src/ext/vamsas/SeqSearchServiceSoapBindingStub.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package ext.vamsas;\r
  19 \r
  20 public class SeqSearchServiceSoapBindingStub extends\r
  21         org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.SeqSearchI\r
  22 {\r
  23   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();\r
  24 \r
  25   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();\r
  26 \r
  27   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();\r
  28 \r
  29   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();\r
  30 \r
  31   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;\r
  32 \r
  33   static\r
  34   {\r
  35     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[5];\r
  36     _initOperationDesc1();\r
  37   }\r
  38 \r
  39   private static void _initOperationDesc1()\r
  40   {\r
  41     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;\r
  42     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
  43     oper.setName("getDatabase");\r
  44     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
  45             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));\r
  46     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);\r
  47     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",\r
  48             "getDatabaseReturn"));\r
  49     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
  50     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
  51     _operations[0] = oper;\r
  52 \r
  53     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
  54     oper.setName("getResult");\r
  55     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),\r
  56             new javax.xml.namespace.QName(\r
  57                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),\r
  58             java.lang.String.class,\r
  59             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  60     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
  61             "simple.objects.vamsas", "SeqSearchResult"));\r
  62     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);\r
  63     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getResultReturn"));\r
  64     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
  65     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
  66     _operations[1] = oper;\r
  67 \r
  68     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
  69     oper.setName("psearch");\r
  70     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "al"),\r
  71             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
  72                     "Alignment"), vamsas.objects.simple.Alignment.class,\r
  73             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  74     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),\r
  75             new javax.xml.namespace.QName(\r
  76                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),\r
  77             java.lang.String.class,\r
  78             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  79     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
  80             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));\r
  81     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
  82     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "psearchReturn"));\r
  83     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
  84     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
  85     _operations[2] = oper;\r
  86 \r
  87     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
  88     oper.setName("search");\r
  89     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "s"),\r
  90             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
  91                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,\r
  92             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  93     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),\r
  94             new javax.xml.namespace.QName(\r
  95                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),\r
  96             java.lang.String.class,\r
  97             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  98     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
  99             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));\r
 100     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 101     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "searchReturn"));\r
 102     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
 103     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
 104     _operations[3] = oper;\r
 105 \r
 106     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
 107     oper.setName("cancel");\r
 108     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),\r
 109             new javax.xml.namespace.QName(\r
 110                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),\r
 111             java.lang.String.class,\r
 112             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
 113     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
 114             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));\r
 115     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 116     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));\r
 117     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
 118     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
 119     _operations[4] = oper;\r
 120 \r
 121   }\r
 122 \r
 123   public SeqSearchServiceSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault\r
 124   {\r
 125     this(null);\r
 126   }\r
 127 \r
 128   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,\r
 129           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault\r
 130   {\r
 131     this(service);\r
 132     super.cachedEndpoint = endpointURL;\r
 133   }\r
 134 \r
 135   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)\r
 136           throws org.apache.axis.AxisFault\r
 137   {\r
 138     if (service == null)\r
 139     {\r
 140       super.service = new org.apache.axis.client.Service();\r
 141     }\r
 142     else\r
 143     {\r
 144       super.service = service;\r
 145     }\r
 146     java.lang.Class cls;\r
 147     javax.xml.namespace.QName qName;\r
 148     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;\r
 149     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;\r
 150     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;\r
 151     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;\r
 152     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;\r
 153     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;\r
 154     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;\r
 155     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;\r
 156     java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;\r
 157     java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;\r
 158     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");\r
 159     cachedSerQNames.add(qName);\r
 160     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;\r
 161     cachedSerClasses.add(cls);\r
 162     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 163     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 164 \r
 165     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 166             "WsJobId");\r
 167     cachedSerQNames.add(qName);\r
 168     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;\r
 169     cachedSerClasses.add(cls);\r
 170     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 171     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 172 \r
 173     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",\r
 174             "Object");\r
 175     cachedSerQNames.add(qName);\r
 176     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;\r
 177     cachedSerClasses.add(cls);\r
 178     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 179     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 180 \r
 181     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");\r
 182     cachedSerQNames.add(qName);\r
 183     cls = java.lang.String[].class;\r
 184     cachedSerClasses.add(cls);\r
 185     cachedSerFactories.add(arraysf);\r
 186     cachedDeserFactories.add(arraydf);\r
 187 \r
 188     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 189             "Alignment");\r
 190     cachedSerQNames.add(qName);\r
 191     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;\r
 192     cachedSerClasses.add(cls);\r
 193     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 194     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 195 \r
 196     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 197             "Sequence");\r
 198     cachedSerQNames.add(qName);\r
 199     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;\r
 200     cachedSerClasses.add(cls);\r
 201     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 202     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 203 \r
 204     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_tns1_Sequence");\r
 205     cachedSerQNames.add(qName);\r
 206     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;\r
 207     cachedSerClasses.add(cls);\r
 208     cachedSerFactories.add(arraysf);\r
 209     cachedDeserFactories.add(arraydf);\r
 210 \r
 211     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 212             "SeqSearchResult");\r
 213     cachedSerQNames.add(qName);\r
 214     cls = vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class;\r
 215     cachedSerClasses.add(cls);\r
 216     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 217     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 218 \r
 219     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 220             "SequenceSet");\r
 221     cachedSerQNames.add(qName);\r
 222     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;\r
 223     cachedSerClasses.add(cls);\r
 224     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 225     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 226 \r
 227   }\r
 228 \r
 229   protected org.apache.axis.client.Call createCall()\r
 230           throws java.rmi.RemoteException\r
 231   {\r
 232     try\r
 233     {\r
 234       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service\r
 235               .createCall();\r
 236       if (super.maintainSessionSet)\r
 237       {\r
 238         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);\r
 239       }\r
 240       if (super.cachedUsername != null)\r
 241       {\r
 242         _call.setUsername(super.cachedUsername);\r
 243       }\r
 244       if (super.cachedPassword != null)\r
 245       {\r
 246         _call.setPassword(super.cachedPassword);\r
 247       }\r
 248       if (super.cachedEndpoint != null)\r
 249       {\r
 250         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);\r
 251       }\r
 252       if (super.cachedTimeout != null)\r
 253       {\r
 254         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);\r
 255       }\r
 256       if (super.cachedPortName != null)\r
 257       {\r
 258         _call.setPortName(super.cachedPortName);\r
 259       }\r
 260       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();\r
 261       while (keys.hasMoreElements())\r
 262       {\r
 263         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();\r
 264         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));\r
 265       }\r
 266       // All the type mapping information is registered\r
 267       // when the first call is made.\r
 268       // The type mapping information is actually registered in\r
 269       // the TypeMappingRegistry of the service, which\r
 270       // is the reason why registration is only needed for the first call.\r
 271       synchronized (this)\r
 272       {\r
 273         if (firstCall())\r
 274         {\r
 275           // must set encoding style before registering serializers\r
 276           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 277           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);\r
 278           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)\r
 279           {\r
 280             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);\r
 281             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames\r
 282                     .get(i);\r
 283             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories\r
 284                     .get(i);\r
 285             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories\r
 286                     .get(i);\r
 287             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);\r
 288           }\r
 289         }\r
 290       }\r
 291       return _call;\r
 292     } catch (java.lang.Throwable _t)\r
 293     {\r
 294       throw new org.apache.axis.AxisFault(\r
 295               "Failure trying to get the Call object", _t);\r
 296     }\r
 297   }\r
 298 \r
 299   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException\r
 300   {\r
 301     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 302     {\r
 303       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 304     }\r
 305     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 306     _call.setOperation(_operations[0]);\r
 307     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 308     _call.setSOAPActionURI("");\r
 309     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 310     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 311             "getDatabase"));\r
 312 \r
 313     setRequestHeaders(_call);\r
 314     setAttachments(_call);\r
 315     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 316     {});\r
 317 \r
 318     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 319     {\r
 320       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 321     }\r
 322     else\r
 323     {\r
 324       extractAttachments(_call);\r
 325       try\r
 326       {\r
 327         return (java.lang.String) _resp;\r
 328       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 329       {\r
 330         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(\r
 331                 _resp, java.lang.String.class);\r
 332       }\r
 333     }\r
 334   }\r
 335 \r
 336   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(\r
 337           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException\r
 338   {\r
 339     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 340     {\r
 341       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 342     }\r
 343     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 344     _call.setOperation(_operations[1]);\r
 345     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 346     _call.setSOAPActionURI("");\r
 347     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 348     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 349             "getResult"));\r
 350 \r
 351     setRequestHeaders(_call);\r
 352     setAttachments(_call);\r
 353     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 354     { job_id });\r
 355 \r
 356     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 357     {\r
 358       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 359     }\r
 360     else\r
 361     {\r
 362       extractAttachments(_call);\r
 363       try\r
 364       {\r
 365         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) _resp;\r
 366       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 367       {\r
 368         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils\r
 369                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);\r
 370       }\r
 371     }\r
 372   }\r
 373 \r
 374   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(\r
 375           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)\r
 376           throws java.rmi.RemoteException\r
 377   {\r
 378     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 379     {\r
 380       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 381     }\r
 382     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 383     _call.setOperation(_operations[2]);\r
 384     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 385     _call.setSOAPActionURI("");\r
 386     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 387     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 388             "psearch"));\r
 389 \r
 390     setRequestHeaders(_call);\r
 391     setAttachments(_call);\r
 392     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 393     { al, database });\r
 394 \r
 395     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 396     {\r
 397       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 398     }\r
 399     else\r
 400     {\r
 401       extractAttachments(_call);\r
 402       try\r
 403       {\r
 404         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;\r
 405       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 406       {\r
 407         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils\r
 408                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 409       }\r
 410     }\r
 411   }\r
 412 \r
 413   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(\r
 414           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)\r
 415           throws java.rmi.RemoteException\r
 416   {\r
 417     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 418     {\r
 419       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 420     }\r
 421     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 422     _call.setOperation(_operations[3]);\r
 423     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 424     _call.setSOAPActionURI("");\r
 425     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 426     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "search"));\r
 427 \r
 428     setRequestHeaders(_call);\r
 429     setAttachments(_call);\r
 430     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 431     { s, database });\r
 432 \r
 433     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 434     {\r
 435       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 436     }\r
 437     else\r
 438     {\r
 439       extractAttachments(_call);\r
 440       try\r
 441       {\r
 442         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;\r
 443       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 444       {\r
 445         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils\r
 446                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 447       }\r
 448     }\r
 449   }\r
 450 \r
 451   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)\r
 452           throws java.rmi.RemoteException\r
 453   {\r
 454     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 455     {\r
 456       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 457     }\r
 458     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 459     _call.setOperation(_operations[4]);\r
 460     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 461     _call.setSOAPActionURI("");\r
 462     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 463     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "cancel"));\r
 464 \r
 465     setRequestHeaders(_call);\r
 466     setAttachments(_call);\r
 467     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 468     { jobId });\r
 469 \r
 470     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 471     {\r
 472       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 473     }\r
 474     else\r
 475     {\r
 476       extractAttachments(_call);\r
 477       try\r
 478       {\r
 479         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;\r
 480       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 481       {\r
 482         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils\r
 483                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 484       }\r
 485     }\r
 486   }\r
 487 \r
 488 }\r