Takes string[] instead of seq[]
[jalview.git] / src / jalview / appletgui / ScalePanel.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  *\r
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
9  *\r
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
13  * GNU General Public License for more details.\r
14  *\r
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
18  */\r
19 \r
20 package jalview.appletgui;\r
21 \r
22 import java.awt.*;\r
23 import java.awt.event.*;\r
24 \r
25 import jalview.datamodel.*;\r
26 \r
27 public class ScalePanel\r
28     extends Panel\r
29 {\r
30 \r
31   protected int offy = 4;\r
32   public int width;\r
33 \r
34   protected AlignViewport av;\r
35   AlignmentPanel ap;\r
36 \r
37   boolean stretchingGroup = false;\r
38 \r
39   public ScalePanel(AlignViewport av, AlignmentPanel ap)\r
40   {\r
41     setLayout(null);\r
42     this.av = av;\r
43     this.ap = ap;\r
44 \r
45     addMouseListener(new MouseAdapter()\r
46     {\r
47       public void mousePressed(MouseEvent evt)\r
48       {\r
49         doMousePressed(evt);\r
50       }\r
51 \r
52       public void mouseReleased(MouseEvent evt)\r
53       {\r
54         doMouseReleased(evt);\r
55       }\r
56 \r
57     });\r
58     addMouseMotionListener(new MouseMotionAdapter()\r
59     {\r
60       public void mouseDragged(MouseEvent evt)\r
61       {\r
62         doMouseDragged(evt);\r
63       }\r
64     });\r
65 \r
66   }\r
67 \r
68   public void doMousePressed(MouseEvent evt)\r
69   {\r
70     int x = evt.getX();\r
71     int res = x / av.getCharWidth() + av.getStartRes();\r
72     SequenceGroup sg = null;\r
73 \r
74     if (av.getColumnSelection().contains(res))\r
75     {\r
76       av.getColumnSelection().removeElement(res);\r
77     }\r
78     else\r
79     {\r
80       av.getColumnSelection().addElement(res);\r
81 \r
82       sg = new SequenceGroup();\r
83       for (int i = 0; i < av.alignment.getSequences().size(); i++)\r
84       {\r
85         sg.addSequence(av.alignment.getSequenceAt(i), false);\r
86       }\r
87 \r
88       sg.setStartRes(res);\r
89       sg.setEndRes(res);\r
90 \r
91       ap.annotationPanel.addEditableColumn(res);\r
92     }\r
93     av.setSelectionGroup(sg);\r
94     ap.repaint();\r
95   }\r
96 \r
97   public void doMouseReleased(MouseEvent evt)\r
98   {\r
99     if (!stretchingGroup)\r
100     {\r
101       return;\r
102     }\r
103 \r
104     int x = evt.getX();\r
105     int res = x / av.getCharWidth() + av.getStartRes();\r
106 \r
107     if(res> av.alignment.getWidth())\r
108     {\r
109       res = av.alignment.getWidth()-1;\r
110     }\r
111 \r
112     if (!av.getColumnSelection().contains(res))\r
113     {\r
114       av.getColumnSelection().addElement(res);\r
115     }\r
116 \r
117     SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
118 \r
119     if (res > sg.getStartRes())\r
120     {\r
121       sg.setEndRes(res);\r
122     }\r
123     else if (res < sg.getStartRes())\r
124     {\r
125       sg.setStartRes(res);\r
126     }\r
127 \r
128     stretchingGroup = false;\r
129     ap.repaint();\r
130   }\r
131 \r
132   public void doMouseDragged(MouseEvent evt)\r
133   {\r
134     int x = evt.getX();\r
135     int res = x / av.getCharWidth() + av.getStartRes();\r
136 \r
137     if(res> av.alignment.getWidth())\r
138     {\r
139       res = av.alignment.getWidth()-1;\r
140     }\r
141 \r
142     SequenceGroup sg = av.getSelectionGroup();\r
143     if (sg != null)\r
144     {\r
145       stretchingGroup = true;\r
146       if (res > sg.getStartRes())\r
147       {\r
148         sg.setEndRes(res);\r
149       }\r
150       else if (res < sg.getStartRes())\r
151       {\r
152         sg.setStartRes(res);\r
153       }\r
154 \r
155       ap.annotationPanel.addEditableColumn(res);\r
156       ap.repaint();\r
157     }\r
158   }\r
159 \r
160   public void update(Graphics g)\r
161   {\r
162     paint(g);\r
163   }\r
164 \r
165   public void paint(Graphics g)\r
166   {\r
167     drawScale(g, av.getStartRes(), av.getEndRes(), getSize().width,\r
168               getSize().height);\r
169   }\r
170 \r
171 // scalewidth will normally be screenwidth,\r
172   public void drawScale(Graphics gg, int startx, int endx, int width,\r
173                         int height)\r
174   {\r
175     gg.setFont(av.getFont());\r
176 \r
177     //Fill in the background\r
178     gg.setColor(Color.white);\r
179     gg.fillRect(0, 0, width, height);\r
180     gg.setColor(Color.black);\r
181 \r
182     //Fill the selected columns\r
183     ColumnSelection cs = av.getColumnSelection();\r
184     gg.setColor(new Color(220, 0, 0));\r
185     for (int i = 0; i < cs.size(); i++)\r
186     {\r
187       int sel = cs.columnAt(i);\r
188       if (sel >= startx && sel <= endx)\r
189       {\r
190         gg.fillRect( (sel - startx) * av.charWidth, 0, av.charWidth,\r
191                     getSize().height);\r
192       }\r
193     }\r
194 \r
195     // Draw the scale numbers\r
196     gg.setColor(Color.black);\r
197     int scalestartx = (startx / 10) * 10;\r
198 \r
199     FontMetrics fm = gg.getFontMetrics(av.getFont());\r
200     int y = av.charHeight - fm.getDescent();\r
201 \r
202     if (scalestartx % 10 == 0)\r
203     {\r
204       scalestartx += 5;\r
205     }\r
206 \r
207     String string;\r
208     int maxX=0;\r
209 \r
210     for (int i = scalestartx; i < endx; i += 5)\r
211     {\r
212       if (i % 10 == 0)\r
213       {\r
214         string = String.valueOf(i);\r
215         if ( (i - startx - 1) * av.charWidth > maxX)\r
216         {\r
217           gg.drawString(string,\r
218                         (i - startx - 1) * av.charWidth, y);\r
219           maxX = (i - startx + 1) * av.charWidth + fm.stringWidth(string);\r
220         }\r
221 \r
222         gg.drawLine( (int) ( (i - startx - 1) * av.charWidth + av.charWidth / 2),\r
223                     y + 2,\r
224                     (int) ( (i - startx - 1) * av.charWidth + av.charWidth / 2),\r
225                     y + fm.getDescent() * 2);\r
226       }\r
227       else\r
228       {\r
229         gg.drawLine( (int) ( (i - startx - 1) * av.charWidth + av.charWidth / 2),\r
230                     y + fm.getDescent(),\r
231                     (int) ( (i - startx - 1) * av.charWidth + av.charWidth / 2),\r
232                     y + fm.getDescent() * 2);\r
233       }\r
234 \r
235     }\r
236   }\r
237 \r
238 }\r