src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
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  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package ext.vamsas;
  20
  21 public class JpredSoapBindingStub
  22     extends org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.Jpred
  23 {
  24   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  25   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  26   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  27   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  28
  29   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  30
  31   static
  32   {
  33     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[4];
  34     _initOperationDesc1();
  35   }
  36
  37   private static void _initOperationDesc1()
  38   {
  39     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  40     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  41     oper.setName("predict");
  42     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seq"),
  43                       new javax.xml.
  44                       namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Sequence"),
  45                       vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  46                       org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  47     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  48         "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  49     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  50     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "predictReturn"));
  51     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  52     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  53     _operations[0] = oper;
  54
  55     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  56     oper.setName("predictOnMsa");
  57     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "msf"),
  58                       new javax.xml.
  59                       namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
  60                                       "Msfalignment"),
  61                       vamsas.objects.simple.Msfalignment.class,
  62                       org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  63     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  64         "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  65     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  66     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "predictOnMsaReturn"));
  67     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  68     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  69     _operations[1] = oper;
  70
  71     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  72     oper.setName("getpredict");
  73     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  74                       new javax.
  75                       xml.namespace.QName("http://www.w3.org/2001/XMLSchema",
  76                                           "string"), java.lang.String.class,
  77                       org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  78     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  79         "http://simple.objects.vamsas", "Secstructpred"));
  80     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
  81     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getpredictReturn"));
  82     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  83     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  84     _operations[2] = oper;
  85
  86     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  87     oper.setName("getresult");
  88     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  89                       new javax.
  90                       xml.namespace.QName("http://www.w3.org/2001/XMLSchema",
  91                                           "string"), java.lang.String.class,
  92                       org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  93     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  94         "http://simple.objects.vamsas", "JpredResult"));
  95     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
  96     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getresultReturn"));
  97     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  98     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  99     _operations[3] = oper;
 100
 101   }
 102
 103   public JpredSoapBindingStub()
 104       throws org.apache.axis.AxisFault
 105   {
 106     this(null);
 107   }
 108
 109   public JpredSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 110                               javax.xml.rpc.Service service)
 111       throws org.apache.axis.AxisFault
 112   {
 113     this(service);
 114     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 115   }
 116
 117   public JpredSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 118       throws org.apache.axis.AxisFault
 119   {
 120     if (service == null)
 121     {
 122       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 123     }
 124     else
 125     {
 126       super.service = service;
 127     }
 128     java.lang.Class cls;
 129     javax.xml.namespace.QName qName;
 130     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 131     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.
 132         BeanDeserializerFactory.class;
 133     /*java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
 134                  java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 135                  java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 136                  java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 137                  java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 138                  java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 139                  java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 140                  java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;*/
 141     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 142                                           "JpredResult");
 143     cachedSerQNames.add(qName);
 144     cls = vamsas.objects.simple.JpredResult.class;
 145     cachedSerClasses.add(cls);
 146     cachedSerFactories.add(beansf);
 147     cachedDeserFactories.add(beandf);
 148
 149     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 150     cachedSerQNames.add(qName);
 151     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 152     cachedSerClasses.add(cls);
 153     cachedSerFactories.add(beansf);
 154     cachedDeserFactories.add(beandf);
 155
 156     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 157                                           "Secstructpred");
 158     cachedSerQNames.add(qName);
 159     cls = vamsas.objects.simple.Secstructpred.class;
 160     cachedSerClasses.add(cls);
 161     cachedSerFactories.add(beansf);
 162     cachedDeserFactories.add(beandf);
 163
 164     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 165                                           "Msfalignment");
 166     cachedSerQNames.add(qName);
 167     cls = vamsas.objects.simple.Msfalignment.class;
 168     cachedSerClasses.add(cls);
 169     cachedSerFactories.add(beansf);
 170     cachedDeserFactories.add(beandf);
 171
 172     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Sequence");
 173     cachedSerQNames.add(qName);
 174     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 175     cachedSerClasses.add(cls);
 176     cachedSerFactories.add(beansf);
 177     cachedDeserFactories.add(beandf);
 178
 179   }
 180
 181   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 182       throws java.rmi.RemoteException
 183   {
 184     try
 185     {
 186       org.apache.axis.client.Call _call =
 187           (org.apache.axis.client.Call)super.service.createCall();
 188       if (super.maintainSessionSet)
 189       {
 190         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 191       }
 192       if (super.cachedUsername != null)
 193       {
 194         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 195       }
 196       if (super.cachedPassword != null)
 197       {
 198         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 199       }
 200       if (super.cachedEndpoint != null)
 201       {
 202         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 203       }
 204       if (super.cachedTimeout != null)
 205       {
 206         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 207       }
 208       if (super.cachedPortName != null)
 209       {
 210         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 211       }
 212       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 213       while (keys.hasMoreElements())
 214       {
 215         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 216         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 217       }
 218       // All the type mapping information is registered
 219       // when the first call is made.
 220       // The type mapping information is actually registered in
 221       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 222       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 223       synchronized (this)
 224       {
 225         if (firstCall())
 226         {
 227           // must set encoding style before registering serializers
 228           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.
 229                                SOAP11_CONSTANTS);
 230           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 231           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 232           {
 233             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 234             javax.xml.namespace.QName qName =
 235                 (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames.get(i);
 236             java.lang.Class sf = (java.lang.Class)
 237                 cachedSerFactories.get(i);
 238             java.lang.Class df = (java.lang.Class)
 239                 cachedDeserFactories.get(i);
 240             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 241           }
 242         }
 243       }
 244       return _call;
 245     }
 246     catch (java.lang.Throwable _t)
 247     {
 248       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 249           "Failure trying to get the Call object", _t);
 250     }
 251   }
 252
 253   public java.lang.String predict(vamsas.objects.simple.Sequence seq)
 254       throws java.rmi.RemoteException
 255   {
 256     if (super.cachedEndpoint == null)
 257     {
 258       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 259     }
 260     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 261     _call.setOperation(_operations[0]);
 262     _call.setUseSOAPAction(true);
 263     _call.setSOAPActionURI("");
 264     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 265     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "predict"));
 266
 267     setRequestHeaders(_call);
 268     setAttachments(_call);
 269     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 270                                           {seq});
 271
 272     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 273     {
 274       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 275     }
 276     else
 277     {
 278       extractAttachments(_call);
 279       try
 280       {
 281         return (java.lang.String) _resp;
 282       }
 283       catch (java.lang.Exception _exception)
 284       {
 285         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(_resp,
 286             java.lang.String.class);
 287       }
 288     }
 289   }
 290
 291   public java.lang.String predictOnMsa(vamsas.objects.simple.Msfalignment msf)
 292       throws java.rmi.RemoteException
 293   {
 294     if (super.cachedEndpoint == null)
 295     {
 296       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 297     }
 298     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 299     _call.setOperation(_operations[1]);
 300     _call.setUseSOAPAction(true);
 301     _call.setSOAPActionURI("");
 302     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 303     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 304         "predictOnMsa"));
 305
 306     setRequestHeaders(_call);
 307     setAttachments(_call);
 308     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 309                                           {msf});
 310
 311     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 312     {
 313       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 314     }
 315     else
 316     {
 317       extractAttachments(_call);
 318       try
 319       {
 320         return (java.lang.String) _resp;
 321       }
 322       catch (java.lang.Exception _exception)
 323       {
 324         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(_resp,
 325             java.lang.String.class);
 326       }
 327     }
 328   }
 329
 330   public vamsas.objects.simple.Secstructpred getpredict(java.lang.String job_id)
 331       throws java.rmi.RemoteException
 332   {
 333     if (super.cachedEndpoint == null)
 334     {
 335       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 336     }
 337     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 338     _call.setOperation(_operations[2]);
 339     _call.setUseSOAPAction(true);
 340     _call.setSOAPActionURI("");
 341     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 342     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "getpredict"));
 343
 344     setRequestHeaders(_call);
 345     setAttachments(_call);
 346     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 347                                           {job_id});
 348
 349     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 350     {
 351       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 352     }
 353     else
 354     {
 355       extractAttachments(_call);
 356       try
 357       {
 358         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) _resp;
 359       }
 360       catch (java.lang.Exception _exception)
 361       {
 362         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) org.apache.axis.utils.
 363             JavaUtils.convert(_resp, vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
 364       }
 365     }
 366   }
 367
 368   public vamsas.objects.simple.JpredResult getresult(java.lang.String job_id)
 369       throws java.rmi.RemoteException
 370   {
 371     if (super.cachedEndpoint == null)
 372     {
 373       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 374     }
 375     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 376     _call.setOperation(_operations[3]);
 377     _call.setUseSOAPAction(true);
 378     _call.setSOAPActionURI("");
 379     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 380     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "getresult"));
 381
 382     setRequestHeaders(_call);
 383     setAttachments(_call);
 384     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 385                                           {job_id});
 386
 387     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 388     {
 389       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 390     }
 391     else
 392     {
 393       extractAttachments(_call);
 394       try
 395       {
 396         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) _resp;
 397       }
 398       catch (java.lang.Exception _exception)
 399       {
 400         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) org.apache.axis.utils.
 401             JavaUtils.convert(_resp, vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
 402       }
 403     }
 404   }
 405
 406 }