src/MCview/Residue.java

   1 /*
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  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package MCview;
  22
  23 import java.util.Vector;
  24
  25 public class Residue
  26 {
  27   Vector<Atom> atoms;
  28
  29   int number;
  30
  31   int count;
  32
  33   public Residue(Vector<Atom> resAtoms, int number, int count)
  34   {
  35     this.atoms = resAtoms;
  36     this.number = number;
  37     this.count = count;
  38   }
  39
  40   public Atom findAtom(String name)
  41   {
  42     for (Atom atom : atoms)
  43     {
  44       if (atom.name.equals(name))
  45       {
  46         return atom;
  47       }
  48     }
  49
  50     return null;
  51   }
  52
  53   public Vector<Atom> getAtoms()
  54   {
  55     return this.atoms;
  56   }
  57 }