src/jalview/api/DBRefEntryI.java

   1 package jalview.api;
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   3
   4 public interface DBRefEntryI
   5 {
   6   public boolean equalRef(DBRefEntryI entry);
   7
   8   /**
   9    *
  10    * @return Source DB name for this entry
  11    */
  12   public String getSource();
  13
  14   /**
  15    *
  16    * @return Accession Id for this entry
  17    */
  18   public String getAccessionId();
  19
  20   /**
  21    *
  22    * @param accessionId
  23    *          Accession Id for this entry
  24    */
  25   public void setAccessionId(String accessionId);
  26
  27   /**
  28    *
  29    * @param source
  30    *          Source DB name for this entry
  31    */
  32   public void setSource(String source);
  33
  34   /**
  35    *
  36    * @return Source DB version for this entry
  37    */
  38   public String getVersion();
  39
  40   /**
  41    *
  42    * @param version
  43    *          Source DB version for this entry
  44    */
  45   public void setVersion(String version);
  46
  47   /**
  48    *
  49    * @param startRes
  50    *          index of start residue in the source DB
  51    */
  52   public void setStartRes(int startRes);
  53
  54   /**
  55    *
  56    * @return index of start residue in the source DB
  57    */
  58   public int getStartRes();
  59
  60   /**
  61    *
  62    * @param endRes
  63    *          index of end residue in the source DB
  64    */
  65   public void setEndRes(int endRes);
  66
  67   /**
  68    *
  69    * @return index of end residue in the source DB
  70    */
  71   public int getEndRes();
  72 }