src/jalview/appletgui/ColumnSelection.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 /**\r
  25  * NOTE: Columns are zero based.\r
  26  */\r
  27 public class ColumnSelection\r
  28 {\r
  29   Vector selected = new Vector();\r
  30 \r
  31   public void addElement(int col)\r
  32   {\r
  33     if(!selected.contains(new Integer(col)))\r
  34       selected.addElement(new Integer(col));\r
  35   }\r
  36 \r
  37   public void clear()\r
  38   {\r
  39     selected.removeAllElements();\r
  40   }\r
  41 \r
  42   public void removeElement(int col)\r
  43   {\r
  44     Integer colInt = new Integer(col);\r
  45     if (selected.contains(colInt))\r
  46     {\r
  47       selected.removeElement(colInt);\r
  48     }\r
  49   }\r
  50 \r
  51   public void removeElements(int start, int end)\r
  52   {\r
  53     Integer colInt;\r
  54     for(int i=start; i<end; i++)\r
  55     {\r
  56       colInt = new Integer(i);\r
  57       if (selected.contains(colInt))\r
  58       {\r
  59           selected.removeElement(colInt);\r
  60       }\r
  61     }\r
  62     }\r
  63 \r
  64   public boolean contains(int col)\r
  65   {\r
  66     return selected.contains(new Integer(col));\r
  67   }\r
  68 \r
  69   public int columnAt(int i)\r
  70   {\r
  71     return ( (Integer) selected.elementAt(i)).intValue();\r
  72   }\r
  73 \r
  74   public int size()\r
  75   {\r
  76     return selected.size();\r
  77   }\r
  78 \r
  79   public int getMax()\r
  80   {\r
  81     int max = -1;\r
  82 \r
  83     for (int i = 0; i < selected.size(); i++)\r
  84     {\r
  85       if (columnAt(i) > max)\r
  86       {\r
  87         max = columnAt(i);\r
  88       }\r
  89     }\r
  90     return max;\r
  91   }\r
  92 \r
  93   public int getMin()\r
  94   {\r
  95     int min = 1000000000;\r
  96 \r
  97     for (int i = 0; i < selected.size(); i++)\r
  98     {\r
  99       if (columnAt(i) < min)\r
 100       {\r
 101         min = columnAt(i);\r
 102       }\r
 103     }\r
 104     return min;\r
 105   }\r
 106 \r
 107   public Vector asVector()\r
 108   {\r
 109     return selected;\r
 110   }\r
 111 \r
 112   public void compensateForEdit(int start, int change)\r
 113   {\r
 114     for (int i = 0; i < size(); i++)\r
 115     {\r
 116       int temp = columnAt(i);\r
 117 \r
 118       if (temp >= start)\r
 119       {\r
 120         selected.setElementAt(new Integer(temp - change), i);\r
 121       }\r
 122     }\r
 123   }\r
 124 }\r