elementAt instead of get for 1.1 compatibility
[jalview.git] / src / jalview / appletgui / AnnotationLabels.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  *\r
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
9  *\r
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
13  * GNU General Public License for more details.\r
14  *\r
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
18  */\r
19 \r
20 package jalview.appletgui;\r
21 \r
22 import java.awt.*;\r
23 import java.awt.event.*;\r
24 \r
25 import jalview.datamodel.*;\r
26 \r
27 public class AnnotationLabels\r
28     extends Panel implements ActionListener\r
29 {\r
30   boolean active = false;\r
31   AlignmentPanel ap;\r
32   AlignViewport av;\r
33   boolean resizing = false;\r
34   int oldY, mouseX;\r
35   static String ADDNEW = "Add new row";\r
36   static String HIDE = "Hide this row";\r
37   static String DELETE = "Delete this row";\r
38   static String SHOWALL = "Show all hidden rows";\r
39   static String OUTPUT_TEXT = "Show Values In Textbox";\r
40   int selectedRow = 0;\r
41   int scrollOffset = 0;\r
42 \r
43   public AnnotationLabels(AlignmentPanel ap)\r
44   {\r
45     this.ap = ap;\r
46     this.av = ap.av;\r
47     setLayout(null);\r
48     addMouseListener(new MouseAdapter()\r
49     {\r
50       public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
51       {\r
52         doMousePressed(evt);\r
53       }\r
54     });\r
55   }\r
56 \r
57   public AnnotationLabels(AlignViewport av)\r
58 {\r
59   this.av = av;\r
60 }\r
61 \r
62 \r
63   public void setScrollOffset(int y)\r
64   {\r
65     scrollOffset = y;\r
66     repaint();\r
67   }\r
68 \r
69   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
70   {\r
71     AlignmentAnnotation[] aa = av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
72 \r
73     if (evt.getActionCommand().equals(HIDE))\r
74     {\r
75       aa[selectedRow].visible = false;\r
76     }\r
77     else if (evt.getActionCommand().equals(SHOWALL))\r
78     {\r
79       for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
80       {\r
81         aa[i].visible = true;\r
82       }\r
83     }\r
84     else if (evt.getActionCommand().equals(OUTPUT_TEXT))\r
85     {\r
86       CutAndPasteTransfer cap = new CutAndPasteTransfer(false, ap.alignFrame);\r
87       Frame frame = new Frame();\r
88       frame.add(cap);\r
89       jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame,\r
90                                        ap.alignFrame.getTitle() + " - " +\r
91                                        aa[selectedRow].label, 500, 100);\r
92       cap.setText(aa[selectedRow].toString());\r
93     }\r
94 \r
95     ap.annotationPanel.adjustPanelHeight();\r
96     setSize(getSize().width, ap.annotationPanel.getSize().height);\r
97     ap.validate();\r
98     ap.repaint();\r
99   }\r
100 \r
101   public void doMousePressed(MouseEvent evt)\r
102   {\r
103     int y = evt.getY() - scrollOffset;\r
104     AlignmentAnnotation[] aa = ap.av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
105     int height = 0;\r
106     for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
107     {\r
108       if (!aa[i].visible)\r
109       {\r
110         continue;\r
111       }\r
112 \r
113       height += aa[i].height;\r
114       if (y < height)\r
115       {\r
116         selectedRow = i;\r
117         break;\r
118       }\r
119     }\r
120 \r
121     PopupMenu pop = new PopupMenu("Annotations");\r
122     MenuItem item = new MenuItem(HIDE);\r
123     item.addActionListener(this);\r
124     pop.add(item);\r
125     item = new MenuItem(SHOWALL);\r
126     item.addActionListener(this);\r
127     pop.add(item);\r
128     this.add(pop);\r
129     item = new MenuItem(OUTPUT_TEXT);\r
130     item.addActionListener(this);\r
131     pop.add(item);\r
132 \r
133     if (aa[selectedRow].label.equals("Consensus"))\r
134     {\r
135       pop.addSeparator();\r
136       final CheckboxMenuItem cbmi = new CheckboxMenuItem(\r
137           "Ignore Gaps In Consensus",\r
138           ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
139 \r
140       cbmi.addItemListener(new ItemListener()\r
141       {\r
142         public void itemStateChanged(ItemEvent e)\r
143         {\r
144           ap.av.setIgnoreGapsConsensus(cbmi.getState());\r
145           ap.repaint();\r
146         }\r
147       });\r
148       pop.add(cbmi);\r
149     }\r
150 \r
151      pop.show(this, evt.getX(), evt.getY());\r
152 \r
153   }\r
154 \r
155   public void paint(Graphics g)\r
156   {\r
157     drawComponent(g, getSize().width);\r
158   }\r
159 \r
160   public void drawComponent(Graphics g, int width)\r
161   {\r
162     g.setFont(av.getFont());\r
163     FontMetrics fm = g.getFontMetrics(av.getFont());\r
164     g.setColor(Color.white);\r
165     g.fillRect(0, 0, getSize().width, getSize().height);\r
166 \r
167     g.translate(0, scrollOffset);\r
168     g.setColor(Color.black);\r
169 \r
170     AlignmentAnnotation[] aa = av.alignment.getAlignmentAnnotation();\r
171     int y = g.getFont().getSize();\r
172     int x = 0;\r
173 \r
174     if (aa != null)\r
175     {\r
176       for (int i = 0; i < aa.length; i++)\r
177       {\r
178         if (!aa[i].visible)\r
179         {\r
180           continue;\r
181         }\r
182 \r
183         x = width - fm.stringWidth(aa[i].label) - 3;\r
184 \r
185         if (aa[i].graph>0)\r
186         {\r
187           y += (aa[i].height / 3);\r
188         }\r
189 \r
190         g.drawString(aa[i].label, x, y);\r
191 \r
192         if (aa[i].graph>0)\r
193         {\r
194           y += (2 * aa[i].height / 3);\r
195         }\r
196         else\r
197         {\r
198           y += aa[i].height;\r
199         }\r
200       }\r
201     }\r
202   }\r
203 \r
204 }\r