site-resources/javascript/JalviewApplet.js

   1 Jalview = {}
   2
   3
   4 $(document).ready(function() {
   5         Jalview.processAllAppletElements();
   6 });
   7
   8
   9 var currentPage = "applets";
  10
  11 Jalview.processAllAppletElements = function() {
  12         var apps = document.getElementsByTagName("applet");
  13         for (var i = apps.length; --i >= 0;) {
  14                 processAppletElement(apps[i]);
  15         }
  16 }
  17
  18 Jalview.jvid = 0;
  19
  20 Jalview.doStartJalview = function(e) {
  21         var element = e.target.appletElement;
  22         var text = element.outerHTML;
  23
  24         var Info = self.JalviewInfo || {
  25 code: null,
  26 main: "jalview.bin.Jalview",
  27 core: "NONE",
  28         width: 850,
  29         height: 550,
  30         readyFunction: null,
  31         serverURL: 'https://chemapps.stolaf.edu/jmol/jsmol/php/jsmol.php',
  32         j2sPath: 'swingjs/j2s',
  33         console:'sysoutdiv',
  34         allowjavascript: true
  35         }
  36
  37 var addParam = function(key,value) {
  38         args.push("name=\"" + key + "\" value=\"" + value + "\"");
  39 }
  40
  41 var id = "JVApplet" + jvid++;
  42 var args = text.replace(/[\n\t]/g, " ").split("<param ");
  43 Info.j2sAppletID = i;
  44 Info.j2sAppletID = id;
  45 Info.jalview_SCREEN_X= 10,
  46 Info.jalview_SCREEN_Y= 10;
  47 //Info.jalview_EMBEDDED= true;
  48
  49
  50 Info.jalview_SCREEN_WIDTH = 400;
  51 Info.jalview_SCREEN_HEIGHT = 100;
  52 for (var i in Info) {
  53         var v = ("" + Info[i] || "null").replace(/\"/g,"'");
  54         addParam(args, "Info." + i, v);
  55 }
  56         Info.args = args;
  57         SwingJS.getApplet(id, Info);
  58         document.title = id;
  59         e.target.style.visibility="hidden";
  60 }
  61
  62 Jalview.processAppletElement = function(element) {
  63 var code = element.getAttribute("code");
  64 var parent = element.parentElement;
  65 if (code == "jalview.bin.JalviewLite") {
  66                 var text = element.outerHTML;
  67                 console.log(text);
  68                 var btn = document.createElement("button");
  69                 btn.innerHTML = "Start Jalview";
  70                 var a = element.getAttribute("width");
  71                 btn.style.width = (a || 140) + "px";
  72                 a = element.getAttribute("height");
  73                 btn.style.height = (a || 25) + "px";
  74         btn.appletElement = element;
  75         parent.replaceChild(btn, element);
  76         $(btn).click(doStartJalview)
  77 } else {
  78         parent.removeElement(element);
  79 }
  80 }
  81
  82
  83  /**
  84  * Generate an applet tag
  85  *
  86  * @param code
  87  * @param name
  88  * @param archive
  89  * @param width
  90  * @param height
  91  * @param params
  92  * @returns a DOM APPLET element
  93  */
  94
  95 Jalview.createAppletTag = function(code, name, archive, width, height, params){
  96         var app = document.createElement('applet');
  97         app.code= code;
  98         app.width = width;
  99         app.height = height;
 100         app.archive = archive;
 101
 102         var arrayLength = params.length;
 103         for (var i = 0; i < arrayLength; i++) {
 104          //console.log('name : '+ params[i][0] + ' code : '+ params[i][1]);
 105          var param = document.createElement('param');
 106          param.name = params[i][0];
 107          param.value = params[i][1];
 108          app.appendChild(param);
 109         }
 110         return app;
 111 }
 112