JAL-2416 order score models by order of addition rather than name
[jalview.git] / src / jalview / api / AlignViewControllerGuiI.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.api;
22
23 import jalview.commands.CommandI;
24 import jalview.schemes.ColourSchemeI;
25
26 /**
27  * Interface implemented by gui implementations managing a Jalview Alignment
28  * View
29  * 
30  * @author jimp
31  * 
32  */
33 public interface AlignViewControllerGuiI
34 {
35
36   /**
37    * display the given string in the GUI's status bar
38    * 
39    * @param string
40    */
41   void setStatus(String string);
42
43   void addHistoryItem(CommandI command);
44
45   void setShowSeqFeatures(boolean show);
46
47   void setMenusForViewport();
48
49   void changeColour(ColourSchemeI cs);
50
51   /**
52    * trigger an update of the UI in response to a model data change, and if
53    * necessary enable the display of sequence feature annotation on the view.
54    * 
55    * @param enableIfNecessary
56    */
57   void refreshFeatureUI(boolean enableIfNecessary);
58
59   /**
60    * get the Feature Settings control panel for the alignment view if one exists
61    * 
62    * @return
63    */
64   FeatureSettingsControllerI getFeatureSettingsUI();
65 }