src/castor.properties

   1 ###############################################################################
   2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3 # Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4 #
   5 # This file is part of Jalview.
   6 #
   7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10 #
  11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15 #
  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17 # The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18 ###############################################################################
  19 # THE CASTOR PROPERTIES FILE
  20 # This file specifies values for Castor run-time which may be configured
  21 # by the user.
  22 # $Id$
  23
  24 # This section defines Backwards compatibility switches.
  25 #
  26 # Hashtable/Map default mapping.
  27 # For backward compatibility with 0.9.5.2 and earlier.
  28 #
  29 #org.exolab.castor.xml.saveMapKeys=false
  30
  31 # Defines the default XML parser to be used by Castor.
  32 # The parser must implement org.xml.sax.Parser.
  33 #
  34 org.exolab.castor.parser=org.apache.xerces.parsers.SAXParser
  35
  36 # Defines the (default) XML serializer factory to use by Castor, which must
  37 # implement org.exolab.castor.xml.SerializerFactory; default is
  38 # org.exolab.castor.xml.XercesXMLSerializerFactory
  39 #
  40 # When using Castor XML with JDK 5.0, you may switch to the XercesJDK5XMLSerializerFactory
  41 # which will use the Xerces instance as shipped with the JDK itself; this avoids
  42 # having to download another Xerces instance and installing it.
  43 org.exolab.castor.xml.serializer.factory=org.exolab.castor.xml.XercesXMLSerializerFactory
  44 #org.exolab.castor.xml.serializer.factory=org.exolab.castor.xml.XercesJDK5XMLSerializerFactory
  45
  46 # Defines the NodeType for use with Java primitive types (int, long, boolean,
  47 # etc). This value is only used by the Introspector.  Valid values are either
  48 # "attribute" or "element". By default, all primitives are marshaled as
  49 # attributes. Uncomment the following line to change the NodeType to element.
  50 #
  51 #org.exolab.castor.xml.introspector.primitive.nodetype=element
  52
  53 # Defines the Naming "style" or conventions to use when creating XML names
  54 # from Java class or field names.
  55 # Valid values are as follows:
  56 # -----------------------------------------------------------------
  57 # lower (default)  |  All names are lowercase with hyphens
  58 #                  |  separating words.
  59 #                  |
  60 #                  |  Example: personInfo = person-info
  61 # -----------------------------------------------------------------
  62 # mixed            |  All names are mixed case, with Uppercase
  63 #                  |  character as the first letter of a new word.
  64 #                  |
  65 #                  |  Example: personInfo = personInfo
  66 #                  |  Example: FooBar     = fooBar
  67 # -----------------------------------------------------------------
  68 # {Any ClassName}  |  Any Class which implements
  69 #                  |  org.exolab.castor.xml.XMLNaming
  70 # -----------------------------------------------------------------
  71 #
  72 # By default, all names are treated as the "lower" option.  To preserve the
  73 # Java mixed-case conventions, uncomment the following line.
  74 #
  75 #org.exolab.castor.xml.naming=mixed
  76
  77 ###############################
  78 # REGULAR EXPRESSION EVALUATORS
  79 #
  80 # Defines the Regular Expression Evaluator to be used by Castor.
  81 # The evaluator must implement org.exolab.castor.util.RegExpEvaluator.
  82 #
  83 # Uncomment the following to basically suppress Regular expressions evaluation:
  84 #org.exolab.castor.regexp=org.exolab.castor.xml.util.AlwaysTrueRegExpEvaluator
  85 #
  86 # An implementation which uses the Jakarta RegExp library:
  87 #org.exolab.castor.regexp=org.exolab.castor.util.JakartaRegExpEvaluator
  88 #
  89 # An implementation which uses the Jakarta ORO library:
  90 org.exolab.castor.regexp=org.exolab.castor.util.JakartaOroEvaluator
  91
  92 # True if all documents should be indented on output by default.
  93 # Defaults to false.
  94 #
  95 #org.exolab.castor.indent=true
  96
  97 # True if xml documents should be validated by the SAX Parser
  98 # Defaults to false.
  99 #
 100 org.exolab.castor.parser.validation=false
 101
 102 # True for parser to support Namespaces.
 103 # Defaults to false.
 104 #
 105 org.exolab.castor.parser.namespaces=false
 106
 107 # True if all documents should be validated by the marshaling framework
 108 # Defaults to true.
 109 #
 110 org.exolab.castor.marshalling.validation=true
 111
 112 # Comma separated list of SAX 2 features that should be enabled for the
 113 # default parser.
 114 #
 115 #org.exolab.castor.sax.features=
 116
 117 # Comma separated list of SAX 2 features that should be disabled for the
 118 # default parser.
 119 #
 120 #org.exolab.castor.sax.features-to-disable
 121
 122 # True if debugging output should be generated.
 123 # Defaults to false.
 124 #
 125 org.exolab.castor.debug=false
 126
 127 # List of collection handlers for Java 1.1 and Java 1.2 run-times:
 128 #
 129 org.exolab.castor.mapping.collections=\
 130   org.exolab.castor.mapping.loader.J1CollectionHandlers,\
 131   org.exolab.castor.mapping.loader.J2CollectionHandlers
 132
 133 # List of persistence factories for the supported database servers:
 134 #
 135 org.exolab.castor.jdo.engines=\
 136   org.exolab.castor.jdo.drivers.OracleFactory,\
 137   org.exolab.castor.jdo.drivers.PostgreSQLFactory,\
 138   org.exolab.castor.jdo.drivers.SybaseFactory,\
 139   org.exolab.castor.jdo.drivers.SQLServerFactory,\
 140   org.exolab.castor.jdo.drivers.DB2Factory,\
 141   org.exolab.castor.jdo.drivers.InformixFactory,\
 142   org.exolab.castor.jdo.drivers.HsqlFactory,\
 143   org.exolab.castor.jdo.drivers.InstantDBFactory,\
 144   org.exolab.castor.jdo.drivers.InterbaseFactory,\
 145   org.exolab.castor.jdo.drivers.MySQLFactory,\
 146   org.exolab.castor.jdo.drivers.SapDbFactory,\
 147   org.exolab.castor.jdo.drivers.GenericFactory,\
 148   org.exolab.castor.jdo.drivers.DerbyFactory,\
 149   org.castor.jdo.drivers.PointbaseFactory,\
 150   org.castor.jdo.drivers.ProgressFactory
 151
 152 # List of key generator factories:
 153 #
 154 org.exolab.castor.jdo.keyGeneratorFactories=\
 155   org.exolab.castor.jdo.keygen.MaxKeyGeneratorFactory,\
 156   org.exolab.castor.jdo.keygen.HighLowKeyGeneratorFactory,\
 157   org.exolab.castor.jdo.keygen.IdentityKeyGeneratorFactory,\
 158   org.exolab.castor.jdo.keygen.SequenceKeyGeneratorFactory,\
 159   org.exolab.castor.jdo.keygen.UUIDKeyGeneratorFactory
 160
 161 # Collection handlers for the source code generator:
 162 #
 163 org.exolab.castor.builder.type.j2=\
 164   org.exolab.castor.builder.FieldInfoFactoryJ2
 165 org.exolab.castor.builder.type.j1=\
 166   org.exolab.castor.builder.FieldInfoFactory
 167 org.exolab.castor.builder.type.odmg=\
 168   org.exolab.castor.builder.FieldInfoFactoryODMG30
 169
 170 # Configures the default time zone to apply to dates/times fetched from
 171 # database fields (if not already part of the data).  Specify same format as
 172 # in java.util.TimeZone.getTimeZone, or the empty string to use the computer's
 173 # local time zone. Please see http://de.wikipedia.org/wiki/Zeitzone for
 174 # detailed information about time zones.
 175 #
 176 org.exolab.castor.jdo.defaultTimeZone=
 177 #org.exolab.castor.jdo.defaultTimeZone=GMT-8:00
 178
 179 # List of TxSynchronizeable implementations:
 180 #
 181 #org.exolab.castor.persist.TxSynchronizable=
 182
 183 # Sets the buffer size in bytes for fetching LOBs (this is dependent upon
 184 # the JDBC driver implementation).  The value below == 5k.
 185 #
 186 org.exolab.castor.jdo.lobBufferSize=5120
 187
 188 # True if database configuration should be initalization
 189 # when loading it (default: true).
 190 #
 191 #org.exolab.castor.jdo.DatabaseInitializeAtLoad=true
 192
 193 # True if proxy classes should be used for JDBC connections and
 194 # prepared statements.
 195 # Defaults to true.
 196 #
 197 org.exolab.castor.persist.useProxies=false
 198
 199 # MappingLoader implementations:
 200 #
 201 org.castor.mapping.loaderFactories=\
 202   org.castor.mapping.JDOMappingLoaderFactory,\
 203   org.castor.mapping.XMLMappingLoaderFactory
 204
 205 # Cache implementations:
 206 #
 207 org.castor.cache.Factories=\
 208   org.castor.cache.simple.NoCacheFactory,\
 209   org.castor.cache.simple.TimeLimitedFactory,\
 210   org.castor.cache.simple.CountLimitedFactory,\
 211   org.castor.cache.simple.UnlimitedFactory,\
 212   org.castor.cache.distributed.FKCacheFactory,\
 213   org.castor.cache.distributed.JcsCacheFactory,\
 214   org.castor.cache.distributed.JCacheFactory,\
 215   org.castor.cache.distributed.CoherenceCacheFactory,\
 216   org.castor.cache.distributed.OsCacheFactory,\
 217   org.castor.cache.hashbelt.FIFOHashbeltFactory,\
 218   org.castor.cache.hashbelt.LRUHashbeltFactory,\
 219   org.castor.cache.distributed.EHCacheFactory,\
 220   org.castor.cache.distributed.GigaspacesCacheFactory
 221
 222 # TransactionManagerFactory implementations:
 223 #
 224 org.castor.transactionmanager.Factories=\
 225   org.castor.transactionmanager.WebSphereTransactionManagerFactory,\
 226   org.castor.transactionmanager.WebSphere5TransactionManagerFactory,\
 227   org.castor.transactionmanager.WebSphere51TransactionManagerFactory,\
 228   org.castor.transactionmanager.LocalTransactionManagerFactory,\
 229   org.castor.transactionmanager.JNDIENCTransactionManagerFactory,\
 230   org.castor.transactionmanager.JOTMTransactionManagerFactory
 231
 232 # Selects whether the TransactionManager should be initialized at registration,
 233 # or lazily when requested for the first time.
 234 # Defaults to false.
 235 #
 236 org.castor.transactionmanager.InitializeAtRegistration=false
 237
 238 # Instructs Castor JDO to use the JDBC 3.0-specific features to obtain
 239 # the generated value of an identity column.
 240 # Defaults to false.
 241 #
 242 org.castor.jdo.use.jdbc30=false
 243
 244 # Specifies whether to use ANSI-compliant SQL for MS SQL Server.
 245 # Defaults to false.
 246 #
 247 org.exolab.castor.jdo.sqlserver.ansi-compliant=false
 248
 249 # Specifyies whether the ClassDescriptorResolver should (automatically) search
 250 # for and consult with package mapping files (.castor.xml) to retrieve class
 251 # descriptor information; on by default.
 252 # Defaults to true.
 253 #
 254 #org.exolab.castor.xml.loadPackageMappings=false