src/ext/vamsas/MuscleWSSoapBindingStub.java

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   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
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  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
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  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
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  36  */
  37 package ext.vamsas;
  38
  39 public class MuscleWSSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
  40         implements ext.vamsas.MuscleWS
  41 {
  42   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  43
  44   static
  45   {
  46     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[4];
  47     _initOperationDesc1();
  48   }
  49
  50   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  51
  52   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  53
  54   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  55
  56   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  57
  58   public MuscleWSSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
  59   {
  60     this(null);
  61   }
  62
  63   public MuscleWSSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
  64           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
  65   {
  66     this(service);
  67     super.cachedEndpoint = endpointURL;
  68   }
  69
  70   public MuscleWSSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
  71           throws org.apache.axis.AxisFault
  72   {
  73     if (service == null)
  74     {
  75       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
  76     }
  77     else
  78     {
  79       super.service = service;
  80     }
  81
  82     java.lang.Class cls;
  83     javax.xml.namespace.QName qName;
  84     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
  85     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
  86     // java.lang.Class enumsf =
  87     // org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
  88     // java.lang.Class enumdf =
  89     // org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
  90     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
  91     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
  92     // java.lang.Class simplesf =
  93     // org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
  94     // java.lang.Class simpledf =
  95     // org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
  96     // java.lang.Class simplelistsf =
  97     // org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
  98     // java.lang.Class simplelistdf =
  99     // org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 100     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 101             "Sequence");
 102     cachedSerQNames.add(qName);
 103     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 104     cachedSerClasses.add(cls);
 105     cachedSerFactories.add(beansf);
 106     cachedDeserFactories.add(beandf);
 107
 108     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_tns1_Sequence");
 109     cachedSerQNames.add(qName);
 110     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;
 111     cachedSerClasses.add(cls);
 112     cachedSerFactories.add(arraysf);
 113     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 114
 115     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 116             "MsaResult");
 117     cachedSerQNames.add(qName);
 118     cls = vamsas.objects.simple.MsaResult.class;
 119     cachedSerClasses.add(cls);
 120     cachedSerFactories.add(beansf);
 121     cachedDeserFactories.add(beandf);
 122
 123     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 124             "SequenceSet");
 125     cachedSerQNames.add(qName);
 126     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;
 127     cachedSerClasses.add(cls);
 128     cachedSerFactories.add(beansf);
 129     cachedDeserFactories.add(beandf);
 130
 131     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 132             "Object");
 133     cachedSerQNames.add(qName);
 134     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;
 135     cachedSerClasses.add(cls);
 136     cachedSerFactories.add(beansf);
 137     cachedDeserFactories.add(beandf);
 138
 139     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 140             "Alignment");
 141     cachedSerQNames.add(qName);
 142     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;
 143     cachedSerClasses.add(cls);
 144     cachedSerFactories.add(beansf);
 145     cachedDeserFactories.add(beandf);
 146
 147     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 148             "WsJobId");
 149     cachedSerQNames.add(qName);
 150     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;
 151     cachedSerClasses.add(cls);
 152     cachedSerFactories.add(beansf);
 153     cachedDeserFactories.add(beandf);
 154
 155     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");
 156     cachedSerQNames.add(qName);
 157     cls = java.lang.String[].class;
 158     cachedSerClasses.add(cls);
 159     cachedSerFactories.add(arraysf);
 160     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 161
 162     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 163     cachedSerQNames.add(qName);
 164     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 165     cachedSerClasses.add(cls);
 166     cachedSerFactories.add(beansf);
 167     cachedDeserFactories.add(beandf);
 168   }
 169
 170   private static void _initOperationDesc1()
 171   {
 172     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
 173     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 174     oper.setName("align");
 175     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seqSet"),
 176             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 177                     "SequenceSet"),
 178             vamsas.objects.simple.SequenceSet.class,
 179             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 180     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 181             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 182     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 183     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "alignReturn"));
 184     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 185     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 186     _operations[0] = oper;
 187
 188     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 189     oper.setName("getalign");
 190     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
 191             new javax.xml.namespace.QName(
 192                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 193             java.lang.String.class,
 194             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 195     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 196             "simple.objects.vamsas", "Alignment"));
 197     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Alignment.class);
 198     oper
 199             .setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
 200                     "getalignReturn"));
 201     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 202     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 203     _operations[1] = oper;
 204
 205     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 206     oper.setName("getResult");
 207     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
 208             new javax.xml.namespace.QName(
 209                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 210             java.lang.String.class,
 211             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 212     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 213             "simple.objects.vamsas", "MsaResult"));
 214     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.MsaResult.class);
 215     oper
 216             .setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
 217                     "getResultReturn"));
 218     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 219     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 220     _operations[2] = oper;
 221
 222     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 223     oper.setName("cancel");
 224     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),
 225             new javax.xml.namespace.QName(
 226                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 227             java.lang.String.class,
 228             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 229     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 230             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 231     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 232     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));
 233     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 234     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 235     _operations[3] = oper;
 236   }
 237
 238   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 239           throws java.rmi.RemoteException
 240   {
 241     try
 242     {
 243       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 244               .createCall();
 245
 246       if (super.maintainSessionSet)
 247       {
 248         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 249       }
 250
 251       if (super.cachedUsername != null)
 252       {
 253         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 254       }
 255
 256       if (super.cachedPassword != null)
 257       {
 258         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 259       }
 260
 261       if (super.cachedEndpoint != null)
 262       {
 263         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 264       }
 265
 266       if (super.cachedTimeout != null)
 267       {
 268         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 269       }
 270
 271       if (super.cachedPortName != null)
 272       {
 273         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 274       }
 275
 276       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 277
 278       while (keys.hasMoreElements())
 279       {
 280         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 281         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 282       }
 283
 284       // All the type mapping information is registered
 285       // when the first call is made.
 286       // The type mapping information is actually registered in
 287       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 288       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 289       synchronized (this)
 290       {
 291         if (firstCall())
 292         {
 293           // must set encoding style before registering serializers
 294           _call
 295                   .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 296           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 297
 298           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 299           {
 300             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 301             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 302                     .get(i);
 303             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 304                     .get(i);
 305             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 306                     .get(i);
 307             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 308           }
 309         }
 310       }
 311
 312       return _call;
 313     } catch (java.lang.Throwable _t)
 314     {
 315       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 316               "Failure trying to get the Call object", _t);
 317     }
 318   }
 319
 320   public vamsas.objects.simple.WsJobId align(
 321           vamsas.objects.simple.SequenceSet seqSet)
 322           throws java.rmi.RemoteException
 323   {
 324     if (super.cachedEndpoint == null)
 325     {
 326       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 327     }
 328
 329     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 330     _call.setOperation(_operations[0]);
 331     _call.setUseSOAPAction(true);
 332     _call.setSOAPActionURI("");
 333     _call
 334             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 335     _call
 336             .setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 337                     "align"));
 338
 339     setRequestHeaders(_call);
 340     setAttachments(_call);
 341
 342     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 343     { seqSet });
 344
 345     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 346     {
 347       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 348     }
 349     else
 350     {
 351       extractAttachments(_call);
 352
 353       try
 354       {
 355         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 356       } catch (java.lang.Exception _exception)
 357       {
 358         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 359                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 360       }
 361     }
 362   }
 363
 364   public vamsas.objects.simple.Alignment getalign(java.lang.String job_id)
 365           throws java.rmi.RemoteException
 366   {
 367     if (super.cachedEndpoint == null)
 368     {
 369       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 370     }
 371
 372     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 373     _call.setOperation(_operations[1]);
 374     _call.setUseSOAPAction(true);
 375     _call.setSOAPActionURI("");
 376     _call
 377             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 378     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 379             "getalign"));
 380
 381     setRequestHeaders(_call);
 382     setAttachments(_call);
 383
 384     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 385     { job_id });
 386
 387     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 388     {
 389       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 390     }
 391     else
 392     {
 393       extractAttachments(_call);
 394
 395       try
 396       {
 397         return (vamsas.objects.simple.Alignment) _resp;
 398       } catch (java.lang.Exception _exception)
 399       {
 400         return (vamsas.objects.simple.Alignment) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 401                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.Alignment.class);
 402       }
 403     }
 404   }
 405
 406   public vamsas.objects.simple.MsaResult getResult(java.lang.String job_id)
 407           throws java.rmi.RemoteException
 408   {
 409     if (super.cachedEndpoint == null)
 410     {
 411       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 412     }
 413
 414     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 415     _call.setOperation(_operations[2]);
 416     _call.setUseSOAPAction(true);
 417     _call.setSOAPActionURI("");
 418     _call
 419             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 420     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 421             "getResult"));
 422
 423     setRequestHeaders(_call);
 424     setAttachments(_call);
 425
 426     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 427     { job_id });
 428
 429     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 430     {
 431       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 432     }
 433     else
 434     {
 435       extractAttachments(_call);
 436
 437       try
 438       {
 439         return (vamsas.objects.simple.MsaResult) _resp;
 440       } catch (java.lang.Exception _exception)
 441       {
 442         return (vamsas.objects.simple.MsaResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 443                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.MsaResult.class);
 444       }
 445     }
 446   }
 447
 448   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
 449           throws java.rmi.RemoteException
 450   {
 451     if (super.cachedEndpoint == null)
 452     {
 453       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 454     }
 455
 456     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 457     _call.setOperation(_operations[3]);
 458     _call.setUseSOAPAction(true);
 459     _call.setSOAPActionURI("");
 460     _call
 461             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 462     _call
 463             .setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 464                     "cancel"));
 465
 466     setRequestHeaders(_call);
 467     setAttachments(_call);
 468
 469     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 470     { jobId });
 471
 472     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 473     {
 474       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 475     }
 476     else
 477     {
 478       extractAttachments(_call);
 479
 480       try
 481       {
 482         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 483       } catch (java.lang.Exception _exception)
 484       {
 485         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 486                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 487       }
 488     }
 489   }
 490 }