src/MCview/myAtom.java

   1 package MCview;\r
   2 \r
   3 import java.util.*;\r
   4 import java.awt.*;\r
   5 \r
   6 public class myAtom {\r
   7   float x;\r
   8   float y;\r
   9   float z;\r
  10 \r
  11   public int     number;\r
  12   public String  name;\r
  13   public String  resName;\r
  14   public int     resNumber;\r
  15   public int     type;\r
  16   public Color   color;\r
  17   public String  chain;\r
  18   public boolean isSelected = false;\r
  19 \r
  20   public myAtom(StringTokenizer str) {\r
  21 \r
  22     this.number  = (new Integer(str.nextToken())).intValue();\r
  23     this.name    = str.nextToken();\r
  24     this.resName = str.nextToken();\r
  25 \r
  26     String tmpstr = new String();\r
  27 \r
  28     try {\r
  29       tmpstr         = str.nextToken();\r
  30       this.resNumber = (new Integer(tmpstr).intValue());\r
  31       this.chain     = "A";\r
  32       this.color     = Color.lightGray;\r
  33 \r
  34     } catch(NumberFormatException e) {\r
  35       this.chain = tmpstr;\r
  36 \r
  37       if (tmpstr.equals("A")) {\r
  38         this.color = Color.lightGray;\r
  39 \r
  40       } else {\r
  41         this.color = Color.red;\r
  42       }\r
  43 \r
  44       this.resNumber = (new Integer(str.nextToken()).intValue());\r
  45     }\r
  46 \r
  47     this.x = (float)(new Float(str.nextToken()).floatValue());\r
  48     this.y = (float)(new Float(str.nextToken()).floatValue());\r
  49     this.z = (float)(new Float(str.nextToken()).floatValue());\r
  50   }\r
  51 \r
  52   public void setColor(Color col) {\r
  53     this.color = col;\r
  54   }\r
  55 }\r