JAL-2629 can now filter by sequence e-value or bit score
[jalview.git] / src / com / stevesoft / pat / lookAhead.java
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2 // This software is now distributed according to
3 // the Lesser Gnu Public License.  Please see
4 // http://www.gnu.org/copyleft/lesser.txt for
5 // the details.
6 //    -- Happy Computing!
7 //
8 package com.stevesoft.pat;
9
10 import java.util.Hashtable;
11
12 /** Implements "(?= )" and "(?! )" */
13 class lookAhead extends Or
14 {
15   boolean reverse;
16
17   lookAhead(boolean b)
18   {
19     reverse = b;
20   }
21
22   public Pattern getNext()
23   {
24     return null;
25   }
26
27   public int nextMatch(int pos, Pthings pt)
28   {
29     Pattern p = super.getNext();
30     if (p != null)
31     {
32       return p.matchInternal(pos, pt);
33     }
34     else
35     {
36       return pos;
37     }
38   }
39
40   public int matchInternal(int pos, Pthings pt)
41   {
42     if (super.matchInternal(pos, pt) >= 0)
43     {
44       if (reverse)
45       {
46         return -1;
47       }
48       else
49       {
50         return nextMatch(pos, pt);
51       }
52     }
53     else
54     {
55       if (reverse)
56       {
57         return nextMatch(pos, pt);
58       }
59       else
60       {
61         return -1;
62       }
63     }
64   }
65
66   String leftForm()
67   {
68     if (reverse)
69     {
70       return "(?!";
71     }
72     else
73     {
74       return "(?=";
75     }
76   }
77
78   public patInt minChars()
79   {
80     return new patInt(0);
81   }
82
83   public patInt maxChars()
84   {
85     return new patInt(0);
86   }
87
88   Pattern clone1(Hashtable h)
89   {
90     lookAhead la = new lookAhead(reverse);
91     h.put(this, la);
92     h.put(la, la);
93     for (int i = 0; i < v.size(); i++)
94     {
95       la.v.addElement(((Pattern) v.elementAt(i)).clone(h));
96     }
97     return la;
98   }
99 }