JAL-1260 rudimentary parsing of LOCUS line to at least get accession id
[jalview.git] / src / jalview / api / AlignViewControllerGuiI.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.api;
22
23 import jalview.commands.CommandI;
24 import jalview.schemes.ColourSchemeI;
25
26 import java.awt.Rectangle;
27
28 /**
29  * Interface implemented by gui implementations managing a Jalview Alignment
30  * View
31  * 
32  * @author jimp
33  * 
34  */
35 public interface AlignViewControllerGuiI
36 {
37
38   /**
39    * display the given string in the GUI's status bar
40    * 
41    * @param string
42    */
43   void setStatus(String string);
44
45   void addHistoryItem(CommandI command);
46
47   void setShowSeqFeatures(boolean show);
48
49   void setMenusForViewport();
50
51   void changeColour(ColourSchemeI cs);
52
53   /**
54    * trigger an update of the UI in response to a model data change, and if
55    * necessary enable the display of sequence feature annotation on the view.
56    * 
57    * @param enableIfNecessary
58    */
59   void refreshFeatureUI(boolean enableIfNecessary);
60
61   /**
62    * get the Feature Settings control panel for the alignment view if one exists
63    * 
64    * @return
65    */
66   FeatureSettingsControllerI getFeatureSettingsUI();
67
68   /**
69    * displays the Feature Settigns control panel for the alignment view - if one
70    * exists it is closed and re-opened.
71    * 
72    * @return the current feature settings controller
73    */
74   FeatureSettingsControllerI showFeatureSettingsUI();
75
76   /**
77    * record the last position of a feature settings dialog before it was closed
78    * 
79    * @param bounds
80    */
81   void setFeatureSettingsGeometry(Rectangle bounds);
82
83   /**
84    * 
85    * @return last position of feature settings for this alignment view GUI
86    */
87   Rectangle getFeatureSettingsGeometry();
88 }