src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package jalview.appletgui;
  20
  21 import java.util.*;
  22
  23 import java.awt.*;
  24 import java.awt.event.*;
  25
  26 import jalview.datamodel.*;
  27 import jalview.schemes.*;
  28
  29 public class UserDefinedColours extends Panel implements ActionListener,
  30         AdjustmentListener
  31 {
  32
  33   AlignmentPanel ap;
  34
  35   SequenceGroup seqGroup;
  36
  37   Button selectedButton;
  38
  39   Vector oldColours = new Vector();
  40
  41   ColourSchemeI oldColourScheme;
  42
  43   Frame frame;
  44
  45   MCview.AppletPDBCanvas pdbcanvas;
  46
  47   AppletJmol jmol;
  48
  49   Dialog dialog;
  50
  51   Object caller;
  52
  53   String originalLabel;
  54
  55   Color originalColour;
  56
  57   int R = 0, G = 0, B = 0;
  58
  59   public ColourSchemeI loadDefaultColours()
  60   {
  61     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION
  62     return null;
  63   }
  64
  65   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)
  66   {
  67     this.ap = ap;
  68     seqGroup = sg;
  69
  70     if (seqGroup != null)
  71     {
  72       oldColourScheme = seqGroup.cs;
  73     }
  74     else
  75     {
  76       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();
  77     }
  78
  79     init();
  80   }
  81
  82   public UserDefinedColours(MCview.AppletPDBCanvas pdb)
  83   {
  84     this.pdbcanvas = pdb;
  85     init();
  86   }
  87
  88   public UserDefinedColours(AppletJmol jmol)
  89   {
  90     this.jmol = jmol;
  91     init();
  92   }
  93
  94   public UserDefinedColours(FeatureRenderer fr, Frame alignframe)
  95   {
  96     caller = fr;
  97     originalColour = fr.colourPanel.getBackground();
  98     originalLabel = "Feature Colour";
  99     setForDialog("Select Feature Colour", alignframe);
 100     setTargetColour(fr.colourPanel.getBackground());
 101     dialog.setVisible(true);
 102   }
 103
 104   public UserDefinedColours(Component caller, Color col1, Frame alignframe)
 105   {
 106     this.caller = caller;
 107     originalColour = col1;
 108     originalLabel = "Select Colour";
 109     setForDialog("Select Colour", alignframe);
 110     setTargetColour(col1);
 111     dialog.setVisible(true);
 112   }
 113
 114   public UserDefinedColours(Object caller, String label, Color colour)
 115   {
 116     this.caller = caller;
 117     originalColour = colour;
 118     originalLabel = label;
 119     init();
 120     remove(buttonPanel);
 121
 122     setTargetColour(colour);
 123
 124     okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 113, 400, 35));
 125     frame.setTitle("User Defined Colours - " + label);
 126     frame.setSize(420, 200);
 127   }
 128
 129   void setForDialog(String title, Frame alignframe)
 130   {
 131     init();
 132     frame.setVisible(false);
 133     remove(buttonPanel);
 134     dialog = new Dialog(alignframe, title, true);
 135
 136     dialog.add(this);
 137     this.setSize(400, 123);
 138     okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 35));
 139     int height = 160 + alignframe.getInsets().top + getInsets().bottom;
 140     int width = 400;
 141
 142     dialog.setBounds(alignframe.getBounds().x
 143             + (alignframe.getSize().width - width) / 2, alignframe
 144             .getBounds().y
 145             + (alignframe.getSize().height - height) / 2, width, height);
 146
 147   }
 148
 149   public void actionPerformed(ActionEvent evt)
 150   {
 151     if (evt.getSource() == okButton)
 152     {
 153       okButton_actionPerformed();
 154     }
 155     else if (evt.getSource() == applyButton)
 156     {
 157       applyButton_actionPerformed();
 158     }
 159     else if (evt.getSource() == cancelButton)
 160     {
 161       cancelButton_actionPerformed();
 162     }
 163     else if (evt.getSource() == rText)
 164     {
 165       rText_actionPerformed();
 166     }
 167     else if (evt.getSource() == gText)
 168     {
 169       gText_actionPerformed();
 170     }
 171     else if (evt.getSource() == bText)
 172     {
 173       bText_actionPerformed();
 174     }
 175   }
 176
 177   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)
 178   {
 179     if (evt.getSource() == rScroller)
 180     {
 181       rScroller_adjustmentValueChanged();
 182     }
 183     else if (evt.getSource() == gScroller)
 184     {
 185       gScroller_adjustmentValueChanged();
 186     }
 187     else if (evt.getSource() == bScroller)
 188     {
 189       bScroller_adjustmentValueChanged();
 190     }
 191   }
 192
 193   void init()
 194   {
 195     try
 196     {
 197       jbInit();
 198     } catch (Exception e)
 199     {
 200       e.printStackTrace();
 201     }
 202     frame = new Frame();
 203     frame.add(this);
 204     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420,
 205             345);
 206
 207     if (seqGroup != null)
 208     {
 209       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + seqGroup.getName() + ")");
 210     }
 211
 212     for (int i = 0; i < 20; i++)
 213     {
 214       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i])
 215               + "", ResidueProperties.aa[i]);
 216     }
 217
 218     makeButton("B", "B");
 219     makeButton("Z", "Z");
 220     makeButton("X", "X");
 221     makeButton("Gap", "'.','-',' '");
 222
 223     validate();
 224   }
 225
 226   protected void rText_actionPerformed()
 227   {
 228     try
 229     {
 230       int i = Integer.parseInt(rText.getText());
 231       rScroller.setValue(i);
 232       rScroller_adjustmentValueChanged();
 233     } catch (NumberFormatException ex)
 234     {
 235     }
 236   }
 237
 238   protected void gText_actionPerformed()
 239   {
 240     try
 241     {
 242       int i = Integer.parseInt(gText.getText());
 243       gScroller.setValue(i);
 244       gScroller_adjustmentValueChanged();
 245     } catch (NumberFormatException ex)
 246     {
 247     }
 248
 249   }
 250
 251   protected void bText_actionPerformed()
 252   {
 253     try
 254     {
 255       int i = Integer.parseInt(bText.getText());
 256       bScroller.setValue(i);
 257       bScroller_adjustmentValueChanged();
 258     } catch (NumberFormatException ex)
 259     {
 260     }
 261
 262   }
 263
 264   protected void rScroller_adjustmentValueChanged()
 265   {
 266     R = rScroller.getValue();
 267     rText.setText(R + "");
 268     colourChanged();
 269   }
 270
 271   protected void gScroller_adjustmentValueChanged()
 272   {
 273     G = gScroller.getValue();
 274     gText.setText(G + "");
 275     colourChanged();
 276   }
 277
 278   protected void bScroller_adjustmentValueChanged()
 279   {
 280     B = bScroller.getValue();
 281     bText.setText(B + "");
 282     colourChanged();
 283   }
 284
 285   public void colourChanged()
 286   {
 287     Color col = new Color(R, G, B);
 288     target.setBackground(col);
 289     target.repaint();
 290
 291     if (selectedButton != null)
 292     {
 293       selectedButton.setBackground(col);
 294       selectedButton.repaint();
 295     }
 296   }
 297
 298   void setTargetColour(Color col)
 299   {
 300     R = col.getRed();
 301     G = col.getGreen();
 302     B = col.getBlue();
 303
 304     rScroller.setValue(R);
 305     gScroller.setValue(G);
 306     bScroller.setValue(B);
 307     rText.setText(R + "");
 308     gText.setText(G + "");
 309     bText.setText(B + "");
 310     colourChanged();
 311   }
 312
 313   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)
 314   {
 315     selectedButton = (Button) e.getSource();
 316     setTargetColour(selectedButton.getBackground());
 317   }
 318
 319   void makeButton(String label, String aa)
 320   {
 321     final Button button = new Button();
 322     Color col = Color.white;
 323
 324     try
 325     {
 326       col = oldColourScheme.findColour(aa.charAt(0), -1);
 327     } catch (Exception ex)
 328     {
 329     }
 330
 331     button.setBackground(col);
 332     oldColours.addElement(col);
 333     button.setLabel(label);
 334     button.setForeground(col.darker().darker().darker());
 335     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));
 336     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()
 337     {
 338       public void mousePressed(MouseEvent e)
 339       {
 340         colourButtonPressed(e);
 341       }
 342     });
 343
 344     buttonPanel.add(button, null);
 345   }
 346
 347   protected void okButton_actionPerformed()
 348   {
 349     applyButton_actionPerformed();
 350     if (dialog != null)
 351       dialog.setVisible(false);
 352
 353     frame.setVisible(false);
 354   }
 355
 356   public Color getColor()
 357   {
 358     return new Color(R, G, B);
 359   }
 360
 361   protected void applyButton_actionPerformed()
 362   {
 363     if (caller != null)
 364     {
 365       if (caller instanceof FeatureSettings)
 366       {
 367         ((FeatureSettings) caller).setUserColour(originalLabel, getColor());
 368       }
 369       else if (caller instanceof AnnotationColourChooser)
 370       {
 371         if (originalLabel.equals("Min Colour"))
 372         {
 373           ((AnnotationColourChooser) caller)
 374                   .minColour_actionPerformed(getColor());
 375         }
 376         else
 377         {
 378           ((AnnotationColourChooser) caller)
 379                   .maxColour_actionPerformed(getColor());
 380         }
 381       }
 382       else if (caller instanceof FeatureRenderer)
 383       {
 384         ((FeatureRenderer) caller).colourPanel.setBackground(getColor());
 385       }
 386
 387       return;
 388     }
 389
 390     Color[] newColours = new Color[24];
 391     for (int i = 0; i < 24; i++)
 392     {
 393       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);
 394       newColours[i] = button.getBackground();
 395     }
 396
 397     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);
 398     if (ap != null)
 399     {
 400       ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());
 401     }
 402
 403     if (ap != null)
 404     {
 405       if (seqGroup != null)
 406       {
 407         seqGroup.cs = ucs;
 408       }
 409       else
 410       {
 411         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);
 412       }
 413       ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;
 414       ap.paintAlignment(true);
 415     }
 416     else if (jmol != null)
 417     {
 418       jmol.setJalviewColourScheme(ucs);
 419     }
 420     else if (pdbcanvas != null)
 421     {
 422       pdbcanvas.setColours(ucs);
 423     }
 424   }
 425
 426   protected void cancelButton_actionPerformed()
 427   {
 428     if (caller != null)
 429     {
 430       if (caller instanceof FeatureSettings)
 431       {
 432         ((FeatureSettings) caller).setUserColour(originalLabel,
 433                 originalColour);
 434       }
 435       else if (caller instanceof AnnotationColourChooser)
 436       {
 437         if (originalLabel.equals("Min Colour"))
 438         {
 439           ((AnnotationColourChooser) caller)
 440                   .minColour_actionPerformed(originalColour);
 441         }
 442         else
 443         {
 444           ((AnnotationColourChooser) caller)
 445                   .maxColour_actionPerformed(originalColour);
 446         }
 447       }
 448       else if (caller instanceof FeatureRenderer)
 449       {
 450         ((FeatureRenderer) caller).colourPanel
 451                 .setBackground(originalColour);
 452
 453       }
 454
 455       if (dialog != null)
 456         dialog.setVisible(false);
 457
 458       frame.setVisible(false);
 459       return;
 460     }
 461
 462     Color[] newColours = new Color[24];
 463     for (int i = 0; i < 24; i++)
 464     {
 465       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);
 466       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);
 467     }
 468
 469     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);
 470
 471     if (ap != null)
 472     {
 473       if (seqGroup != null)
 474       {
 475         seqGroup.cs = ucs;
 476       }
 477       else
 478       {
 479         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);
 480       }
 481       ap.paintAlignment(true);
 482     }
 483     else if (jmol != null)
 484     {
 485       jmol.setJalviewColourScheme(ucs);
 486     }
 487     else if (pdbcanvas != null)
 488     {
 489       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);
 490     }
 491
 492     frame.setVisible(false);
 493   }
 494
 495   protected Panel buttonPanel = new Panel();
 496
 497   protected GridLayout gridLayout = new GridLayout();
 498
 499   Panel okcancelPanel = new Panel();
 500
 501   protected Button okButton = new Button();
 502
 503   protected Button applyButton = new Button();
 504
 505   protected Button cancelButton = new Button();
 506
 507   protected Scrollbar rScroller = new Scrollbar();
 508
 509   Label label1 = new Label();
 510
 511   protected TextField rText = new TextField();
 512
 513   Label label4 = new Label();
 514
 515   protected Scrollbar gScroller = new Scrollbar();
 516
 517   protected TextField gText = new TextField();
 518
 519   Label label5 = new Label();
 520
 521   protected Scrollbar bScroller = new Scrollbar();
 522
 523   protected TextField bText = new TextField();
 524
 525   protected Panel target = new Panel();
 526
 527   private void jbInit() throws Exception
 528   {
 529     this.setLayout(null);
 530     buttonPanel.setLayout(gridLayout);
 531     gridLayout.setColumns(6);
 532     gridLayout.setRows(4);
 533     okButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 534     okButton.setLabel("OK");
 535     okButton.addActionListener(this);
 536     applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 537     applyButton.setLabel("Apply");
 538     applyButton.addActionListener(this);
 539     cancelButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 540     cancelButton.setLabel("Cancel");
 541     cancelButton.addActionListener(this);
 542     this.setBackground(new Color(212, 208, 223));
 543     okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 265, 400, 35));
 544     buttonPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 142));
 545     rScroller.setMaximum(256);
 546     rScroller.setMinimum(0);
 547     rScroller.setOrientation(0);
 548     rScroller.setUnitIncrement(1);
 549     rScroller.setVisibleAmount(1);
 550     rScroller.setBounds(new Rectangle(36, 27, 119, 19));
 551     rScroller.addAdjustmentListener(this);
 552     label1.setAlignment(Label.RIGHT);
 553     label1.setText("R");
 554     label1.setBounds(new Rectangle(19, 30, 16, 15));
 555     rText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));
 556     rText.setText("0        ");
 557     rText.setBounds(new Rectangle(156, 27, 53, 19));
 558     rText.addActionListener(this);
 559     label4.setAlignment(Label.RIGHT);
 560     label4.setText("G");
 561     label4.setBounds(new Rectangle(15, 56, 20, 15));
 562     gScroller.setMaximum(256);
 563     gScroller.setMinimum(0);
 564     gScroller.setOrientation(0);
 565     gScroller.setUnitIncrement(1);
 566     gScroller.setVisibleAmount(1);
 567     gScroller.setBounds(new Rectangle(35, 52, 120, 20));
 568     gScroller.addAdjustmentListener(this);
 569     gText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));
 570     gText.setText("0        ");
 571     gText.setBounds(new Rectangle(156, 52, 53, 20));
 572     gText.addActionListener(this);
 573     label5.setAlignment(Label.RIGHT);
 574     label5.setText("B");
 575     label5.setBounds(new Rectangle(14, 82, 20, 15));
 576     bScroller.setMaximum(256);
 577     bScroller.setMinimum(0);
 578     bScroller.setOrientation(0);
 579     bScroller.setUnitIncrement(1);
 580     bScroller.setVisibleAmount(1);
 581     bScroller.setBounds(new Rectangle(35, 78, 120, 20));
 582     bScroller.addAdjustmentListener(this);
 583     bText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));
 584     bText.setText("0        ");
 585     bText.setBounds(new Rectangle(157, 78, 52, 20));
 586     bText.addActionListener(this);
 587     target.setBackground(Color.black);
 588     target.setBounds(new Rectangle(229, 26, 134, 79));
 589     this.add(okcancelPanel, null);
 590     okcancelPanel.add(okButton, null);
 591     okcancelPanel.add(applyButton, null);
 592     okcancelPanel.add(cancelButton, null);
 593     this.add(buttonPanel, null);
 594     this.add(target, null);
 595     this.add(gScroller);
 596     this.add(rScroller);
 597     this.add(bScroller);
 598     this.add(label5);
 599     this.add(label4);
 600     this.add(label1);
 601     this.add(gText);
 602     this.add(rText);
 603     this.add(bText);
 604   }
 605
 606 }