all alignment sequences associated with a dataset sequence must have start-end update...
[jalview.git] / src / ext / vamsas / SeqSearchI.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)\r
3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  * \r
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
9  * \r
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
13  * GNU General Public License for more details.\r
14  * \r
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
18  */\r
19 package ext.vamsas;\r
20 \r
21 public interface SeqSearchI extends java.rmi.Remote\r
22 {\r
23   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException;\r
24 \r
25   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(\r
26           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException;\r
27 \r
28   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(\r
29           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)\r
30           throws java.rmi.RemoteException;\r
31 \r
32   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(\r
33           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)\r
34           throws java.rmi.RemoteException;\r
35 \r
36   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)\r
37           throws java.rmi.RemoteException;\r
38 }\r