all alignment sequences associated with a dataset sequence must have start-end update...
[jalview.git] / src / ext / vamsas / MuscleWSService.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)
3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
8  * of the License, or (at your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
13  * GNU General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
18  */
19 /*
20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
21  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
22  *
23  * This program is free software; you can redistribute it and/or
24  * modify it under the terms of the GNU General Public License
25  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
26  * of the License, or (at your option) any later version.
27  *
28  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
29  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
30  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
31  * GNU General Public License for more details.
32  *
33  * You should have received a copy of the GNU General Public License
34  * along with this program; if not, write to the Free Software
35  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
36  */
37 package ext.vamsas;
38
39 public interface MuscleWSService extends javax.xml.rpc.Service
40 {
41   public java.lang.String getMuscleWSAddress();
42
43   public ext.vamsas.MuscleWS getMuscleWS()
44           throws javax.xml.rpc.ServiceException;
45
46   public ext.vamsas.MuscleWS getMuscleWS(java.net.URL portAddress)
47           throws javax.xml.rpc.ServiceException;
48 }