src/jalview/appletgui/SliderPanel.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.util.*;\r
  23 \r
  24 import java.awt.*;\r
  25 import java.awt.event.*;\r
  26 \r
  27 import jalview.datamodel.*;\r
  28 import jalview.schemes.*;\r
  29 \r
  30 public class SliderPanel extends Panel implements ActionListener, AdjustmentListener\r
  31 {\r
  32   AlignmentPanel ap;\r
  33   boolean forConservation = true;\r
  34   ColourSchemeI cs;\r
  35 \r
  36   static Frame conservationSlider;\r
  37   static Frame PIDSlider;\r
  38 \r
  39   public static int setConservationSlider(AlignmentPanel ap, ColourSchemeI cs,\r
  40                                           String source)\r
  41   {\r
  42     SliderPanel sp = null;\r
  43 \r
  44     if (conservationSlider == null)\r
  45     {\r
  46       sp = new SliderPanel(ap, cs.getConservationInc(), true, cs);\r
  47       conservationSlider = new Frame();\r
  48       conservationSlider.add(sp);\r
  49     }\r
  50     else\r
  51     {\r
  52       sp = (SliderPanel) conservationSlider.getComponent(0);\r
  53       sp.cs = cs;\r
  54     }\r
  55 \r
  56     conservationSlider.setTitle("Conservation Colour Increment  (" + source +\r
  57                                 ")");\r
  58     if (ap.av.alignment.getGroups() != null)\r
  59     {\r
  60       sp.setAllGroupsCheckEnabled(true);\r
  61     }\r
  62     else\r
  63     {\r
  64       sp.setAllGroupsCheckEnabled(false);\r
  65     }\r
  66 \r
  67     return sp.getValue();\r
  68   }\r
  69 \r
  70   public static void showConservationSlider()\r
  71   {\r
  72     try\r
  73     {\r
  74       PIDSlider.setVisible(false);\r
  75       PIDSlider = null;\r
  76     }\r
  77     catch (Exception ex)\r
  78     {}\r
  79 \r
  80     if (!conservationSlider.isVisible())\r
  81     {\r
  82       jalview.bin.JalviewLite.addFrame(conservationSlider,\r
  83                                        conservationSlider.getTitle(), 420, 100);\r
  84       conservationSlider.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
  85       {\r
  86         public void windowClosing(WindowEvent e)\r
  87         {\r
  88           conservationSlider = null;\r
  89         }\r
  90       });\r
  91 \r
  92     }\r
  93 \r
  94   }\r
  95 \r
  96   public static int setPIDSliderSource(AlignmentPanel ap, ColourSchemeI cs,\r
  97                                        String source)\r
  98   {\r
  99     SliderPanel pid = null;\r
 100     if (PIDSlider == null)\r
 101     {\r
 102       pid = new SliderPanel(ap, 50, false, cs);\r
 103       PIDSlider = new Frame();\r
 104       PIDSlider.add(pid);\r
 105     }\r
 106     else\r
 107     {\r
 108       pid = (SliderPanel) PIDSlider.getComponent(0);\r
 109       pid.cs = cs;\r
 110     }\r
 111     PIDSlider.setTitle("Percentage Identity Threshold (" + source + ")");\r
 112 \r
 113     if (ap.av.alignment.getGroups() != null)\r
 114     {\r
 115       pid.setAllGroupsCheckEnabled(true);\r
 116     }\r
 117     else\r
 118     {\r
 119       pid.setAllGroupsCheckEnabled(false);\r
 120     }\r
 121 \r
 122     return pid.getValue();\r
 123 \r
 124   }\r
 125 \r
 126   public static void showPIDSlider()\r
 127   {\r
 128     try\r
 129     {\r
 130       conservationSlider.setVisible(false);\r
 131       conservationSlider = null;\r
 132     }\r
 133     catch (Exception ex)\r
 134     {}\r
 135 \r
 136     if (!PIDSlider.isVisible())\r
 137     {\r
 138       jalview.bin.JalviewLite.addFrame(PIDSlider, PIDSlider.getTitle(), 420,\r
 139                                        100);\r
 140       PIDSlider.addWindowListener(new WindowAdapter()\r
 141       {\r
 142         public void windowClosing(WindowEvent e)\r
 143         {\r
 144           PIDSlider = null;\r
 145         }\r
 146       });\r
 147     }\r
 148 \r
 149   }\r
 150 \r
 151   public SliderPanel(AlignmentPanel ap, int value, boolean forConserve,\r
 152                      ColourSchemeI cs)\r
 153   {\r
 154     try {\r
 155         jbInit();\r
 156     } catch (Exception e) {\r
 157         e.printStackTrace();\r
 158       }\r
 159     this.ap = ap;\r
 160     this.cs = cs;\r
 161     forConservation = forConserve;\r
 162     undoButton.setVisible(false);\r
 163     applyButton.setVisible(false);\r
 164     if (forConservation)\r
 165     {\r
 166       label.setText("Modify conservation visibility");\r
 167       slider.setMinimum(0);\r
 168       slider.setMaximum(50 + slider.getVisibleAmount());\r
 169       slider.setUnitIncrement(1);\r
 170     }\r
 171     else\r
 172     {\r
 173       label.setText("Colour residues above % occurence");\r
 174       slider.setMinimum(0);\r
 175       slider.setMaximum(100 + slider.getVisibleAmount());\r
 176       slider.setBlockIncrement(1);\r
 177     }\r
 178 \r
 179     slider.addAdjustmentListener(this);\r
 180 \r
 181     slider.setValue(value);\r
 182     valueField.setText(value + "");\r
 183   }\r
 184 \r
 185   public void valueChanged(int i)\r
 186   {\r
 187     if (cs == null)\r
 188     {\r
 189       return;\r
 190     }\r
 191 \r
 192     ColourSchemeI toChange = null;\r
 193     Vector allGroups = null;\r
 194     int groupIndex = 0;\r
 195 \r
 196     if (allGroupsCheck.getState())\r
 197     {\r
 198       allGroups = ap.av.alignment.getGroups();\r
 199       groupIndex = allGroups.size() - 1;\r
 200     }\r
 201     else\r
 202     {\r
 203       toChange = cs;\r
 204     }\r
 205 \r
 206     while (groupIndex > -1)\r
 207     {\r
 208       if (allGroups != null)\r
 209       {\r
 210         toChange = ( (SequenceGroup) allGroups.elementAt(groupIndex)).cs;\r
 211       }\r
 212 \r
 213       if (forConservation)\r
 214       {\r
 215         toChange.setConservationInc(i);\r
 216       }\r
 217       else\r
 218       {\r
 219         toChange.setThreshold(i, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());\r
 220       }\r
 221 \r
 222       groupIndex--;\r
 223     }\r
 224 \r
 225     ap.seqPanel.seqCanvas.repaint();\r
 226 \r
 227   }\r
 228 \r
 229   public void setAllGroupsCheckEnabled(boolean b)\r
 230   {\r
 231     allGroupsCheck.setEnabled(b);\r
 232   }\r
 233 \r
 234   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
 235   {\r
 236     if(evt.getSource()==applyButton)\r
 237       applyButton_actionPerformed();\r
 238     else if(evt.getSource()==undoButton)\r
 239       undoButton_actionPerformed();\r
 240     else if(evt.getSource()==valueField)\r
 241       valueField_actionPerformed();\r
 242   }\r
 243 \r
 244   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)\r
 245   {\r
 246     valueField.setText(slider.getValue() + "");\r
 247     valueChanged(slider.getValue());\r
 248   }\r
 249 \r
 250 \r
 251   public void valueField_actionPerformed()\r
 252   {\r
 253     try\r
 254     {\r
 255       int i = Integer.parseInt(valueField.getText());\r
 256       slider.setValue(i);\r
 257     }\r
 258     catch (Exception ex)\r
 259     {\r
 260       valueField.setText(slider.getValue() + "");\r
 261     }\r
 262   }\r
 263 \r
 264   public void setValue(int value)\r
 265   {\r
 266     slider.setValue(value);\r
 267   }\r
 268 \r
 269   public int getValue()\r
 270   {\r
 271     return Integer.parseInt(valueField.getText());\r
 272   }\r
 273 \r
 274   // this is used for conservation colours, PID colours and redundancy threshold\r
 275   protected Scrollbar slider = new Scrollbar();\r
 276   protected TextField valueField = new TextField();\r
 277   protected Label label = new Label();\r
 278   Panel jPanel1 = new Panel();\r
 279   Panel jPanel2 = new Panel();\r
 280   protected Button applyButton = new Button();\r
 281   protected Button undoButton = new Button();\r
 282   FlowLayout flowLayout1 = new FlowLayout();\r
 283   protected Checkbox allGroupsCheck = new Checkbox();\r
 284   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();\r
 285   BorderLayout borderLayout2 = new BorderLayout();\r
 286   FlowLayout flowLayout2 = new FlowLayout();\r
 287 \r
 288   private void jbInit() throws Exception {\r
 289       this.setLayout(borderLayout2);\r
 290 \r
 291       // slider.setMajorTickSpacing(10);\r
 292       //  slider.setMinorTickSpacing(1);\r
 293       //  slider.setPaintTicks(true);\r
 294       slider.setBackground(Color.white);\r
 295       slider.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 296       slider.setOrientation(0);\r
 297       valueField.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 298       valueField.setText("      ");\r
 299       valueField.addActionListener(this);\r
 300       label.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 301       label.setText("set this label text");\r
 302       jPanel1.setLayout(borderLayout1);\r
 303       jPanel2.setLayout(flowLayout1);\r
 304       applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 305       applyButton.setLabel("Apply");\r
 306       applyButton.addActionListener(this);\r
 307       undoButton.setEnabled(false);\r
 308       undoButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 309       undoButton.setLabel("Undo");\r
 310       undoButton.addActionListener(this);\r
 311       allGroupsCheck.setEnabled(false);\r
 312       allGroupsCheck.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));\r
 313       allGroupsCheck.setLabel("Apply threshold to all groups");\r
 314       allGroupsCheck.setName("Apply to all Groups");\r
 315       this.setBackground(Color.white);\r
 316       this.setForeground(Color.black);\r
 317       jPanel2.add(label, null);\r
 318       jPanel2.add(applyButton, null);\r
 319       jPanel2.add(undoButton, null);\r
 320       jPanel2.add(allGroupsCheck);\r
 321       jPanel1.add(valueField, java.awt.BorderLayout.EAST);\r
 322       jPanel1.add(slider, java.awt.BorderLayout.CENTER);\r
 323       this.add(jPanel1, java.awt.BorderLayout.SOUTH);\r
 324       this.add(jPanel2, java.awt.BorderLayout.CENTER);\r
 325   }\r
 326 \r
 327   protected void applyButton_actionPerformed()\r
 328   {\r
 329   }\r
 330 \r
 331   protected void undoButton_actionPerformed()\r
 332   {\r
 333   }\r
 334 }\r