src/jalview/appletgui/CutAndPasteTransfer.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.awt.*;\r
  23 import java.awt.event.*;\r
  24 \r
  25 import jalview.datamodel.*;\r
  26 import jalview.io.*;\r
  27 import jalview.jbappletgui.*;\r
  28 \r
  29 public class CutAndPasteTransfer\r
  30     extends GCutAndPasteTransfer\r
  31 {\r
  32   jalview.bin.JalviewLite applet;\r
  33 \r
  34   boolean pdbImport = false;\r
  35   Sequence seq;\r
  36   SeqCanvas seqcanvas;\r
  37 \r
  38   public CutAndPasteTransfer(boolean forImport, jalview.bin.JalviewLite mainApplet)\r
  39   {\r
  40     super();\r
  41     applet = mainApplet;\r
  42 \r
  43     if (!forImport)\r
  44     {\r
  45       buttonPanel.setVisible(false);\r
  46     }\r
  47   }\r
  48 \r
  49   public void setPDBImport(Sequence seq, SeqCanvas seqcanvas)\r
  50   {\r
  51     this.seq = seq;\r
  52     this.seqcanvas = seqcanvas;\r
  53     pdbImport = true;\r
  54   }\r
  55 \r
  56 \r
  57   public String getText()\r
  58   {\r
  59     return textarea.getText();\r
  60   }\r
  61 \r
  62   public void setText(String text)\r
  63   {\r
  64     textarea.setText(text);\r
  65   }\r
  66 \r
  67   protected void ok_actionPerformed(ActionEvent e)\r
  68   {\r
  69     String text = getText();\r
  70     int length = text.length();\r
  71     textarea.append("\n");\r
  72     if(textarea.getText().length()==length)\r
  73     {\r
  74       String warning = "\n\n#################################################\n"\r
  75           +"WARNING!! THIS IS THE MAXIMUM SIZE OF TEXTAREA!!\n"\r
  76           +"\nCAN'T INPUT FULL ALIGNMENT"\r
  77           +"\n\nYOU MUST DELETE THIS WARNING TO CONTINUE"\r
  78           +"\n\nMAKE SURE LAST SEQUENCE PASTED IS COMPLETE"\r
  79           +"\n#################################################\n";\r
  80       textarea.setText(text.substring(0, text.length()-warning.length())\r
  81           +warning);\r
  82 \r
  83       textarea.setCaretPosition(text.length());\r
  84       return;\r
  85     }\r
  86 \r
  87     if(pdbImport)\r
  88     {\r
  89       new MCview.AppletPDBViewer(text, seq, seqcanvas);\r
  90     }\r
  91     else\r
  92     {\r
  93       SequenceI[] sequences = null;\r
  94 \r
  95       String format = IdentifyFile.Identify(text, "Paste");\r
  96       sequences = new AppletFormatAdapter().readFile(text, "Paste", format);\r
  97 \r
  98       if (sequences != null)\r
  99       {\r
 100         AlignFrame af = new AlignFrame(new Alignment(sequences), applet,\r
 101                                        "Cut & Paste input - " + format);\r
 102         af.statusBar.setText("Successfully pasted alignment file");\r
 103       }\r
 104     }\r
 105     Frame frame = (Frame)this.getParent();\r
 106     frame.setVisible(false);\r
 107   }\r
 108 \r
 109   protected void cancel_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 110   {\r
 111     Frame frame = (Frame)this.getParent();\r
 112     frame.setVisible(false);\r
 113   }\r
 114 \r
 115 }\r