src/ext/vamsas/MuscleWS.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
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   4  *
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  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package ext.vamsas;
  22
  23 public interface MuscleWS extends java.rmi.Remote
  24 {
  25   public vamsas.objects.simple.WsJobId align(
  26           vamsas.objects.simple.SequenceSet seqSet)
  27           throws java.rmi.RemoteException;
  28
  29   public vamsas.objects.simple.Alignment getalign(java.lang.String job_id)
  30           throws java.rmi.RemoteException;
  31
  32   public vamsas.objects.simple.MsaResult getResult(java.lang.String job_id)
  33           throws java.rmi.RemoteException;
  34
  35   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
  36           throws java.rmi.RemoteException;
  37 }