new features or newly shown group features are placed at top of feature stack
[jalview.git] / src / ext / vamsas / MuscleWS.java
1 /**\r
2  * MuscleWS.java\r
3  *\r
4  * This file was auto-generated from WSDL\r
5  * by the Apache Axis 1.2RC2 Nov 16, 2004 (12:19:44 EST) WSDL2Java emitter.\r
6  */\r
7 \r
8 /*\r
9  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
10  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
11  *\r
12  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
13  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
15  * of the License, or (at your option) any later version.\r
16  *\r
17  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
20  * GNU General Public License for more details.\r
21  *\r
22  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
23  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
24  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
25  */\r
26 package ext.vamsas;\r
27 \r
28 public interface MuscleWS\r
29     extends java.rmi.Remote\r
30 {\r
31   public vamsas.objects.simple.WsJobId align(\r
32       vamsas.objects.simple.SequenceSet seqSet)\r
33       throws java.rmi.RemoteException;\r
34 \r
35   public vamsas.objects.simple.Alignment getalign(java.lang.String job_id)\r
36       throws java.rmi.RemoteException;\r
37 \r
38   public vamsas.objects.simple.MsaResult getResult(java.lang.String job_id)\r
39       throws java.rmi.RemoteException;\r
40 \r
41   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)\r
42       throws java.rmi.RemoteException;\r
43 }\r