Mapping to PDB added
[jalview.git] / src / ext / vamsas / MuscleWS.java
1 /**
2  * MuscleWS.java
3  *
4  * This file was auto-generated from WSDL
5  * by the Apache Axis 1.2RC2 Nov 16, 2004 (12:19:44 EST) WSDL2Java emitter.
6  */\r
7 \r
8 /*
9 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
10 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
11 *
12 * This program is free software; you can redistribute it and/or
13 * modify it under the terms of the GNU General Public License
14 * as published by the Free Software Foundation; either version 2
15 * of the License, or (at your option) any later version.
16 *
17 * This program is distributed in the hope that it will be useful,
18 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
19 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
20 * GNU General Public License for more details.
21 *
22 * You should have received a copy of the GNU General Public License
23 * along with this program; if not, write to the Free Software
24 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
25 */\r
26 package ext.vamsas;\r
27 \r
28 public interface MuscleWS extends java.rmi.Remote {\r
29     public vamsas.objects.simple.WsJobId align(\r
30         vamsas.objects.simple.SequenceSet seqSet)\r
31         throws java.rmi.RemoteException;\r
32 \r
33     public vamsas.objects.simple.Alignment getalign(java.lang.String job_id)\r
34         throws java.rmi.RemoteException;\r
35 \r
36     public vamsas.objects.simple.MsaResult getResult(java.lang.String job_id)\r
37         throws java.rmi.RemoteException;\r
38 \r
39     public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)\r
40         throws java.rmi.RemoteException;\r
41 }\r