JAL-1159 Merging 2.8.1 patches and Anne Menards work from 2012 into development branch
[jalview.git] / src / ext / vamsas / SeqSearchI.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
10  *  
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
15  * 
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17  */
18 package ext.vamsas;
19
20 public interface SeqSearchI extends java.rmi.Remote
21 {
22   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException;
23
24   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(
25           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException;
26
27   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(
28           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)
29           throws java.rmi.RemoteException;
30
31   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(
32           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)
33           throws java.rmi.RemoteException;
34
35   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
36           throws java.rmi.RemoteException;
37 }