JAL-1159 Merging 2.8.1 patches and Anne Menards work from 2012 into development branch
[jalview.git] / src / ext / vamsas / SeqSearchServiceSoapBindingStub.java
1 /*
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17  */
18 package ext.vamsas;
19
20 public class SeqSearchServiceSoapBindingStub extends
21         org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.SeqSearchI
22 {
23   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
24
25   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
26
27   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
28
29   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
30
31   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
32
33   static
34   {
35     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[5];
36     _initOperationDesc1();
37   }
38
39   private static void _initOperationDesc1()
40   {
41     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
42     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
43     oper.setName("getDatabase");
44     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
45             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
46     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
47     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
48             "getDatabaseReturn"));
49     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
50     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
51     _operations[0] = oper;
52
53     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
54     oper.setName("getResult");
55     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
56             new javax.xml.namespace.QName(
57                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
58             java.lang.String.class,
59             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
60     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
61             "simple.objects.vamsas", "SeqSearchResult"));
62     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
63     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getResultReturn"));
64     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
65     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
66     _operations[1] = oper;
67
68     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
69     oper.setName("psearch");
70     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "al"),
71             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
72                     "Alignment"), vamsas.objects.simple.Alignment.class,
73             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
74     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
75             new javax.xml.namespace.QName(
76                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
77             java.lang.String.class,
78             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
79     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
80             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
81     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
82     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "psearchReturn"));
83     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
84     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
85     _operations[2] = oper;
86
87     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
88     oper.setName("search");
89     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "s"),
90             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
91                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
92             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
93     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
94             new javax.xml.namespace.QName(
95                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
96             java.lang.String.class,
97             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
98     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
99             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
100     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
101     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "searchReturn"));
102     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
103     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
104     _operations[3] = oper;
105
106     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
107     oper.setName("cancel");
108     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),
109             new javax.xml.namespace.QName(
110                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
111             java.lang.String.class,
112             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
113     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
114             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
115     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
116     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));
117     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
118     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
119     _operations[4] = oper;
120
121   }
122
123   public SeqSearchServiceSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
124   {
125     this(null);
126   }
127
128   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
129           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
130   {
131     this(service);
132     super.cachedEndpoint = endpointURL;
133   }
134
135   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
136           throws org.apache.axis.AxisFault
137   {
138     if (service == null)
139     {
140       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
141     }
142     else
143     {
144       super.service = service;
145     }
146     java.lang.Class cls;
147     javax.xml.namespace.QName qName;
148     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
149     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
150     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
151     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
152     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
153     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
154     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
155     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
156     java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
157     java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
158     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
159     cachedSerQNames.add(qName);
160     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
161     cachedSerClasses.add(cls);
162     cachedSerFactories.add(beansf);
163     cachedDeserFactories.add(beandf);
164
165     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
166             "WsJobId");
167     cachedSerQNames.add(qName);
168     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;
169     cachedSerClasses.add(cls);
170     cachedSerFactories.add(beansf);
171     cachedDeserFactories.add(beandf);
172
173     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
174             "Object");
175     cachedSerQNames.add(qName);
176     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;
177     cachedSerClasses.add(cls);
178     cachedSerFactories.add(beansf);
179     cachedDeserFactories.add(beandf);
180
181     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");
182     cachedSerQNames.add(qName);
183     cls = java.lang.String[].class;
184     cachedSerClasses.add(cls);
185     cachedSerFactories.add(arraysf);
186     cachedDeserFactories.add(arraydf);
187
188     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
189             "Alignment");
190     cachedSerQNames.add(qName);
191     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;
192     cachedSerClasses.add(cls);
193     cachedSerFactories.add(beansf);
194     cachedDeserFactories.add(beandf);
195
196     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
197             "Sequence");
198     cachedSerQNames.add(qName);
199     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
200     cachedSerClasses.add(cls);
201     cachedSerFactories.add(beansf);
202     cachedDeserFactories.add(beandf);
203
204     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_tns1_Sequence");
205     cachedSerQNames.add(qName);
206     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;
207     cachedSerClasses.add(cls);
208     cachedSerFactories.add(arraysf);
209     cachedDeserFactories.add(arraydf);
210
211     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
212             "SeqSearchResult");
213     cachedSerQNames.add(qName);
214     cls = vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class;
215     cachedSerClasses.add(cls);
216     cachedSerFactories.add(beansf);
217     cachedDeserFactories.add(beandf);
218
219     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
220             "SequenceSet");
221     cachedSerQNames.add(qName);
222     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;
223     cachedSerClasses.add(cls);
224     cachedSerFactories.add(beansf);
225     cachedDeserFactories.add(beandf);
226
227   }
228
229   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
230           throws java.rmi.RemoteException
231   {
232     try
233     {
234       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
235               .createCall();
236       if (super.maintainSessionSet)
237       {
238         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
239       }
240       if (super.cachedUsername != null)
241       {
242         _call.setUsername(super.cachedUsername);
243       }
244       if (super.cachedPassword != null)
245       {
246         _call.setPassword(super.cachedPassword);
247       }
248       if (super.cachedEndpoint != null)
249       {
250         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
251       }
252       if (super.cachedTimeout != null)
253       {
254         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
255       }
256       if (super.cachedPortName != null)
257       {
258         _call.setPortName(super.cachedPortName);
259       }
260       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
261       while (keys.hasMoreElements())
262       {
263         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
264         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
265       }
266       // All the type mapping information is registered
267       // when the first call is made.
268       // The type mapping information is actually registered in
269       // the TypeMappingRegistry of the service, which
270       // is the reason why registration is only needed for the first call.
271       synchronized (this)
272       {
273         if (firstCall())
274         {
275           // must set encoding style before registering serializers
276           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
277           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
278           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
279           {
280             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
281             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
282                     .get(i);
283             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
284                     .get(i);
285             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
286                     .get(i);
287             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
288           }
289         }
290       }
291       return _call;
292     } catch (java.lang.Throwable _t)
293     {
294       throw new org.apache.axis.AxisFault(
295               "Failure trying to get the Call object", _t);
296     }
297   }
298
299   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException
300   {
301     if (super.cachedEndpoint == null)
302     {
303       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
304     }
305     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
306     _call.setOperation(_operations[0]);
307     _call.setUseSOAPAction(true);
308     _call.setSOAPActionURI("");
309     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
310     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
311             "getDatabase"));
312
313     setRequestHeaders(_call);
314     setAttachments(_call);
315     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
316     {});
317
318     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
319     {
320       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
321     }
322     else
323     {
324       extractAttachments(_call);
325       try
326       {
327         return (java.lang.String) _resp;
328       } catch (java.lang.Exception _exception)
329       {
330         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
331                 _resp, java.lang.String.class);
332       }
333     }
334   }
335
336   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(
337           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
338   {
339     if (super.cachedEndpoint == null)
340     {
341       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
342     }
343     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
344     _call.setOperation(_operations[1]);
345     _call.setUseSOAPAction(true);
346     _call.setSOAPActionURI("");
347     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
348     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
349             "getResult"));
350
351     setRequestHeaders(_call);
352     setAttachments(_call);
353     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
354     { job_id });
355
356     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
357     {
358       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
359     }
360     else
361     {
362       extractAttachments(_call);
363       try
364       {
365         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) _resp;
366       } catch (java.lang.Exception _exception)
367       {
368         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
369                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
370       }
371     }
372   }
373
374   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(
375           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)
376           throws java.rmi.RemoteException
377   {
378     if (super.cachedEndpoint == null)
379     {
380       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
381     }
382     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
383     _call.setOperation(_operations[2]);
384     _call.setUseSOAPAction(true);
385     _call.setSOAPActionURI("");
386     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
387     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
388             "psearch"));
389
390     setRequestHeaders(_call);
391     setAttachments(_call);
392     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
393     { al, database });
394
395     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
396     {
397       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
398     }
399     else
400     {
401       extractAttachments(_call);
402       try
403       {
404         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
405       } catch (java.lang.Exception _exception)
406       {
407         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
408                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
409       }
410     }
411   }
412
413   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(
414           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)
415           throws java.rmi.RemoteException
416   {
417     if (super.cachedEndpoint == null)
418     {
419       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
420     }
421     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
422     _call.setOperation(_operations[3]);
423     _call.setUseSOAPAction(true);
424     _call.setSOAPActionURI("");
425     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
426     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "search"));
427
428     setRequestHeaders(_call);
429     setAttachments(_call);
430     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
431     { s, database });
432
433     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
434     {
435       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
436     }
437     else
438     {
439       extractAttachments(_call);
440       try
441       {
442         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
443       } catch (java.lang.Exception _exception)
444       {
445         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
446                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
447       }
448     }
449   }
450
451   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
452           throws java.rmi.RemoteException
453   {
454     if (super.cachedEndpoint == null)
455     {
456       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
457     }
458     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
459     _call.setOperation(_operations[4]);
460     _call.setUseSOAPAction(true);
461     _call.setSOAPActionURI("");
462     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
463     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "cancel"));
464
465     setRequestHeaders(_call);
466     setAttachments(_call);
467     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
468     { jobId });
469
470     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
471     {
472       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
473     }
474     else
475     {
476       extractAttachments(_call);
477       try
478       {
479         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
480       } catch (java.lang.Exception _exception)
481       {
482         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
483                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
484       }
485     }
486   }
487
488 }