_down = Move Down
15 action.move_up = Move Up
16 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
17 action.add_return_datatype = Add return datatype
18 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
19 action.add_input_parameter = Add input parameter
20 action.edit = Edit
21 action.new = New
22 action.open_file = Open file
23 action.show_unconserved = Show Unconserved
24 action.open_new_alignment = Open new alignment
25 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
26 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
27 action.close_all = Close all
28 action.load_project = Load Project
29 action.save_project = Save Project
30 action.quit = Quit
31 action.expand_views = Expand Views
32 action.gather_views = Gather Views
33 action.page_setup = Page Setup...
34 action.reload = Reload
35 action.load = Load
36 action.open = Open
37 action.cancel = Cancel
38 action.create = Create
39 action.update = Update
40 action.delete = Delete
41 action.clear = Clear
42 action.accept = Accept
43 action.select_ddbb = --- Select Database ---
44 action.undo = Undo
45 action.redo = Redo
46 action.reset = Reset
47 action.remove_left = Remove left
48 action.remove_right = Remove right
49 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
50 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
51 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
52 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
53 action.boxes = Boxes
54 action.text = Text
55 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
56 action.by_id = By Id
57 action.by_length = By Length
58 action.by_group = By Group
59 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
60 action.set_as_reference = Set as Reference 
61 action.remove = Remove
62 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
63 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
64 action.user_defined = User Defined...
65 action.by_conservation = By Conservation
66 action.wrap = Wrap
67 action.show_gaps = Show Gaps
68 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
69 action.find = Find
70 action.undefine_groups = Undefine Groups
71 action.create_groups = Create Groups
72 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
73 action.copy = Copy
74 action.cut = Cut
75 action.font = Font...
76 action.scale_above = Scale Above
77 action.scale_left = Scale Left
78 action.scale_right = Scale Right
79 action.by_tree_order = By Tree Order
80 action.sort = Sort
81 action.calculate_tree = Calculate Tree
82 action.help = Help
83 action.by_annotation = By Annotation...
84 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
85 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
86 action.show = Show
87 action.hide = Hide
88 action.ok = OK
89 action.set_defaults = Defaults
90 action.create_group = Create Group
91 action.remove_group = Remove Group
92 action.edit_group = Edit Group
93 action.border_colour = Border colour
94 action.edit_new_group = Edit New Group
95 action.hide_sequences = Hide Sequences
96 action.sequences = Sequences
97 action.ids = IDS
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99 action.reveal_all = Reveal All
100 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
101 action.find_all = Find all
102 action.find_next = Find next
103 action.file = File
104 action.view = View
105 action.annotations = Annotations
106 action.change_params = Change Parameters
107 action.apply = Apply
108 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
109 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
110 action.by_chain = By Chain
111 action.by_sequence = By Sequence
112 action.paste_annotations = Paste Annotations
113 action.format = Format
114 action.select = Select
115 action.new_view = New View
116 action.close = Close
117 action.add = Add
118 action.save_as_default = Save as default
119 action.save_as = Save as...
120 action.save = Save
121 action.cancel_fetch = Cancel Fetch
122 action.change_font = Change Font
123 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
124 action.colour = Colour
125 action.calculate = Calculate
126 action.select_all = Select all
127 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
128 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
129 action.deselect_all = Deselect all
130 action.invert_selection = Invert selection
131 action.using_jmol = Using Jmol
132 action.link = Link
133 action.group_link = Group Link
134 action.show_chain = Show Chain
135 action.show_group = Show Group
136 action.fetch_db_references = Fetch DB References
137 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
138 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
139 label.structures_manager = Structures Manager
140 label.nickname = Nickname:
141 label.url = URL
142 label.url\: = URL:
143 label.input_file_url = Enter URL or Input File
144 label.select_feature = Select feature
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147 label.name_param = Name: {0}
148 label.group = Group
149 label.group\: = Group:
150 label.group_name = Group Name
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152 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
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154 label.description = Description
155 label.description\: = Description:
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157 label.end = End:
158 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
159 label.service_action = Service Action:
160 label.post_url = POST URL:
161 label.url_suffix = URL Suffix
162 label.sequence_source = Sequence Source
163 label.per_seq = per Sequence
164 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
165 label.amend = Amend
166 label.undo_command = Undo {0}
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168 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
169 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
170 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
171 label.treecalc_title = {0} Using {1}
172 label.tree_calc_av = Average Distance
173 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
174 label.select_score_model = Select score model
175 label.score_model_pid = % Identity
176 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
177 label.score_model_pam250 = PAM 250
178 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
179 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
180 label.status_bar = Status bar
181 label.out_to_textbox = Output to Textbox
182 # delete Clustal - use FileFormat name instead
183 label.clustal = Clustal
184 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
185 label.colourScheme_clustal = Clustalx
186 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
187 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
188 label.colourScheme_zappo = Zappo
189 label.colourScheme_taylor = Taylor
190 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
191 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
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193 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
194 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
195 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
196 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
197 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
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199 label.blc = BLC
200 label.fasta = Fasta
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202 label.pfam = PFAM
203 label.pileup = Pileup
204 label.pir = PIR
205 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
206 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
207 label.show_annotations = Show annotations
208 label.hide_annotations = Hide annotations
209 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
210 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
211 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
212 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
213 label.hide_all = Hide all
214 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
215 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
216 label.colour_text = Colour Text
217 label.show_non_conserved = Show nonconserved
218 label.overview_window = Overview Window
219 label.none = None
220 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
221 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
222 label.nucleotide = Nucleotide
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224 label.nucleotides = Nucleotides
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229 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
230 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
231 label.input_from_textbox = Input from textbox
232 label.centre_column_labels = Centre column labels
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236 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
237 action.feature_settings = Feature Settings...
238 label.feature_settings = Feature Settings
239 label.all_columns = All Columns
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247 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
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249 label.group_consensus = Group Consensus
250 label.group_conservation = Group Conservation
251 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
252 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
253 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
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255 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
256 label.show_first = Show first
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258 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
259 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
260 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
261 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
262 label.structure_viewer = Default structure viewer
263 label.chimera_path = Path to Chimera program
264 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
265 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
266 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
267 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
268 label.min_colour = Minimum Colour
269 label.max_colour = Maximum Colour
270 label.use_original_colours = Use Original Colours
271 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
272 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
273 label.selection = Selection
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277 label.min = Min:
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279 label.colour_by_label = Colour by label
280 label.new_feature = New Feature
281 label.match_case = Match Case
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283 label.labels = Labels
284 label.output_values = Output Values...
285 label.output_points = Output points...
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287 label.input_data = Input Data...
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293 label.fit_to_window = Fit To Window
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295 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
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302 label.all_chains_visible = All Chains Visible
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304 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
305 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
306 label.removed_columns = Removed {0} columns.
307 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
308 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
309 label.order_by_params = Order by {0}
310 label.html_content = <html>{0}</html>
311 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
312 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
313 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
314 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
315 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
316 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
317 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
318 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
319 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
320 label.paste_your = Paste your
321 label.finished_searching = Finished searching
322 label.search_results= Search results {0} : {1}
323 label.found_match_for = Found match for {0}
324 label.font = Font:
325 label.size = Size:
326 label.style = Style:
327 label.calculating = Calculating....
328 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
329 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
330 label.set_this_label_text = set this label text
331 label.sequences_from = Sequences from {0}
332 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
333 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
334 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
335 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
336 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
337 label.source_to_target = {0} ... {1}
338 label.per_sequence_only= Per-sequence only
339 label.to_file = to File
340 label.to_textbox = to Textbox
341 label.jalview = Jalview
342 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
343 label.status = Status
344 label.channels = Channels
345 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
346 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
347 label.select_das_service_from_table = Select a DAS service from the table to read a full description here.</font></html>
348 label.session_update = Session Update
349 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
350 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
351 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
352 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
353 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
354 label.groovy_console = Groovy Console...
355 label.lineart = Lineart
356 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
357 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
358 label.invert_selection = Invert Selection
359 label.optimise_order = Optimise Order
360 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
361 label.load_colours = Load Colours
362 label.save_colours = Save Colours
363 label.fetch_das_features = Fetch DAS Features
364 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
365 label.database_param = Database: {0}
366 label.example = Example
367 label.example_param = Example: {0}
368 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
369 label.file_format_not_specified = File format not specified
370 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
371 label.error_saving_file = Error Saving File
372 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
373 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
374 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
375 label.invalid_selection = Invalid Selection
376 label.principal_component_analysis_must_take_least_four_input_sequences = Principal component analysis must take\nat least 4 input sequences.
377 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
378 label.you_need_more_two_sequences_selected_build_tree = You need to have more than two sequences selected to build a tree!
379 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
380 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
381 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
382 label.sequences_must_be_aligned_before_creating_tree = The sequences must be aligned before creating a tree.\nTry using the Pad function in the edit menu,\n or one of the multiple sequence alignment web services.
383 label.sequences_not_aligned = Sequences not aligned
384 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
385 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
386 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
387 label.translation_failed = Translation Failed
388 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
389 label.implementation_error  = Implementation error:
390 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
391 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
392 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
393 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
394 label.view_name_original = Original
395 label.enter_view_name = Enter View Name
396 label.enter_label = Enter label
397 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
398 label.pdb_entry_is_already_displayed = {0} is already displayed.\nDo you want to re-use this viewer ?
399 label.map_sequences_to_visible_window = Map Sequences to Visible Window: {0}
400 label.add_pdbentry_to_view = Do you want to add {0} to the view called\n{1}\n
401 label.align_to_existing_structure_view = Align to existing structure view
402 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
403 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
404 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
405 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
406 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
407 label.error_parsing_text = Error parsing text
408 label.enter_local_das_source = Enter Nickname & URL of Local DAS Source
409 label.you_can_only_edit_or_remove_local_das_sources = You can only edit or remove local DAS Sources!
410 label.public_das_source = Public DAS source - not editable
411 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
412 label.input_alignment = Input Alignment
413 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
414 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
415 label.couldnt_locate = Couldn't locate {0}
416 label.url_not_found = URL not found
417 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
418 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
419 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
420 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
421 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
422 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
423 label.invalid_url = Invalid URL !
424 label.error_loading_file = Error loading file
425 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
426 label.file_open_error = File open error
427 label.no_das_sources_selected_warn = No das sources were selected.\nPlease select some sources and\ntry again.
428 label.no_das_sources_selected_title = No DAS Sources Selected
429 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
430 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
431 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
432 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
433 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
434 label.alignment_props = Alignment Properties
435 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
436 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
437 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
438 label.annotations = Annotations
439 label.structure_options = Structure Options
440 label.features = Features
441 label.overview_params = Overview {0}
442 label.paste_newick_file = Paste Newick file
443 label.load_tree_from_file = From File - 
444 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
445 label.selection_output_command = Selection output - {0}
446 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
447 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
448 label.pca_details = PCA details
449 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
450 label.user_defined_colours = User defined colours
451 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
452 label.jaview_build_date = Build date: {0}
453 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
454 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
455 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
456 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
457 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
458 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
459 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
460 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
461 label.right_click = Right click
462 label.to_add_annotation = to add annotation
463 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
464 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
465 label.label = Label
466 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
467 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
468 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
469 label.calculating_pca= Calculating PCA
470 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
471 label.jalview_applet = Jalview applet
472 label.loading_data = Loading data
473 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
474 label.calculating_tree = Calculating tree
475 label.state_queueing = queuing
476 label.state_running = running
477 label.state_completed = finished
478 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
479 label.state_job_error = job error!
480 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
481 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
482 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
483 label.structure_type = Structure type
484 label.settings_for_type = Settings for {0}
485 label.view_full_application = View in Full Application
486 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
487 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
488 label.export_features = Export Features...
489 label.export_annotations = Export Annotations...
490 label.to_upper_case = To Upper Case
491 label.to_lower_case = To Lower Case
492 label.toggle_case = Toggle Case
493 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
494 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
495 label.edit_sequence = Edit Sequence
496 label.edit_sequences = Edit Sequences
497 label.sequence_details = Sequence Details
498 label.jmol_help = Jmol Help
499 label.chimera_help = Chimera Help
500 label.close_viewer = Close Viewer
501 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
502 label.all = All
503 label.sort_by = Sort alignment by
504 label.sort_by_score = Sort by Score
505 label.sort_by_density = Sort by Density
506 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
507 label.sort_ann_by = Sort annotations by
508 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
509 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
510 label.reveal = Reveal
511 label.hide_columns = Hide Columns
512 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
513 label.load_tree_file = Load a tree file
514 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
515 label.standard_databases = Standard Databases
516 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
517 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
518 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
519 label.connect_to_session = Connect to session {0}
520 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
521 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
522 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
523 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
524 label.adjust_threshold = Adjust threshold
525 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
526 label.display_features_same_type_different_label_using_different_colour = Display features of the same type with a different label using a different colour. (e.g. domain features)
527 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
528 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
529 label.open_url_param = Open URL {0}
530 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
531 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
532 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
533 label.dark_colour = Dark Colour
534 label.light_colour = Light Colour
535 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
536 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
537 label.copy_format_from = Copy format from
538 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
539 label.select_all_views = Select all views
540 label.select_many_views = Select many views
541 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
542 label.open_local_file = Open local file
543 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
544 label.listen_for_selections = Listen for selections
545 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
546 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
547 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
548 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
549 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
550 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
551 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
552 label.no_services = <No Services>
553 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
554 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
555 label.connect_to = Connect to
556 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
557 label.from_url = from URL
558 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
559 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
560 label.from_textbox = from Textbox
561 label.window = Window
562 label.preferences = Preferences
563 label.tools = Tools
564 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
565 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
566 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
567 label.collect_garbage = Collect Garbage
568 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
569 label.show_java_console = Show Java Console
570 label.show_jalview_news = Show Jalview News
571 label.take_snapshot = Take snapshot
572 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
573 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
574 label.monospaced_font= Monospaced
575 label.quality = Quality
576 label.maximize_window = Maximize Window
577 label.conservation = Conservation
578 label.consensus = Consensus
579 label.histogram = Histogram
580 label.logo = Logo
581 label.non_positional_features = List Non-positional Features
582 label.database_references = List Database References
583 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
584 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
585 label.gap_symbol = Gap Symbol
586 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
587 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
588 label.address = Address
589 label.port = Port
590 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
591 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
592 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
593 label.check_for_latest_version = Check for latest version
594 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
595 label.use_proxy_server = Use a proxy server
596 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
597 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
598 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
599 label.smooth_font = Smooth Font
600 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
601 label.pad_gaps = Pad Gaps
602 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
603 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
604 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
605 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
606 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
607 label.right_align_ids = Right Align Ids
608 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
609 label.open_overview = Open Overview
610 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
611 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
612 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
613 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
614 label.visual = Visual
615 label.connections = Connections
616 label.output = Output
617 label.editing = Editing
618 label.das_settings = DAS Settings
619 label.web_services = Web Services
620 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
621 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
622 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
623 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
624 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
625 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
626 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
627 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
628 label.new_service_url = New Service URL
629 label.edit_service_url = Edit Service URL
630 label.delete_service_url = Delete Service URL
631 label.details = Details
632 label.options = Options
633 label.parameters = Parameters
634 label.available_das_sources = Available DAS Sources
635 label.full_details = Full Details
636 label.authority = Authority
637 label.type = Type
638 label.proxy_server = Proxy Server
639 label.file_output = File Output
640 label.select_input_type = Select input type
641 label.set_options_for_type = Set options for type
642 label.data_input_parameters = Data input parameters
643 label.data_returned_by_service = Data returned by service
644 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
645 label.parsing_errors = Parsing errors
646 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
647 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
648 label.input_parameter_name = Input Parameter name
649 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
650 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
651 label.brief_description_service = Brief description of service
652 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
653 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
654 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
655 label.gap_character = Gap character
656 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
657 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
658 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
659 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
660 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
661 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
662 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
663 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
664 label.input_output = Input/Output
665 label.cut_paste = Cut'n'Paste
666 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
667 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
668 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
669 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
670 label.from_file = From File
671 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
672 label.text_colour = Text Colour
673 action.set_text_colour = Text Colour...
674 label.structure = Structure
675 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
676 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
677 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
678 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
679 label.sequence_name = Sequence Name
680 label.sequence_description = Sequence Description
681 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
682 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
683 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
684 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
685 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
686 label.web_browser_not_found = Web browser not found
687 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
688 label.html = HTML
689 label.wrap = Wrap
690 label.show_database_refs = Show Database Refs
691 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
692 label.save_png_image = Save As PNG Image
693 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
694 label.export_image = Export Image
695 label.vamsas_store = VAMSAS store
696 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
697 label.reverse = Reverse
698 label.reverse_complement = Reverse Complement
699 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
700 label.extract_scores = Extract Scores
701 label.get_cross_refs = Get Cross-References
702 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
703 label.add_sequences = Add Sequences
704 label.new_window = New Window
705 label.split_window = Split Window
706 label.refresh_available_sources = Refresh Available Sources
707 label.use_registry = Use Registry
708 label.add_local_source = Add Local Source
709 label.set_as_default = Set as Default
710 label.show_labels = Show labels
711 action.background_colour = Background Colour...
712 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
713 label.jalview_pca_calculation = Jalview PCA Calculation
714 label.link_name = Link Name
715 label.pdb_file = PDB file
716 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
717 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
718 label.superpose_structures = Superpose Structures
719 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
720 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
721 label.jmol = Jmol
722 label.chimera = Chimera
723 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
724 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
725 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
726 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
727 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
728 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
729 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
730 label.case_sensitive = Case Sensitive
731 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
732 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
733 label.index_by_host = Index by Host
734 label.index_by_type = Index by Type
735 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
736 label.display_warnings = Display Warnings
737 label.move_url_up = Move URL Up
738 label.move_url_down = Move URL Down
739 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
740 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
741 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
742 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
743 label.sequences_updated = Sequences updated
744 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
745 label.show_all_chains = Show all chains
746 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
747 label.paste_new_window = Paste To New Window
748 label.settings_for_param = Settings for {0}
749 label.view_params = View {0}
750 label.aacon_calculations = AACon Calculations
751 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
752 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
753 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
754 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
755 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
756 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
757 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
758 label.all_views = All Views
759 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
760 label.realign_with_params = Realign with {0}
761 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
762 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
763 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
764 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
765 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
766 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
767 label.view_documentation = View documentation
768 label.select_return_type = Select return type
769 label.translation_of_params = Translation of {0}
770 label.features_for_params = Features for - {0}
771 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
772 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
773 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
774 label.varna_params = VARNA - {0}
775 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
776 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
777 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
778 label.points_for_params = Points for {0}
779 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
780 label.graduated_color_for_params = Graduated Feature Colour for {0}
781 label.select_background_colour = Select Background Colour
782 label.invalid_font = Invalid Font
783 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
784 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
785 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
786 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
787 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
788 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
789 label.example_query_param = Example query: {0}
790 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
791 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
792 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
793 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
794 label.select_columns_containing = Select columns containing
795 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
796 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
797 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
798 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
799 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
800 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
801 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
802 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
803 label.use_sequence_id_4 = 
804 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
805 label.switch_server = Switch server
806 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
807 label.services_at = Services at {0}
808 label.rest_client_submit = {0} using {1}
809 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
810 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
811 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
812 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
813 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
814 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
815 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
816 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
817 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
818 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
819 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
820 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
821 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
822 label.user_preset = User Preset
823 label.service_preset = Service Preset
824 label.run_with_preset = Run {0} with preset
825 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
826 action.by_title_param = By {0}
827 label.source_from_db_source = Sources from {0}
828 label.from_msname = from {0}
829 label.superpose_with = Superpose with
830 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
831 label.add_new_row = Add New Row
832 label.edit_label_description = Edit Label/Description
833 label.hide_row = Hide This Row
834 label.delete_row = Delete This Row
835 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
836 label.export_annotation = Export Annotation
837 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
838 label.helix = Helix
839 label.sheet = Sheet
840 label.rna_helix = RNA Helix
841 label.remove_annotation = Remove Annotation
842 label.colour_by = Colour by...
843 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
844 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
845 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
846 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
847 label.multiharmony = Multi-Harmony
848 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
849 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
850 label.prompt_each_time = Prompt each time
851 label.use_source = Use Source
852 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
853 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
854 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
855 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
856 label.pca_sequences_not_aligned = The sequences must be aligned before calculating PCA.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
857 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
858 label.invalid_name = Invalid name
859 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
860 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
861 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
862 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
863 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
864 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
865 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
866 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
867 label.feature_type = Feature Type
868 label.display = Display
869 label.service_url = Service URL
870 label.copied_sequences = Copied sequences
871 label.cut_sequences = Cut Sequences
872 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
873 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
874 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
875 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
876 label.save_features_to_file = Save Features to File
877 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
878 label.no_features_on_alignment = No features found on alignment
879 label.save_pdb_file = Save PDB File
880 label.save_text_to_file = Save Text to File
881 label.save_state = Save State
882 label.restore_state = Restore State
883 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
884 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
885 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
886 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
887 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
888 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
889 label.select_startup_file = Select startup file
890 label.select_default_browser = Select default web browser
891 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
892 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
893 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
894 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
895 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
896 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
897 label.save_as_html = Save as HTML
898 label.recently_opened = Recently Opened
899 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
900 label.tree_from = Tree from {0}
901 label.webservice_job_title = {0} using {1}
902 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
903 label.visible = Visible
904 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
905 label.visible_region_of = visible region of
906 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
907 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
908 label.loading_file = Loading File: {0}
909 label.edit_params = Edit {0}
910 error.not_implemented = Not implemented
911 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
912 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
913 error.implementation_error_sortbyfeature = Implementation Error - sortByFeature method must be one of FEATURE_SCORE, FEATURE_LABEL or FEATURE_DENSITY.
914 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
915 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
916 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
917 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
918 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
919 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
920 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
921 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
922 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
923 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
924 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
925 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
926 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
927 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
928 error.implementation_error = Implementation error
929 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
930 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
931 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
932 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
933 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
934 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
935 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
936 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
937 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
938 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
939 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
940 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
941 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
942 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
943 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
944 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
945 label.cancelled_params = Cancelled {0}
946 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
947 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
948 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
949 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
950 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
951 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
952 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
953 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
954 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
955 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
956 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
957 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
958 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
959 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
960 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
961 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
962 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
963 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
964 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
965 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
966 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
967 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
968 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
969 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
970 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
971 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
972 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
973 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
974 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
975 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
976 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
977 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
978 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
979 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
980 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
981 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
982 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
983 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
984 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
985 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
986 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
987 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
988 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
989 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
990 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
991 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
992 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
993 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
994 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
995 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
996 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
997 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
998 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
999 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1000 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
1001 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1002 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1003 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1004 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1005 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1006 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1007 label.toggled = Toggled
1008 label.marked = Marked
1009 label.containing = containing
1010 label.not_containing = not containing
1011 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1012 label.submission_params = Submission {0}
1013 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1014 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1015 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1016 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1017 label.pca_calculating = Calculating PCA
1018 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1019 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1020 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1021 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1022 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1023 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1024 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1025 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1026 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1027 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1028 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1029 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1030 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1031 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1032 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1033 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1034 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1035 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1036 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1037 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1038 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1039 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1040 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1041 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1042 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1043 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1044 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1045 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1046 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1047 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1048 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1049 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1050 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1051 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1052 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1053 label.mapped = mapped
1054 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1055 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1056 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1057 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1058 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1059 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1060 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1061 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1062 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1063 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1064 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1065 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1066 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1067 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1068 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1069 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1070 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1071 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1072 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1073 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1074 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1075 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1076 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1077 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
1078 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
1079 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1080 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1081 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1082 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1083 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1084 label.remove_gaps = Remove Gaps
1085 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1086 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1087 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1088 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1089 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1090 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1091 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1092 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1093 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1094 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1095 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1096 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1097 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1098 warn.service_not_supported = Service not supported!
1099 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1100 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1101 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1102 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1103 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1104 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1105 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1106 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1107 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1108 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1109 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1110 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1111 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1112 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1113 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1114 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1115 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1116 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1117 label.eps_file = EPS file
1118 label.png_image = PNG image
1119 status.saving_file = Saving {0}
1120 status.export_complete = {0} Export completed.
1121 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1122 status.refreshing_news = Refreshing news
1123 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1124 status.opening_params = Opening {0}
1125 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1126 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1127 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1128 status.finshed_querying = Finished querying
1129 status.parsing_results = Parsing results.
1130 status.processing = Processing...
1131 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1132 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1133 status.fetching_das_sequence_features = Fetching DAS Sequence Features
1134 status.no_das_sources_active = No DAS Sources Active
1135 status.das_feature_fetching_cancelled = DAS Feature Fetching Cancelled
1136 status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
1137 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1138 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1139 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1140 status.opening_file_for = opening file for
1141 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1142 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1143 label.font_too_small = Font size is too small
1144 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1145 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1146 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1147 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1148 label.out_of_memory = Out of memory
1149 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1150 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1151 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1152 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1153 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1154 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1155 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1156 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1157 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1158 label.test_server = Test Server?
1159 info.you_want_jalview_to_find_uniprot_accessions = Do you want Jalview to find\nUniprot Accession ids for given sequence names?
1160 label.find_uniprot_accession_ids = Find Uniprot Accession Ids
1161 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1162 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1163 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1164 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1165 label.file_already_exists = File exists
1166 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1167 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1168 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1169 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1170 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1171 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1172 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1173 label.delete_all = Delete all sequences
1174 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1175 label.add_annotations_for = Add annotations for
1176 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1177 label.choose_annotations = Choose Annotations
1178 label.find = Find
1179 label.invalid_search = Search string invalid
1180 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1181 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1182 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1183 label.show_group_logo = Show Group Logo
1184 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1185 label.show_histogram = Show Histogram
1186 label.show_logo = Show Logo
1187 label.normalise_logo = Normalise Logo
1188 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1189 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1190 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1191 label.open_split_window = Open split window
1192 action.no = No
1193 action.yes = Yes
1194 label.for = for
1195 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1196 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1197 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1198 label.alpha_helix = Alpha Helix
1199 label.beta_strand = Beta Strand
1200 label.turn = Turn
1201 label.select_all = Select All
1202 label.structures_filter = Structures Filter
1203 label.search_filter = Search Filter
1204 label.include_description= Include Description
1205 action.back = Back
1206 label.hide_insertions = Hide Insertions
1207 label.mark_as_representative = Mark as representative
1208 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1209 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1210 label.result = result
1211 label.results = results
1212 label.structure_chooser = Structure Chooser
1213 label.select = Select : 
1214 label.invert = Invert 
1215 label.select_pdb_file = Select PDB File
1216 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1217 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1218 label.search_result = Search Result
1219 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1220 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1221 label.start_jalview = Start Jalview
1222 label.biojs_html_export = BioJS
1223 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1224 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1225 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1226 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1227 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1228 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1229 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1230 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1231 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1232 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1233 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1234 action.export_groups = Export Groups
1235 action.export_annotations = Export Annotations
1236 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1237 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1238 action.export_features = Export Features
1239 label.export_settings = Export Settings
1240 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1241 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1242 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1243 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1244 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1245 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1246 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1247 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1248 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1249 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1250 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1251 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1252 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1253 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1254 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1255 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1256 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1257 label.run_groovy = Run Groovy console script
1258 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1259 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1260 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1261 action.next_page= >> 
1262 action.prev_page= << 
1263 label.next_page_tooltip=Next Page
1264 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1265 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1266 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1267 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1268 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1269 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1270 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1271 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1272 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1273 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1274 label.column = Column
1275 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1276 label.operation_failed = Operation failed
1277 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1278 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1279 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1280 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1281 exception.url_cannot_have_miriam_id = {0} is a MIRIAM id and cannot be used as a custom url name
1282 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1283 label.filter = Filter text:
1284 action.customfilter = Custom only
1285 action.showall = Show All
1286 label.insert = Insert:
1287 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1288 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1289 label.primary = Double Click
1290 label.inmenu = In Menu
1291 label.id = ID
1292 label.database = Database
1293 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1294 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1295 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1296 label.invalid_name = Invalid Name !
1297 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1298 label.urllinks = Links
1299 label.togglehidden = Toggle hidden columns on/off