JAL-2135 bugfix for error preventing processing of secondary structure annotation...
[jalview.git] / src / ext / vamsas / SeqSearchI.java
1 /*
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15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package ext.vamsas;
22
23 public interface SeqSearchI extends java.rmi.Remote
24 {
25   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException;
26
27   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(
28           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException;
29
30   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(
31           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)
32           throws java.rmi.RemoteException;
33
34   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(
35           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)
36           throws java.rmi.RemoteException;
37
38   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
39           throws java.rmi.RemoteException;
40 }