JAL-674 make RNAML-extracted secondary structure lines consistent with those from...
[jalview.git] / src / jalview / api / analysis / ScoreModelI.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.2)
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16  * 
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18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.api.analysis;
22
23 import jalview.datamodel.AlignmentView;
24
25 public interface ScoreModelI
26 {
27
28   float[][] findDistances(AlignmentView seqData);
29
30   String getName();
31
32   boolean isDNA();
33
34   boolean isProtein();
35
36 }