src/jalview/appletgui/ColumnSelection.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 /**\r
  25  * NOTE: Columns are zero based.\r
  26  */\r
  27 public class ColumnSelection\r
  28 {\r
  29   Vector selected = new Vector();\r
  30 \r
  31   public void addElement(int col)\r
  32   {\r
  33     selected.addElement(new Integer(col));\r
  34   }\r
  35 \r
  36   public void clear()\r
  37   {\r
  38     selected.removeAllElements();\r
  39   }\r
  40 \r
  41   public void removeElement(int col)\r
  42   {\r
  43     Integer colInt = new Integer(col);\r
  44     if (selected.contains(colInt))\r
  45     {\r
  46       selected.removeElement(colInt);\r
  47     }\r
  48     else\r
  49     {\r
  50       System.err.println(\r
  51           "WARNING: Tried to remove Integer NOT in ColumnSelection");\r
  52     }\r
  53   }\r
  54 \r
  55   public boolean contains(int col)\r
  56   {\r
  57     return selected.contains(new Integer(col));\r
  58   }\r
  59 \r
  60   public int columnAt(int i)\r
  61   {\r
  62     return ( (Integer) selected.elementAt(i)).intValue();\r
  63   }\r
  64 \r
  65   public int size()\r
  66   {\r
  67     return selected.size();\r
  68   }\r
  69 \r
  70   public int getMax()\r
  71   {\r
  72     int max = -1;\r
  73 \r
  74     for (int i = 0; i < selected.size(); i++)\r
  75     {\r
  76       if (columnAt(i) > max)\r
  77       {\r
  78         max = columnAt(i);\r
  79       }\r
  80     }\r
  81     return max;\r
  82   }\r
  83 \r
  84   public int getMin()\r
  85   {\r
  86     int min = 1000000000;\r
  87 \r
  88     for (int i = 0; i < selected.size(); i++)\r
  89     {\r
  90       if (columnAt(i) < min)\r
  91       {\r
  92         min = columnAt(i);\r
  93       }\r
  94     }\r
  95     return min;\r
  96   }\r
  97 \r
  98   public Vector asVector()\r
  99   {\r
 100     return selected;\r
 101   }\r
 102 \r
 103   public void compensateForEdit(int start, int change)\r
 104   {\r
 105     for (int i = 0; i < size(); i++)\r
 106     {\r
 107       int temp = columnAt(i);\r
 108 \r
 109       if (temp >= start)\r
 110       {\r
 111         selected.setElementAt(new Integer(temp - change), i);\r
 112       }\r
 113     }\r
 114   }\r
 115 }\r