src/ext/vamsas/MuscleWSSoapBindingStub.java

   1 /**\r
   2  * MuscleWSSoapBindingStub.java\r
   3  *\r
   4  * This file was auto-generated from WSDL\r
   5  * by the Apache Axis 1.2RC2 Nov 16, 2004 (12:19:44 EST) WSDL2Java emitter.\r
   6  */\r
   7 \r
   8 /*\r
   9  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
  10  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
  11  *\r
  12  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
  13  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
  14  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
  15  * of the License, or (at your option) any later version.\r
  16  *\r
  17  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  18  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  19  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  20  * GNU General Public License for more details.\r
  21  *\r
  22  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  23  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  24  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  25  */\r
  26 package ext.vamsas;\r
  27 \r
  28 public class MuscleWSSoapBindingStub\r
  29     extends org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.MuscleWS\r
  30 {\r
  31   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;\r
  32 \r
  33   static\r
  34   {\r
  35     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[4];\r
  36     _initOperationDesc1();\r
  37   }\r
  38 \r
  39   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();\r
  40   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();\r
  41   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();\r
  42   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();\r
  43 \r
  44   public MuscleWSSoapBindingStub()\r
  45       throws org.apache.axis.AxisFault\r
  46   {\r
  47     this(null);\r
  48   }\r
  49 \r
  50   public MuscleWSSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,\r
  51                                  javax.xml.rpc.Service service)\r
  52       throws org.apache.axis.AxisFault\r
  53   {\r
  54     this(service);\r
  55     super.cachedEndpoint = endpointURL;\r
  56   }\r
  57 \r
  58   public MuscleWSSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)\r
  59       throws org.apache.axis.AxisFault\r
  60   {\r
  61     if (service == null)\r
  62     {\r
  63       super.service = new org.apache.axis.client.Service();\r
  64     }\r
  65     else\r
  66     {\r
  67       super.service = service;\r
  68     }\r
  69 \r
  70     java.lang.Class cls;\r
  71     javax.xml.namespace.QName qName;\r
  72     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;\r
  73     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.\r
  74         BeanDeserializerFactory.class;\r
  75     //java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;\r
  76     //java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;\r
  77     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.\r
  78         ArraySerializerFactory.class;\r
  79     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.\r
  80         ArrayDeserializerFactory.class;\r
  81     //java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;\r
  82     // java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;\r
  83     //java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;\r
  84     //java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;\r
  85     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
  86                                           "Sequence");\r
  87     cachedSerQNames.add(qName);\r
  88     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;\r
  89     cachedSerClasses.add(cls);\r
  90     cachedSerFactories.add(beansf);\r
  91     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
  92 \r
  93     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_tns1_Sequence");\r
  94     cachedSerQNames.add(qName);\r
  95     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;\r
  96     cachedSerClasses.add(cls);\r
  97     cachedSerFactories.add(arraysf);\r
  98     cachedDeserFactories.add(arraydf);\r
  99 \r
 100     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 101                                           "MsaResult");\r
 102     cachedSerQNames.add(qName);\r
 103     cls = vamsas.objects.simple.MsaResult.class;\r
 104     cachedSerClasses.add(cls);\r
 105     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 106     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 107 \r
 108     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 109                                           "SequenceSet");\r
 110     cachedSerQNames.add(qName);\r
 111     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;\r
 112     cachedSerClasses.add(cls);\r
 113     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 114     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 115 \r
 116     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",\r
 117                                           "Object");\r
 118     cachedSerQNames.add(qName);\r
 119     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;\r
 120     cachedSerClasses.add(cls);\r
 121     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 122     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 123 \r
 124     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 125                                           "Alignment");\r
 126     cachedSerQNames.add(qName);\r
 127     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;\r
 128     cachedSerClasses.add(cls);\r
 129     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 130     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 131 \r
 132     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "WsJobId");\r
 133     cachedSerQNames.add(qName);\r
 134     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;\r
 135     cachedSerClasses.add(cls);\r
 136     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 137     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 138 \r
 139     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");\r
 140     cachedSerQNames.add(qName);\r
 141     cls = java.lang.String[].class;\r
 142     cachedSerClasses.add(cls);\r
 143     cachedSerFactories.add(arraysf);\r
 144     cachedDeserFactories.add(arraydf);\r
 145 \r
 146     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");\r
 147     cachedSerQNames.add(qName);\r
 148     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;\r
 149     cachedSerClasses.add(cls);\r
 150     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 151     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 152   }\r
 153 \r
 154   private static void _initOperationDesc1()\r
 155   {\r
 156     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;\r
 157     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
 158     oper.setName("align");\r
 159     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seqSet"),\r
 160                       new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 161         "SequenceSet"),\r
 162                       vamsas.objects.simple.SequenceSet.class,\r
 163                       org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
 164     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
 165         "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));\r
 166     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 167     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "alignReturn"));\r
 168     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
 169     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
 170     _operations[0] = oper;\r
 171 \r
 172     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
 173     oper.setName("getalign");\r
 174     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),\r
 175                       new javax.xml.namespace.QName(\r
 176         "http://www.w3.org/2001/XMLSchema",\r
 177         "string"), java.lang.String.class,\r
 178                       org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
 179     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
 180         "simple.objects.vamsas", "Alignment"));\r
 181     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Alignment.class);\r
 182     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getalignReturn"));\r
 183     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
 184     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
 185     _operations[1] = oper;\r
 186 \r
 187     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
 188     oper.setName("getResult");\r
 189     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),\r
 190                       new javax.xml.namespace.QName(\r
 191         "http://www.w3.org/2001/XMLSchema",\r
 192         "string"), java.lang.String.class,\r
 193                       org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
 194     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
 195         "simple.objects.vamsas", "MsaResult"));\r
 196     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.MsaResult.class);\r
 197     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getResultReturn"));\r
 198     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
 199     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
 200     _operations[2] = oper;\r
 201 \r
 202     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
 203     oper.setName("cancel");\r
 204     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),\r
 205                       new javax.xml.namespace.QName(\r
 206         "http://www.w3.org/2001/XMLSchema",\r
 207         "string"), java.lang.String.class,\r
 208                       org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
 209     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
 210         "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));\r
 211     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 212     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));\r
 213     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
 214     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
 215     _operations[3] = oper;\r
 216   }\r
 217 \r
 218   protected org.apache.axis.client.Call createCall()\r
 219       throws java.rmi.RemoteException\r
 220   {\r
 221     try\r
 222     {\r
 223       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call)super.\r
 224           service.createCall();\r
 225 \r
 226       if (super.maintainSessionSet)\r
 227       {\r
 228         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);\r
 229       }\r
 230 \r
 231       if (super.cachedUsername != null)\r
 232       {\r
 233         _call.setUsername(super.cachedUsername);\r
 234       }\r
 235 \r
 236       if (super.cachedPassword != null)\r
 237       {\r
 238         _call.setPassword(super.cachedPassword);\r
 239       }\r
 240 \r
 241       if (super.cachedEndpoint != null)\r
 242       {\r
 243         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);\r
 244       }\r
 245 \r
 246       if (super.cachedTimeout != null)\r
 247       {\r
 248         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);\r
 249       }\r
 250 \r
 251       if (super.cachedPortName != null)\r
 252       {\r
 253         _call.setPortName(super.cachedPortName);\r
 254       }\r
 255 \r
 256       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();\r
 257 \r
 258       while (keys.hasMoreElements())\r
 259       {\r
 260         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();\r
 261         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));\r
 262       }\r
 263 \r
 264       // All the type mapping information is registered\r
 265       // when the first call is made.\r
 266       // The type mapping information is actually registered in\r
 267       // the TypeMappingRegistry of the service, which\r
 268       // is the reason why registration is only needed for the first call.\r
 269       synchronized (this)\r
 270       {\r
 271         if (firstCall())\r
 272         {\r
 273           // must set encoding style before registering serializers\r
 274           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.\r
 275                                SOAP11_CONSTANTS);\r
 276           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);\r
 277 \r
 278           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)\r
 279           {\r
 280             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);\r
 281             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName)\r
 282                 cachedSerQNames.get(i);\r
 283             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories.get(i);\r
 284             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories.get(i);\r
 285             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);\r
 286           }\r
 287         }\r
 288       }\r
 289 \r
 290       return _call;\r
 291     }\r
 292     catch (java.lang.Throwable _t)\r
 293     {\r
 294       throw new org.apache.axis.AxisFault(\r
 295           "Failure trying to get the Call object",\r
 296           _t);\r
 297     }\r
 298   }\r
 299 \r
 300   public vamsas.objects.simple.WsJobId align(\r
 301       vamsas.objects.simple.SequenceSet seqSet)\r
 302       throws java.rmi.RemoteException\r
 303   {\r
 304     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 305     {\r
 306       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 307     }\r
 308 \r
 309     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 310     _call.setOperation(_operations[0]);\r
 311     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 312     _call.setSOAPActionURI("");\r
 313     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 314     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "align"));\r
 315 \r
 316     setRequestHeaders(_call);\r
 317     setAttachments(_call);\r
 318 \r
 319     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 320                                           {seqSet});\r
 321 \r
 322     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 323     {\r
 324       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 325     }\r
 326     else\r
 327     {\r
 328       extractAttachments(_call);\r
 329 \r
 330       try\r
 331       {\r
 332         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;\r
 333       }\r
 334       catch (java.lang.Exception _exception)\r
 335       {\r
 336         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils.\r
 337             convert(_resp,\r
 338                     vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 339       }\r
 340     }\r
 341   }\r
 342 \r
 343   public vamsas.objects.simple.Alignment getalign(java.lang.String job_id)\r
 344       throws java.rmi.RemoteException\r
 345   {\r
 346     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 347     {\r
 348       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 349     }\r
 350 \r
 351     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 352     _call.setOperation(_operations[1]);\r
 353     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 354     _call.setSOAPActionURI("");\r
 355     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 356     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 357         "getalign"));\r
 358 \r
 359     setRequestHeaders(_call);\r
 360     setAttachments(_call);\r
 361 \r
 362     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 363                                           {job_id});\r
 364 \r
 365     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 366     {\r
 367       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 368     }\r
 369     else\r
 370     {\r
 371       extractAttachments(_call);\r
 372 \r
 373       try\r
 374       {\r
 375         return (vamsas.objects.simple.Alignment) _resp;\r
 376       }\r
 377       catch (java.lang.Exception _exception)\r
 378       {\r
 379         return (vamsas.objects.simple.Alignment) org.apache.axis.utils.\r
 380             JavaUtils.convert(_resp,\r
 381                               vamsas.objects.simple.Alignment.class);\r
 382       }\r
 383     }\r
 384   }\r
 385 \r
 386   public vamsas.objects.simple.MsaResult getResult(java.lang.String job_id)\r
 387       throws java.rmi.RemoteException\r
 388   {\r
 389     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 390     {\r
 391       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 392     }\r
 393 \r
 394     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 395     _call.setOperation(_operations[2]);\r
 396     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 397     _call.setSOAPActionURI("");\r
 398     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 399     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 400         "getResult"));\r
 401 \r
 402     setRequestHeaders(_call);\r
 403     setAttachments(_call);\r
 404 \r
 405     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 406                                           {job_id});\r
 407 \r
 408     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 409     {\r
 410       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 411     }\r
 412     else\r
 413     {\r
 414       extractAttachments(_call);\r
 415 \r
 416       try\r
 417       {\r
 418         return (vamsas.objects.simple.MsaResult) _resp;\r
 419       }\r
 420       catch (java.lang.Exception _exception)\r
 421       {\r
 422         return (vamsas.objects.simple.MsaResult) org.apache.axis.utils.\r
 423             JavaUtils.convert(_resp,\r
 424                               vamsas.objects.simple.MsaResult.class);\r
 425       }\r
 426     }\r
 427   }\r
 428 \r
 429   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)\r
 430       throws java.rmi.RemoteException\r
 431   {\r
 432     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 433     {\r
 434       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 435     }\r
 436 \r
 437     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 438     _call.setOperation(_operations[3]);\r
 439     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 440     _call.setSOAPActionURI("");\r
 441     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 442     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "cancel"));\r
 443 \r
 444     setRequestHeaders(_call);\r
 445     setAttachments(_call);\r
 446 \r
 447     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 448                                           {jobId});\r
 449 \r
 450     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 451     {\r
 452       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 453     }\r
 454     else\r
 455     {\r
 456       extractAttachments(_call);\r
 457 \r
 458       try\r
 459       {\r
 460         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;\r
 461       }\r
 462       catch (java.lang.Exception _exception)\r
 463       {\r
 464         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils.\r
 465             convert(_resp,\r
 466                     vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 467       }\r
 468     }\r
 469   }\r
 470 }\r