src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
   3  * Copyright (C) 2006 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19
  20 package jalview.appletgui;
  21
  22 import java.util.*;
  23
  24 import java.awt.*;
  25 import java.awt.event.*;
  26
  27 import jalview.datamodel.*;
  28 import jalview.schemes.*;
  29
  30 public class UserDefinedColours
  31     extends Panel implements ActionListener, AdjustmentListener
  32 {
  33
  34   AlignmentPanel ap;
  35   SequenceGroup seqGroup;
  36   Button selectedButton;
  37   Vector oldColours = new Vector();
  38   ColourSchemeI oldColourScheme;
  39   Frame frame;
  40   MCview.AppletPDBCanvas pdbcanvas;
  41
  42   Component caller;
  43   String originalLabel;
  44   Color originalColour;
  45
  46   int R = 0, G = 0, B = 0;
  47
  48   public ColourSchemeI loadDefaultColours()
  49   {
  50     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION
  51     return null;
  52   }
  53
  54   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)
  55   {
  56     this.ap = ap;
  57     seqGroup = sg;
  58
  59     if (seqGroup != null)
  60     {
  61       oldColourScheme = seqGroup.cs;
  62     }
  63     else
  64     {
  65       oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();
  66     }
  67
  68     init();
  69   }
  70
  71   public UserDefinedColours(MCview.AppletPDBCanvas pdb)
  72   {
  73     this.pdbcanvas = pdb;
  74     init();
  75   }
  76
  77   public UserDefinedColours(Component caller,
  78                             String label,
  79                             Color colour)
  80   {
  81     this.caller = caller;
  82     originalColour = colour;
  83     originalLabel = label;
  84     init();
  85     remove(buttonPanel);
  86
  87     setTargetColour(colour);
  88
  89     okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 113, 400, 35));
  90     frame.setTitle("User Defined Colours - "+label);
  91     frame.setSize(420, 200);
  92   }
  93
  94   public void actionPerformed(ActionEvent evt)
  95   {
  96     if(evt.getSource()==okButton)
  97      okButton_actionPerformed();
  98    else if(evt.getSource()==applyButton)
  99       applyButton_actionPerformed();
 100    else if(evt.getSource()==cancelButton)
 101      cancelButton_actionPerformed();
 102    else if(evt.getSource()==rText)
 103      rText_actionPerformed();
 104    else if (evt.getSource() == gText)
 105      gText_actionPerformed();
 106    else if (evt.getSource() == bText)
 107      bText_actionPerformed();
 108 }
 109
 110   public void adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent evt)
 111   {
 112     if(evt.getSource()==rScroller)
 113     rScroller_adjustmentValueChanged();
 114   else if(evt.getSource()==gScroller)
 115     gScroller_adjustmentValueChanged();
 116   else if(evt.getSource()==bScroller)
 117     bScroller_adjustmentValueChanged();
 118 }
 119
 120   void init()
 121   {
 122     try
 123     {
 124       jbInit();
 125     }
 126     catch (Exception e)
 127     {
 128       e.printStackTrace();
 129     }
 130     frame = new Frame();
 131     frame.add(this);
 132     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420, 345);
 133
 134     if (seqGroup != null)
 135     {
 136       frame.setTitle(frame.getTitle() + " (" + seqGroup.getName() + ")");
 137     }
 138
 139     for (int i = 0; i < 20; i++)
 140     {
 141       makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +
 142                  "", ResidueProperties.aa[i]);
 143     }
 144
 145     makeButton("B", "B");
 146     makeButton("Z", "Z");
 147     makeButton("X", "X");
 148     makeButton("Gap", "'.','-',' '");
 149
 150     validate();
 151   }
 152   protected void rText_actionPerformed()
 153   {
 154     try
 155     {
 156       int i = Integer.parseInt(rText.getText());
 157       rScroller.setValue(i);
 158       rScroller_adjustmentValueChanged();
 159     }
 160     catch (NumberFormatException ex)
 161     {}
 162   }
 163
 164   protected void gText_actionPerformed()
 165   {
 166     try
 167     {
 168       int i = Integer.parseInt(gText.getText());
 169       gScroller.setValue(i);
 170       gScroller_adjustmentValueChanged();
 171     }
 172     catch (NumberFormatException ex)
 173     {}
 174
 175   }
 176
 177   protected void bText_actionPerformed()
 178   {
 179     try
 180     {
 181       int i = Integer.parseInt(bText.getText());
 182       bScroller.setValue(i);
 183       bScroller_adjustmentValueChanged();
 184     }
 185     catch (NumberFormatException ex)
 186     {}
 187
 188   }
 189
 190   protected void rScroller_adjustmentValueChanged()
 191   {
 192     R = rScroller.getValue();
 193     rText.setText(R + "");
 194     colourChanged();
 195   }
 196
 197   protected void gScroller_adjustmentValueChanged()
 198   {
 199     G = gScroller.getValue();
 200     gText.setText(G + "");
 201     colourChanged();
 202   }
 203
 204   protected void bScroller_adjustmentValueChanged()
 205   {
 206     B = bScroller.getValue();
 207     bText.setText(B + "");
 208     colourChanged();
 209   }
 210
 211   public void colourChanged()
 212   {
 213     Color col = new Color(R, G, B);
 214     target.setBackground(col);
 215     target.repaint();
 216
 217     if (selectedButton != null)
 218     {
 219       selectedButton.setBackground(col);
 220       selectedButton.repaint();
 221     }
 222   }
 223
 224   void setTargetColour(Color col)
 225   {
 226     R = col.getRed();
 227     G = col.getGreen();
 228     B = col.getBlue();
 229     rScroller.setValue(R);
 230     gScroller.setValue(G);
 231     bScroller.setValue(B);
 232     rText.setText(R + "");
 233     gText.setText(G + "");
 234     bText.setText(B + "");
 235     colourChanged();
 236   }
 237
 238   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)
 239   {
 240     selectedButton = (Button) e.getSource();
 241     setTargetColour(selectedButton.getBackground());
 242   }
 243
 244   void makeButton(String label, String aa)
 245   {
 246     final Button button = new Button();
 247     Color col = Color.white;
 248
 249     try
 250     {
 251       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);
 252     }
 253     catch (Exception ex)
 254     {}
 255
 256     button.setBackground(col);
 257     oldColours.addElement(col);
 258     button.setLabel(label);
 259     button.setForeground(col.darker().darker().darker());
 260     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));
 261     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()
 262     {
 263       public void mousePressed(MouseEvent e)
 264       {
 265         colourButtonPressed(e);
 266       }
 267     });
 268
 269     buttonPanel.add(button, null);
 270   }
 271
 272   protected void okButton_actionPerformed()
 273   {
 274     applyButton_actionPerformed();
 275     frame.setVisible(false);
 276   }
 277
 278   protected void applyButton_actionPerformed()
 279   {
 280     if (caller != null)
 281     {
 282       if(caller instanceof FeatureSettings)
 283         ((FeatureSettings)caller).setUserColour
 284             (originalLabel, new Color(R,G,B));
 285       else if(caller instanceof AnnotationColourChooser)
 286       {
 287         if (originalLabel.equals("Min Colour"))
 288           ( (AnnotationColourChooser) caller).minColour_actionPerformed
 289               (new Color(R, G, B));
 290         else
 291           ( (AnnotationColourChooser) caller).maxColour_actionPerformed
 292               (new Color(R, G, B));
 293       }
 294       return;
 295     }
 296
 297
 298     Color[] newColours = new Color[24];
 299     for (int i = 0; i < 24; i++)
 300     {
 301       Button button = (Button) buttonPanel.getComponent(i);
 302       newColours[i] = button.getBackground();
 303     }
 304
 305     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);
 306     if(ap!=null)
 307       ucs.setThreshold(0, ap.av.getIgnoreGapsConsensus());
 308
 309     if(ap!=null)
 310     {
 311       if (seqGroup != null)
 312       {
 313         seqGroup.cs = ucs;
 314       }
 315       else
 316       {
 317         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);
 318       }
 319       ap.seqPanel.seqCanvas.img = null;
 320       ap.repaint();
 321     }
 322     else if(pdbcanvas!=null)
 323     {
 324       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);
 325       pdbcanvas.updateSeqColours();
 326     }
 327   }
 328
 329
 330   protected void cancelButton_actionPerformed()
 331   {
 332     if (caller != null)
 333     {
 334       if(caller instanceof FeatureSettings)
 335         ((FeatureSettings)caller).setUserColour
 336             (originalLabel, originalColour);
 337       else if (caller instanceof AnnotationColourChooser)
 338       {
 339         if (originalLabel.equals("Min Colour"))
 340           ( (AnnotationColourChooser) caller).minColour_actionPerformed
 341               (originalColour);
 342         else
 343           ( (AnnotationColourChooser) caller).maxColour_actionPerformed
 344               (originalColour);
 345       }
 346       frame.setVisible(false);
 347       return;
 348     }
 349
 350     Color[] newColours = new Color[24];
 351     for (int i = 0; i < 24; i++)
 352     {
 353       newColours[i] = (Color) oldColours.elementAt(i);
 354       buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);
 355     }
 356
 357     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme(newColours);
 358
 359    if(ap!=null)
 360     {
 361       if (seqGroup != null)
 362       {
 363         seqGroup.cs = ucs;
 364       }
 365       else
 366       {
 367         ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);
 368       }
 369       ap.repaint();
 370     }
 371     else if(pdbcanvas!=null)
 372     {
 373       pdbcanvas.pdb.setColours(ucs);
 374     }
 375
 376     frame.setVisible(false);
 377   }
 378
 379
 380   protected Panel buttonPanel = new Panel();
 381   protected GridLayout gridLayout = new GridLayout();
 382   Panel okcancelPanel = new Panel();
 383   protected Button okButton = new Button();
 384   protected Button applyButton = new Button();
 385   protected Button cancelButton = new Button();
 386   protected Scrollbar rScroller = new Scrollbar();
 387   Label label1 = new Label();
 388   protected TextField rText = new TextField();
 389   Label label4 = new Label();
 390   protected Scrollbar gScroller = new Scrollbar();
 391   protected TextField gText = new TextField();
 392   Label label5 = new Label();
 393   protected Scrollbar bScroller = new Scrollbar();
 394   protected TextField bText = new TextField();
 395   protected Panel target = new Panel();
 396
 397   private void jbInit() throws Exception {
 398       this.setLayout(null);
 399       buttonPanel.setLayout(gridLayout);
 400       gridLayout.setColumns(6);
 401       gridLayout.setRows(4);
 402       okButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 403       okButton.setLabel("OK");
 404       okButton.addActionListener(this);
 405       applyButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 406       applyButton.setLabel("Apply");
 407       applyButton.addActionListener(this);
 408       cancelButton.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 0, 11));
 409       cancelButton.setLabel("Cancel");
 410       cancelButton.addActionListener(this);
 411       this.setBackground(new Color(212, 208, 223));
 412       okcancelPanel.setBounds(new Rectangle(0, 265, 400, 35));
 413       buttonPanel.setBounds(new Rectangle(0, 123, 400, 142));
 414       rScroller.setMaximum(256);
 415       rScroller.setMinimum(0);
 416       rScroller.setOrientation(0);
 417       rScroller.setUnitIncrement(1);
 418   rScroller.setVisibleAmount(1);
 419   rScroller.setBounds(new Rectangle(36, 27, 119, 19));
 420   rScroller.addAdjustmentListener(this);
 421   label1.setAlignment(Label.RIGHT);
 422   label1.setText("R");
 423   label1.setBounds(new Rectangle(19, 30, 16, 15));
 424   rText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));
 425   rText.setText("0        ");
 426   rText.setBounds(new Rectangle(156, 27, 53, 19));
 427   rText.addActionListener(this);
 428   label4.setAlignment(Label.RIGHT);
 429   label4.setText("G");
 430   label4.setBounds(new Rectangle(15, 56, 20, 15));
 431   gScroller.setMaximum(256);
 432       gScroller.setMinimum(0);
 433       gScroller.setOrientation(0);
 434       gScroller.setUnitIncrement(1);
 435   gScroller.setVisibleAmount(1);
 436   gScroller.setBounds(new Rectangle(35, 52, 120, 20));
 437   gScroller.addAdjustmentListener(this);
 438   gText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));
 439   gText.setText("0        ");
 440   gText.setBounds(new Rectangle(156, 52, 53, 20));
 441   gText.addActionListener(this);
 442   label5.setAlignment(Label.RIGHT);
 443   label5.setText("B");
 444   label5.setBounds(new Rectangle(14, 82, 20, 15));
 445   bScroller.setMaximum(256);
 446       bScroller.setMinimum(0);
 447       bScroller.setOrientation(0);
 448       bScroller.setUnitIncrement(1);
 449   bScroller.setVisibleAmount(1);
 450   bScroller.setBounds(new Rectangle(35, 78, 120, 20));
 451   bScroller.addAdjustmentListener(this);
 452   bText.setFont(new java.awt.Font("Dialog", Font.PLAIN, 10));
 453   bText.setText("0        ");
 454   bText.setBounds(new Rectangle(157, 78, 52, 20));
 455   bText.addActionListener(this);
 456   target.setBackground(Color.black);
 457       target.setBounds(new Rectangle(229, 26, 134, 79));
 458       this.add(okcancelPanel, null);
 459       okcancelPanel.add(okButton, null);
 460       okcancelPanel.add(applyButton, null);
 461       okcancelPanel.add(cancelButton, null);
 462       this.add(buttonPanel, null);
 463   this.add(target, null);
 464   this.add(gScroller);
 465   this.add(rScroller);
 466   this.add(bScroller);
 467   this.add(label5);
 468   this.add(label4);
 469   this.add(label1);
 470   this.add(gText);
 471   this.add(rText);
 472   this.add(bText);
 473 }
 474
 475 }